RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611205.4

CDKN3-211, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CDKN3, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3-211ENST00000611205 CUL7Q14999 1698 aa42.73■■■■■ 4.43
CDKN3-211ENST00000611205 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.72■■■■■ 4.43
CDKN3-211ENST00000611205 IGF1RP08069 1367 aa42.7■■■■■ 4.43
CDKN3-211ENST00000611205 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.62■■■■■ 4.41
CDKN3-211ENST00000611205 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
CDKN3-211ENST00000611205 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.54■■■■■ 4.4
CDKN3-211ENST00000611205 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.53■■■■■ 4.4
CDKN3-211ENST00000611205 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.46■■■■■ 4.39
CDKN3-211ENST00000611205 MAPKBP1O60336 1514 aa42.45■■■■■ 4.39
CDKN3-211ENST00000611205 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.42■■■■■ 4.38
CDKN3-211ENST00000611205 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.41■■■■■ 4.38
CDKN3-211ENST00000611205 DIP2BQ9P265 1576 aa42.36■■■■■ 4.37
CDKN3-211ENST00000611205 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
CDKN3-211ENST00000611205 PTPRGP23470 1445 aa42.27■■■■■ 4.36
CDKN3-211ENST00000611205 IQGAP2Q13576 1575 aa42.26■■■■■ 4.36
CDKN3-211ENST00000611205 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.23■■■■■ 4.35
CDKN3-211ENST00000611205 TSPOAP1O95153 1857 aa42.19■■■■■ 4.35
CDKN3-211ENST00000611205 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.18■■■■■ 4.34
CDKN3-211ENST00000611205 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.07■■■■■ 4.33
CDKN3-211ENST00000611205 ABCC2Q92887 1545 aa42.06■■■■■ 4.32
CDKN3-211ENST00000611205 KDM6BO15054 1643 aa42.06■■■■■ 4.32
CDKN3-211ENST00000611205 DISP1Q96F81 1524 aa42.02■■■■■ 4.32
CDKN3-211ENST00000611205 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.95■■■■■ 4.31
CDKN3-211ENST00000611205 UACAQ9BZF9 1416 aa41.95■■■■■ 4.31
CDKN3-211ENST00000611205 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.94■■■■■ 4.3
CDKN3-211ENST00000611205 ASXL2Q76L83 1435 aa41.94■■■■■ 4.3
CDKN3-211ENST00000611205 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.9■■■■■ 4.3
CDKN3-211ENST00000611205 KIAA0556O60303 1618 aa41.89■■■■■ 4.3
CDKN3-211ENST00000611205 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.85■■■■■ 4.29
CDKN3-211ENST00000611205 GLI2P10070 1586 aa41.83■■■■■ 4.29
CDKN3-211ENST00000611205 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
CDKN3-211ENST00000611205 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
CDKN3-211ENST00000611205 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.77■■■■■ 4.28
CDKN3-211ENST00000611205 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
CDKN3-211ENST00000611205 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.64■■■■■ 4.26
CDKN3-211ENST00000611205 GOLGA3Q08378 1498 aa41.6■■■■■ 4.25
CDKN3-211ENST00000611205 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.6■■■■■ 4.25
CDKN3-211ENST00000611205 PRXQ9BXM0 1461 aa41.57■■■■■ 4.25
CDKN3-211ENST00000611205 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.51■■■■■ 4.24
CDKN3-211ENST00000611205 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.5■■■■■ 4.23
CDKN3-211ENST00000611205 ABCA8O94911 1581 aa41.48■■■■■ 4.23
CDKN3-211ENST00000611205 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
CDKN3-211ENST00000611205 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.34■■■■■ 4.21
CDKN3-211ENST00000611205 KCNH8Q96L42 1107 aa41.33■■■■■ 4.21
CDKN3-211ENST00000611205 ADGRL1O94910 1474 aa41.29■■■■■ 4.2
CDKN3-211ENST00000611205 P3H3Q8IVL6 736 aa41.28■■■■■ 4.2
CDKN3-211ENST00000611205 CD109Q6YHK3 1445 aa41.27■■■■■ 4.2
CDKN3-211ENST00000611205 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
CDKN3-211ENST00000611205 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.24■■■■■ 4.19
