RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TIAM1Q13009 1591 aa27.88■■■□□ 2.05
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 P3H3Q8IVL6 736 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.77■■■□□ 2.04
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 FMN1Q68DA7 1419 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.72■■■□□ 2.03
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 SAMD9Q5K651 1589 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PBRM1Q86U86 1689 aa27.62■■■□□ 2.01
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.58■■■□□ 2.01
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADAMTS12P58397 1594 aa27.55■■■□□ 2
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERCC6Q03468 1493 aa27.47■■□□□ 1.99
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.4■■□□□ 1.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.39■■□□□ 1.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.3■■□□□ 1.96
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HECW1Q76N89 1606 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCOA2Q15596 1464 aa27.27■■□□□ 1.96
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTPRKQ15262 1439 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEP170Q5SW79 1584 aa27.03■■□□□ 1.92
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBLN2P98095 1184 aa27.01■■□□□ 1.91
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NAIPQ13075 1403 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.97■■□□□ 1.91
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 MIER1Q8N108 512 aa26.92■■□□□ 1.9
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEUROD1Q13562 356 aa26.91■■□□□ 1.9
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.8■■□□□ 1.88
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ROCK1Q13464 1354 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DAPK1P53355 1430 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TONSLQ96HA7 1378 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCA8O94911 1581 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCC5O15440 1437 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM52Q96A61 297 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
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