RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603546.1

GNAS-256, Transcript of GNAS complex locus, human

TSL 5

Gene GNAS, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNAS-256	ENST00000603546	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		47.22	■■■■■ 5.15
GNAS-256	ENST00000603546	CUL7	Q14999	1698 aa		47.19	■■■■■ 5.14
GNAS-256	ENST00000603546	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		47.11	■■■■■ 5.13
GNAS-256	ENST00000603546	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		47.07	■■■■■ 5.13
GNAS-256	ENST00000603546	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	46.83	■■■■■ 5.09
GNAS-256	ENST00000603546	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		46.69	■■■■■ 5.07
GNAS-256	ENST00000603546	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		46.67	■■■■■ 5.06
GNAS-256	ENST00000603546	PTPRG	P23470	1445 aa		46.65	■■■■■ 5.06
GNAS-256	ENST00000603546	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		46.65	■■■■■ 5.06
GNAS-256	ENST00000603546	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		46.63	■■■■■ 5.06
GNAS-256	ENST00000603546	IQGAP2	Q13576	1575 aa		46.63	■■■■■ 5.06
GNAS-256	ENST00000603546	MAPKBP1	O60336	1514 aa		46.63	■■■■■ 5.05
GNAS-256	ENST00000603546	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		46.59	■■■■■ 5.05
GNAS-256	ENST00000603546	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		46.58	■■■■■ 5.05
GNAS-256	ENST00000603546	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		46.58	■■■■■ 5.05
GNAS-256	ENST00000603546	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	46.51	■■■■■ 5.04
GNAS-256	ENST00000603546	DISP1	Q96F81	1524 aa		46.42	■■■■■ 5.02
GNAS-256	ENST00000603546	DIP2B	Q9P265	1576 aa		46.4	■■■■■ 5.02
GNAS-256	ENST00000603546	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		46.38	■■■■■ 5.01
GNAS-256	ENST00000603546	ABCC2	Q92887	1545 aa		46.33	■■■■■ 5.01
GNAS-256	ENST00000603546	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		46.3	■■■■■ 5
GNAS-256	ENST00000603546	UACA	Q9BZF9	1416 aa		46.29	■■■■■ 5
GNAS-256	ENST00000603546	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	46.22	■■■■■ 4.99
GNAS-256	ENST00000603546	PRX	Q9BXM0	1461 aa		46.21	■■■■■ 4.99
GNAS-256	ENST00000603546	KIAA0556	O60303	1618 aa		46.19	■■■■■ 4.98
GNAS-256	ENST00000603546	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		46.15	■■■■■ 4.98
GNAS-256	ENST00000603546	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		46.15	■■■■■ 4.98
GNAS-256	ENST00000603546	ASXL2	Q76L83	1435 aa		46.15	■■■■■ 4.98
GNAS-256	ENST00000603546	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		46.08	■■■■■ 4.97
GNAS-256	ENST00000603546	TSPOAP1	O95153	1857 aa		46.06	■■■■■ 4.96
GNAS-256	ENST00000603546	GOLGA3	Q08378	1498 aa		46.06	■■■■■ 4.96
GNAS-256	ENST00000603546	GLI2	P10070	1586 aa		46	■■■■■ 4.95
GNAS-256	ENST00000603546	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		45.99	■■■■■ 4.95
GNAS-256	ENST00000603546	KDM6B	O15054	1643 aa		45.95	■■■■■ 4.95
GNAS-256	ENST00000603546	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	45.92	■■■■■ 4.94
GNAS-256	ENST00000603546	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	45.87	■■■■■ 4.93
GNAS-256	ENST00000603546	EEA1	Q15075	1411 aa		45.79	■■■■■ 4.92
GNAS-256	ENST00000603546	ABCA8	O94911	1581 aa		45.79	■■■■■ 4.92
GNAS-256	ENST00000603546	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	45.79	■■■■■ 4.92
GNAS-256	ENST00000603546	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	45.75	■■■■■ 4.91
GNAS-256	ENST00000603546	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		45.73	■■■■■ 4.91
GNAS-256	ENST00000603546	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		45.7	■■■■■ 4.91
GNAS-256	ENST00000603546	P3H3	Q8IVL6	736 aa		45.69	■■■■■ 4.9
GNAS-256	ENST00000603546	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		45.62	■■■■■ 4.89
GNAS-256	ENST00000603546	KCNH8	Q96L42	1107 aa		45.57	■■■■■ 4.89
GNAS-256	ENST00000603546	SAMD9	Q5K651	1589 aa		45.54	■■■■■ 4.88
GNAS-256	ENST00000603546	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	45.53	■■■■■ 4.88
GNAS-256	ENST00000603546	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		45.48	■■■■■ 4.87
GNAS-256	ENST00000603546	CD109	Q6YHK3	1445 aa		45.47	■■■■■ 4.87
GNAS-256	ENST00000603546	ATP10B	O94823	1461 aa		45.46	■■■■■ 4.87
GNAS-256	ENST00000603546	ARID3C	A6NKF2	412 aa		45.43	■■■■■ 4.86
