RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609445.5

SGMS1-209, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-209ENST00000609445 JPH4Q96JJ6 628 aa27.91■■■□□ 2.06
SGMS1-209ENST00000609445 CUL7Q14999 1698 aa27.87■■■□□ 2.05
SGMS1-209ENST00000609445 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.77■■■□□ 2.04
SGMS1-209ENST00000609445 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.73■■■□□ 2.03
SGMS1-209ENST00000609445 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.65■■■□□ 2.02
SGMS1-209ENST00000609445 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.63■■■□□ 2.01
SGMS1-209ENST00000609445 IQGAP2Q13576 1575 aa27.55■■■□□ 2
SGMS1-209ENST00000609445 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
SGMS1-209ENST00000609445 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
SGMS1-209ENST00000609445 MAPKBP1O60336 1514 aa27.51■■■□□ 2
SGMS1-209ENST00000609445 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.5■■□□□ 1.99
SGMS1-209ENST00000609445 PTPRGP23470 1445 aa27.5■■□□□ 1.99
SGMS1-209ENST00000609445 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.48■■□□□ 1.99
SGMS1-209ENST00000609445 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.48■■□□□ 1.99
SGMS1-209ENST00000609445 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.46■■□□□ 1.99
SGMS1-209ENST00000609445 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.46■■□□□ 1.99
SGMS1-209ENST00000609445 DIP2BQ9P265 1576 aa27.45■■□□□ 1.99
SGMS1-209ENST00000609445 DISP1Q96F81 1524 aa27.41■■□□□ 1.98
SGMS1-209ENST00000609445 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-209ENST00000609445 ABCC2Q92887 1545 aa27.34■■□□□ 1.97
SGMS1-209ENST00000609445 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.32■■□□□ 1.96
SGMS1-209ENST00000609445 TSPOAP1O95153 1857 aa27.32■■□□□ 1.96
SGMS1-209ENST00000609445 KIAA0556O60303 1618 aa27.31■■□□□ 1.96
SGMS1-209ENST00000609445 UACAQ9BZF9 1416 aa27.3■■□□□ 1.96
SGMS1-209ENST00000609445 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.29■■□□□ 1.96
SGMS1-209ENST00000609445 PRXQ9BXM0 1461 aa27.25■■□□□ 1.95
SGMS1-209ENST00000609445 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
SGMS1-209ENST00000609445 ASXL2Q76L83 1435 aa27.24■■□□□ 1.95
SGMS1-209ENST00000609445 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.2■■□□□ 1.95
SGMS1-209ENST00000609445 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.18■■□□□ 1.94
SGMS1-209ENST00000609445 KDM6BO15054 1643 aa27.18■■□□□ 1.94
SGMS1-209ENST00000609445 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SGMS1-209ENST00000609445 GLI2P10070 1586 aa27.14■■□□□ 1.93
SGMS1-209ENST00000609445 GOLGA3Q08378 1498 aa27.13■■□□□ 1.93
SGMS1-209ENST00000609445 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SGMS1-209ENST00000609445 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SGMS1-209ENST00000609445 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.06■■□□□ 1.92
SGMS1-209ENST00000609445 ABCA8O94911 1581 aa27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-209ENST00000609445 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.02■■□□□ 1.92
SGMS1-209ENST00000609445 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.99■■□□□ 1.91
SGMS1-209ENST00000609445 P3H3Q8IVL6 736 aa26.98■■□□□ 1.91
SGMS1-209ENST00000609445 EEA1Q15075 1411 aa26.94■■□□□ 1.9
SGMS1-209ENST00000609445 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-209ENST00000609445 SAMD9Q5K651 1589 aa26.92■■□□□ 1.9
SGMS1-209ENST00000609445 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SGMS1-209ENST00000609445 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.89■■□□□ 1.9
SGMS1-209ENST00000609445 ARID3CA6NKF2 412 aa26.88■■□□□ 1.89
SGMS1-209ENST00000609445 KCNH8Q96L42 1107 aa26.88■■□□□ 1.89
SGMS1-209ENST00000609445 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.85■■□□□ 1.89
SGMS1-209ENST00000609445 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.84■■□□□ 1.89
SGMS1-209ENST00000609445 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SGMS1-209ENST00000609445 ATP10BO94823 1461 aa26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-209ENST00000609445 CD109Q6YHK3 1445 aa26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-209ENST00000609445 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.79■■□□□ 1.88
SGMS1-209ENST00000609445 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.78■■□□□ 1.88
SGMS1-209ENST00000609445 KIF21BO75037 1637 aa26.77■■□□□ 1.88
SGMS1-209ENST00000609445 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.75■■□□□ 1.87
SGMS1-209ENST00000609445 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.71■■□□□ 1.87
SGMS1-209ENST00000609445 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SGMS1-209ENST00000609445 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.68■■□□□ 1.86
SGMS1-209ENST00000609445 ADGRL1O94910 1474 aa26.68■■□□□ 1.86
SGMS1-209ENST00000609445 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.65■■□□□ 1.86
SGMS1-209ENST00000609445 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SGMS1-209ENST00000609445 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SGMS1-209ENST00000609445 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.63■■□□□ 1.85
SGMS1-209ENST00000609445 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SGMS1-209ENST00000609445 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.55■■□□□ 1.84
SGMS1-209ENST00000609445 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.49■■□□□ 1.83
SGMS1-209ENST00000609445 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SGMS1-209ENST00000609445 NEO1Q92859 1461 aa26.47■■□□□ 1.83
SGMS1-209ENST00000609445 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-209ENST00000609445 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-209ENST00000609445 RAPGEF3O95398 923 aa26.44■■□□□ 1.82
SGMS1-209ENST00000609445 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.827e-9■■■□□ 17.9
SGMS1-209ENST00000609445 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-209ENST00000609445 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-209ENST00000609445 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-209ENST00000609445 FMN1Q68DA7 1419 aa26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-209ENST00000609445 HECW1Q76N89 1606 aa26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-209ENST00000609445 FANCAO15360 1455 aa26.34■■□□□ 1.81
SGMS1-209ENST00000609445 AKNAQ7Z591 1439 aa26.33■■□□□ 1.81
SGMS1-209ENST00000609445 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.33■■□□□ 1.8
SGMS1-209ENST00000609445 RICTORQ6R327 1708 aa26.32■■□□□ 1.8
SGMS1-209ENST00000609445 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SGMS1-209ENST00000609445 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.28■■□□□ 1.8
SGMS1-209ENST00000609445 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.28■■□□□ 1.8
SGMS1-209ENST00000609445 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.25■■□□□ 1.79
SGMS1-209ENST00000609445 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.24■■□□□ 1.79
SGMS1-209ENST00000609445 KIF14Q15058 1648 aa26.23■■□□□ 1.79
SGMS1-209ENST00000609445 PLCH2O75038 1416 aa26.22■■□□□ 1.79
SGMS1-209ENST00000609445 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.22■■□□□ 1.79
SGMS1-209ENST00000609445 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.21■■□□□ 1.79
SGMS1-209ENST00000609445 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SGMS1-209ENST00000609445 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-209ENST00000609445 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-209ENST00000609445 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-209ENST00000609445 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SGMS1-209ENST00000609445 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.16■■□□□ 1.78
SGMS1-209ENST00000609445 MADDQ8WXG6 1647 aa26.16■■□□□ 1.78
SGMS1-209ENST00000609445 PTPRMP28827 1452 aa26.16■■□□□ 1.78
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