RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610454.4

SENP3-209, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-209ENST00000610454 JPH4Q96JJ6 628 aa22.63■■□□□ 1.21
SENP3-209ENST00000610454 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SENP3-209ENST00000610454 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.62■■□□□ 1.21
SENP3-209ENST00000610454 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.59■■□□□ 1.21
SENP3-209ENST00000610454 IQGAP2Q13576 1575 aa22.52■■□□□ 1.2
SENP3-209ENST00000610454 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SENP3-209ENST00000610454 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
SENP3-209ENST00000610454 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.43■■□□□ 1.18
SENP3-209ENST00000610454 EEA1Q15075 1411 aa22.43■■□□□ 1.18
SENP3-209ENST00000610454 PRXQ9BXM0 1461 aa22.41■■□□□ 1.18
SENP3-209ENST00000610454 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.39■■□□□ 1.17
SENP3-209ENST00000610454 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.35■■□□□ 1.17
SENP3-209ENST00000610454 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.35■■□□□ 1.17
SENP3-209ENST00000610454 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.35■■□□□ 1.17
SENP3-209ENST00000610454 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SENP3-209ENST00000610454 PTPRGP23470 1445 aa22.34■■□□□ 1.17
SENP3-209ENST00000610454 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
SENP3-209ENST00000610454 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SENP3-209ENST00000610454 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.3■■□□□ 1.16
SENP3-209ENST00000610454 DISP1Q96F81 1524 aa22.3■■□□□ 1.16
SENP3-209ENST00000610454 KIAA0556O60303 1618 aa22.28■■□□□ 1.16
SENP3-209ENST00000610454 GOLGA3Q08378 1498 aa22.27■■□□□ 1.16
SENP3-209ENST00000610454 MAPKBP1O60336 1514 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-209ENST00000610454 KIF21BO75037 1637 aa22.2■■□□□ 1.14
SENP3-209ENST00000610454 UACAQ9BZF9 1416 aa22.18■■□□□ 1.14
SENP3-209ENST00000610454 ABCC2Q92887 1545 aa22.16■■□□□ 1.14
SENP3-209ENST00000610454 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.15■■□□□ 1.14
SENP3-209ENST00000610454 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.14■■□□□ 1.13
SENP3-209ENST00000610454 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.09■■□□□ 1.13
SENP3-209ENST00000610454 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.08■■□□□ 1.13
SENP3-209ENST00000610454 DIP2BQ9P265 1576 aa22.08■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 SAMD9Q5K651 1589 aa22.07■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 P3H3Q8IVL6 736 aa22.06■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.06■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.06■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.05■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 ASXL2Q76L83 1435 aa22.03■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 ABCA8O94911 1581 aa22.03■■□□□ 1.12
SENP3-209ENST00000610454 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.99■■□□□ 1.11
SENP3-209ENST00000610454 TSPOAP1O95153 1857 aa21.95■■□□□ 1.1
SENP3-209ENST00000610454 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.94■■□□□ 1.1
SENP3-209ENST00000610454 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.93■■□□□ 1.1
SENP3-209ENST00000610454 GLI2P10070 1586 aa21.91■■□□□ 1.1
SENP3-209ENST00000610454 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.91■■□□□ 1.1
SENP3-209ENST00000610454 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SENP3-209ENST00000610454 ARID3CA6NKF2 412 aa21.88■■□□□ 1.09
SENP3-209ENST00000610454 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SENP3-209ENST00000610454 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SENP3-209ENST00000610454 ATP10BO94823 1461 aa21.83■■□□□ 1.08
SENP3-209ENST00000610454 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.82■■□□□ 1.08
SENP3-209ENST00000610454 KDM6BO15054 1643 aa21.81■■□□□ 1.08
SENP3-209ENST00000610454 KCNH8Q96L42 1107 aa21.81■■□□□ 1.08
SENP3-209ENST00000610454 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SENP3-209ENST00000610454 FMN1Q68DA7 1419 aa21.79■■□□□ 1.08
SENP3-209ENST00000610454 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.78■■□□□ 1.08
SENP3-209ENST00000610454 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.78■■□□□ 1.08
SENP3-209ENST00000610454 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SENP3-209ENST00000610454 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.77■■□□□ 1.08
SENP3-209ENST00000610454 CD109Q6YHK3 1445 aa21.72■■□□□ 1.07
SENP3-209ENST00000610454 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SENP3-209ENST00000610454 HECW1Q76N89 1606 aa21.72■■□□□ 1.07
SENP3-209ENST00000610454 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.68■■□□□ 1.06
SENP3-209ENST00000610454 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.67■■□□□ 1.06
SENP3-209ENST00000610454 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.66■■□□□ 1.06
SENP3-209ENST00000610454 CLIP1P30622 1438 aa21.65■■□□□ 1.06
SENP3-209ENST00000610454 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SENP3-209ENST00000610454 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SENP3-209ENST00000610454 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SENP3-209ENST00000610454 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.55■■□□□ 1.04
SENP3-209ENST00000610454 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.54■■□□□ 1.04
SENP3-209ENST00000610454 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SENP3-209ENST00000610454 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.53■■□□□ 1.04
SENP3-209ENST00000610454 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.52■■□□□ 1.04
SENP3-209ENST00000610454 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.52■■□□□ 1.04
SENP3-209ENST00000610454 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
SENP3-209ENST00000610454 CEP162Q5TB80 1403 aa21.51■■□□□ 1.03
SENP3-209ENST00000610454 NEO1Q92859 1461 aa21.51■■□□□ 1.03
SENP3-209ENST00000610454 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-209ENST00000610454 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-209ENST00000610454 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SENP3-209ENST00000610454 KIF14Q15058 1648 aa21.5■■□□□ 1.03
SENP3-209ENST00000610454 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.49■■□□□ 1.03
SENP3-209ENST00000610454 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SENP3-209ENST00000610454 FANCAO15360 1455 aa21.45■■□□□ 1.02
SENP3-209ENST00000610454 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.44■■□□□ 1.02
SENP3-209ENST00000610454 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.44■■□□□ 1.02
SENP3-209ENST00000610454 PLCH2O75038 1416 aa21.39■■□□□ 1.02
SENP3-209ENST00000610454 AKNAQ7Z591 1439 aa21.39■■□□□ 1.02
SENP3-209ENST00000610454 RAPGEF3O95398 923 aa21.36■■□□□ 1.01
SENP3-209ENST00000610454 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SENP3-209ENST00000610454 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.34■■□□□ 1.01
SENP3-209ENST00000610454 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.34■■□□□ 1.01
SENP3-209ENST00000610454 ADGRL1O94910 1474 aa21.33■■□□□ 1.01
SENP3-209ENST00000610454 RICTORQ6R327 1708 aa21.32■■□□□ 1
SENP3-209ENST00000610454 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.32■■□□□ 1
SENP3-209ENST00000610454 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.31■■□□□ 1
SENP3-209ENST00000610454 PREX2Q70Z35 1606 aa21.29■■□□□ 1
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