GNAS-256	ENST00000603546	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		45.42	■■■■■ 4.86
GNAS-256	ENST00000603546	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		45.41	■■■■■ 4.86
GNAS-256	ENST00000603546	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	45.38	■■■■■ 4.86
GNAS-256	ENST00000603546	KIF21B	O75037	1637 aa		45.34	■■■■■ 4.85
GNAS-256	ENST00000603546	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		45.32	■■■■■ 4.85
GNAS-256	ENST00000603546	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		45.32	■■■■■ 4.85
GNAS-256	ENST00000603546	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		45.26	■■■■■ 4.84
GNAS-256	ENST00000603546	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	45.22	■■■■■ 4.83
GNAS-256	ENST00000603546	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	45.22	■■■■■ 4.83
GNAS-256	ENST00000603546	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	45.17	■■■■■ 4.82
GNAS-256	ENST00000603546	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		45.16	■■■■■ 4.82
GNAS-256	ENST00000603546	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		45.12	■■■■■ 4.81
GNAS-256	ENST00000603546	ADGRL1	O94910	1474 aa		45.1	■■■■■ 4.81
GNAS-256	ENST00000603546	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	45.09	■■■■■ 4.81
GNAS-256	ENST00000603546	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		45.06	■■■■■ 4.8
GNAS-256	ENST00000603546	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		45.06	■■■■■ 4.8
GNAS-256	ENST00000603546	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		45.04	■■■■■ 4.8
GNAS-256	ENST00000603546	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		45.03	■■■■■ 4.8
GNAS-256	ENST00000603546	NEO1	Q92859	1461 aa		44.91	■■■■■ 4.78
GNAS-256	ENST00000603546	RAPGEF3	O95398	923 aa		44.81	■■■■■ 4.76
GNAS-256	ENST00000603546	FMN1	Q68DA7	1419 aa		44.8	■■■■■ 4.76
GNAS-256	ENST00000603546	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		44.79	■■■■■ 4.76
GNAS-256	ENST00000603546	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	44.73	■■■■■ 4.75
GNAS-256	ENST00000603546	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	44.72	■■■■■ 4.75	2e-19	■□□□□ 8.8
GNAS-256	ENST00000603546	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	44.71	■■■■■ 4.75
GNAS-256	ENST00000603546	AKNA	Q7Z591	1439 aa		44.65	■■■■■ 4.74
GNAS-256	ENST00000603546	FANCA	O15360	1455 aa		44.63	■■■■■ 4.73
GNAS-256	ENST00000603546	HECW1	Q76N89	1606 aa		44.63	■■■■■ 4.73
GNAS-256	ENST00000603546	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	44.61	■■■■■ 4.73
GNAS-256	ENST00000603546	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		44.6	■■■■■ 4.73
GNAS-256	ENST00000603546	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		44.6	■■■■■ 4.73
GNAS-256	ENST00000603546	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	44.59	■■■■■ 4.73
GNAS-256	ENST00000603546	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		44.57	■■■■■ 4.73
GNAS-256	ENST00000603546	PLCH2	O75038	1416 aa		44.51	■■■■■ 4.72
GNAS-256	ENST00000603546	RICTOR	Q6R327	1708 aa		44.48	■■■■■ 4.71
GNAS-256	ENST00000603546	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	44.41	■■■■■ 4.7
GNAS-256	ENST00000603546	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	44.4	■■■■■ 4.7
GNAS-256	ENST00000603546	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		44.39	■■■■■ 4.7
GNAS-256	ENST00000603546	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		44.38	■■■■■ 4.7
GNAS-256	ENST00000603546	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		44.38	■■■■■ 4.69
GNAS-256	ENST00000603546	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		44.35	■■■■■ 4.69
GNAS-256	ENST00000603546	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		44.35	■■■■■ 4.69
GNAS-256	ENST00000603546	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		44.34	■■■■■ 4.69
GNAS-256	ENST00000603546	CLIP1	P30622	1438 aa		44.33	■■■■■ 4.69
GNAS-256	ENST00000603546	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		44.33	■■■■■ 4.69
GNAS-256	ENST00000603546	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		44.33	■■■■■ 4.69
GNAS-256	ENST00000603546	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		44.31	■■■■■ 4.68
GNAS-256	ENST00000603546	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		44.31	■■■■■ 4.68
GNAS-256	ENST00000603546	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		44.31	■■■■■ 4.68

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