RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608879.1

SYT6-204, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 5

Gene SYT6, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-204ENST00000608879 JPH4Q96JJ6 628 aa42.57■■■■■ 4.41
SYT6-204ENST00000608879 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
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SYT6-204ENST00000608879 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
SYT6-204ENST00000608879 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.26■■■■■ 4.36
SYT6-204ENST00000608879 IQGAP2Q13576 1575 aa42.18■■■■■ 4.34
SYT6-204ENST00000608879 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.06■■■■■ 4.32
SYT6-204ENST00000608879 PRXQ9BXM0 1461 aa41.98■■■■■ 4.31
SYT6-204ENST00000608879 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.97■■■■■ 4.31
SYT6-204ENST00000608879 PTPRGP23470 1445 aa41.96■■■■■ 4.31
SYT6-204ENST00000608879 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.95■■■■■ 4.31
SYT6-204ENST00000608879 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.3
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SYT6-204ENST00000608879 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.9■■■■■ 4.3
SYT6-204ENST00000608879 DISP1Q96F81 1524 aa41.9■■■■■ 4.3
SYT6-204ENST00000608879 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
SYT6-204ENST00000608879 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.82■■■■■ 4.29
SYT6-204ENST00000608879 MAPKBP1O60336 1514 aa41.79■■■■■ 4.28
SYT6-204ENST00000608879 EEA1Q15075 1411 aa41.78■■■■■ 4.28
SYT6-204ENST00000608879 KIAA0556O60303 1618 aa41.77■■■■■ 4.28
SYT6-204ENST00000608879 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.75■■■■■ 4.27
SYT6-204ENST00000608879 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.67■■■■■ 4.26
SYT6-204ENST00000608879 UACAQ9BZF9 1416 aa41.67■■■■■ 4.26
SYT6-204ENST00000608879 GOLGA3Q08378 1498 aa41.66■■■■■ 4.26
SYT6-204ENST00000608879 ABCC2Q92887 1545 aa41.66■■■■■ 4.26
SYT6-204ENST00000608879 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.66■■■■■ 4.26
SYT6-204ENST00000608879 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.62■■■■■ 4.25
SYT6-204ENST00000608879 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.59■■■■■ 4.25
SYT6-204ENST00000608879 DIP2BQ9P265 1576 aa41.59■■■■■ 4.25
SYT6-204ENST00000608879 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
SYT6-204ENST00000608879 ASXL2Q76L83 1435 aa41.45■■■■■ 4.23
SYT6-204ENST00000608879 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.45■■■■■ 4.23
SYT6-204ENST00000608879 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.44■■■■■ 4.22
SYT6-204ENST00000608879 KIF21BO75037 1637 aa41.39■■■■■ 4.22
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SYT6-204ENST00000608879 P3H3Q8IVL6 736 aa41.32■■■■■ 4.21
SYT6-204ENST00000608879 SAMD9Q5K651 1589 aa41.32■■■■■ 4.2
SYT6-204ENST00000608879 TSPOAP1O95153 1857 aa41.29■■■■■ 4.2
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SYT6-204ENST00000608879 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.16■■■■■ 4.18
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SYT6-204ENST00000608879 KDM6BO15054 1643 aa41.07■■■■■ 4.17
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SYT6-204ENST00000608879 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.06■■■■■ 4.16
SYT6-204ENST00000608879 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
SYT6-204ENST00000608879 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.05■■■■■ 4.16
SYT6-204ENST00000608879 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.04■■■■■ 4.16
SYT6-204ENST00000608879 ARID3CA6NKF2 412 aa41.01■■■■■ 4.16
SYT6-204ENST00000608879 ATP10BO94823 1461 aa41■■■■■ 4.15
SYT6-204ENST00000608879 KCNH8Q96L42 1107 aa40.95■■■■■ 4.15
SYT6-204ENST00000608879 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.93■■■■■ 4.14
SYT6-204ENST00000608879 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
SYT6-204ENST00000608879 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.87■■■■■ 4.13
SYT6-204ENST00000608879 CD109Q6YHK3 1445 aa40.84■■■■■ 4.13
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SYT6-204ENST00000608879 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.76■■■■■ 4.12
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SYT6-204ENST00000608879 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
SYT6-204ENST00000608879 FMN1Q68DA7 1419 aa40.68■■■■■ 4.1
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SYT6-204ENST00000608879 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.44■■■■■ 4.06
SYT6-204ENST00000608879 NEO1Q92859 1461 aa40.4■■■■■ 4.06
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SYT6-204ENST00000608879 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.29■■■■■ 4.04
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SYT6-204ENST00000608879 PLCH2O75038 1416 aa40.15■■■■■ 4.02
SYT6-204ENST00000608879 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.14■■■■■ 4.02
SYT6-204ENST00000608879 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
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SYT6-204ENST00000608879 RICTORQ6R327 1708 aa40.06■■■■■ 4
SYT6-204ENST00000608879 CEP162Q5TB80 1403 aa40.05■■■■■ 4
SYT6-204ENST00000608879 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.01■■■■■ 4
SYT6-204ENST00000608879 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.95■■■■□ 3.99
SYT6-204ENST00000608879 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.95■■■■□ 3.99
SYT6-204ENST00000608879 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.92■■■■□ 3.98
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