CDKN3-211ENST00000611205 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.23■■■■■ 4.19
CDKN3-211ENST00000611205 ARID3CA6NKF2 412 aa41.21■■■■■ 4.19
CDKN3-211ENST00000611205 SAMD9Q5K651 1589 aa41.16■■■■■ 4.18
CDKN3-211ENST00000611205 ATP10BO94823 1461 aa41.11■■■■■ 4.17
CDKN3-211ENST00000611205 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.07■■■■■ 4.16
CDKN3-211ENST00000611205 EEA1Q15075 1411 aa41.04■■■■■ 4.16
CDKN3-211ENST00000611205 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
CDKN3-211ENST00000611205 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.96■■■■■ 4.15
CDKN3-211ENST00000611205 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
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CDKN3-211ENST00000611205 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.9■■■■■ 4.14
CDKN3-211ENST00000611205 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.88■■■■■ 4.13
CDKN3-211ENST00000611205 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
CDKN3-211ENST00000611205 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.78■■■■■ 4.12
CDKN3-211ENST00000611205 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.77■■■■■ 4.12
CDKN3-211ENST00000611205 NEO1Q92859 1461 aa40.73■■■■■ 4.11
CDKN3-211ENST00000611205 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.71■■■■■ 4.11
CDKN3-211ENST00000611205 RAPGEF3O95398 923 aa40.69■■■■■ 4.1
CDKN3-211ENST00000611205 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.65■■■■■ 4.1
CDKN3-211ENST00000611205 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.61■■■■■ 4.09
CDKN3-211ENST00000611205 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.58■■■■■ 4.09
CDKN3-211ENST00000611205 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.53■■■■■ 4.08
CDKN3-211ENST00000611205 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.52■■■■■ 4.08
CDKN3-211ENST00000611205 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.5■■■■■ 4.07
CDKN3-211ENST00000611205 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.5■■■■■ 4.07
CDKN3-211ENST00000611205 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
CDKN3-211ENST00000611205 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
CDKN3-211ENST00000611205 RICTORQ6R327 1708 aa40.48■■■■■ 4.07
CDKN3-211ENST00000611205 FANCAO15360 1455 aa40.47■■■■■ 4.07
CDKN3-211ENST00000611205 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
CDKN3-211ENST00000611205 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
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CDKN3-211ENST00000611205 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.45■■■■■ 4.07
CDKN3-211ENST00000611205 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
CDKN3-211ENST00000611205 PTPRMP28827 1452 aa40.42■■■■■ 4.06
CDKN3-211ENST00000611205 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.41■■■■■ 4.06
CDKN3-211ENST00000611205 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
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CDKN3-211ENST00000611205 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.37■■■■■ 4.05
CDKN3-211ENST00000611205 HECW1Q76N89 1606 aa40.37■■■■■ 4.05
CDKN3-211ENST00000611205 FMN1Q68DA7 1419 aa40.34■■■■■ 4.05
CDKN3-211ENST00000611205 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.33■■■■■ 4.05
CDKN3-211ENST00000611205 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.27■■■■■ 4.04
CDKN3-211ENST00000611205 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
CDKN3-211ENST00000611205 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.24■■■■■ 4.03
CDKN3-211ENST00000611205 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.24■■■■■ 4.03
CDKN3-211ENST00000611205 PLCH2O75038 1416 aa40.23■■■■■ 4.03
CDKN3-211ENST00000611205 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.19■■■■■ 4.02
CDKN3-211ENST00000611205 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.18■■■■■ 4.02
CDKN3-211ENST00000611205 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
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