RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 NUP160Q12769 1436 aa24.55■■□□□ 1.52
FCHO1-235ENST00000601247 CEP170Q5SW79 1584 aa24.54■■□□□ 1.52
FCHO1-235ENST00000601247 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.52■■□□□ 1.52
FCHO1-235ENST00000601247 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
FCHO1-235ENST00000601247 OSCARQ8IYS5 282 aa24.5■■□□□ 1.51
FCHO1-235ENST00000601247 IQGAP2Q13576 1575 aa24.5■■□□□ 1.51
FCHO1-235ENST00000601247 CEP162Q5TB80 1403 aa24.43■■□□□ 1.5
FCHO1-235ENST00000601247 CLIP1P30622 1438 aa24.41■■□□□ 1.5
FCHO1-235ENST00000601247 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.38■■□□□ 1.49
FCHO1-235ENST00000601247 JPH4Q96JJ6 628 aa24.37■■□□□ 1.49
FCHO1-235ENST00000601247 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-235ENST00000601247 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.34■■□□□ 1.49
FCHO1-235ENST00000601247 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.33■■□□□ 1.49
FCHO1-235ENST00000601247 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
FCHO1-235ENST00000601247 P3H3Q8IVL6 736 aa24.27■■□□□ 1.48
FCHO1-235ENST00000601247 SHROOM2Q13796 1616 aa24.27■■□□□ 1.48
FCHO1-235ENST00000601247 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.26■■□□□ 1.47
FCHO1-235ENST00000601247 SAMD9Q5K651 1589 aa24.26■■□□□ 1.47
FCHO1-235ENST00000601247 KIAA0556O60303 1618 aa24.23■■□□□ 1.47
FCHO1-235ENST00000601247 DISP1Q96F81 1524 aa24.21■■□□□ 1.47
FCHO1-235ENST00000601247 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.2■■□□□ 1.46
FCHO1-235ENST00000601247 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
FCHO1-235ENST00000601247 ARAP1Q96P48 1450 aa24.16■■□□□ 1.46
FCHO1-235ENST00000601247 FMN1Q68DA7 1419 aa24.14■■□□□ 1.45
FCHO1-235ENST00000601247 PTPRGP23470 1445 aa24.1■■□□□ 1.45
FCHO1-235ENST00000601247 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.09■■□□□ 1.45
FCHO1-235ENST00000601247 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.09■■□□□ 1.45
FCHO1-235ENST00000601247 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FCHO1-235ENST00000601247 ARHGEF11O15085 1522 aa24.04■■□□□ 1.44
FCHO1-235ENST00000601247 APLP2Q06481 763 aa24■■□□□ 1.43
FCHO1-235ENST00000601247 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.97■■□□□ 1.43
FCHO1-235ENST00000601247 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.97■■□□□ 1.43
FCHO1-235ENST00000601247 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-235ENST00000601247 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-235ENST00000601247 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-235ENST00000601247 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
FCHO1-235ENST00000601247 HECW1Q76N89 1606 aa23.95■■□□□ 1.42
FCHO1-235ENST00000601247 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.95■■□□□ 1.42
FCHO1-235ENST00000601247 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.93■■□□□ 1.42
FCHO1-235ENST00000601247 UACAQ9BZF9 1416 aa23.93■■□□□ 1.42
FCHO1-235ENST00000601247 ABCA8O94911 1581 aa23.9■■□□□ 1.42
FCHO1-235ENST00000601247 ABCC2Q92887 1545 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-235ENST00000601247 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-235ENST00000601247 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-235ENST00000601247 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.86■■□□□ 1.41
FCHO1-235ENST00000601247 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.84■■□□□ 1.41
FCHO1-235ENST00000601247 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-235ENST00000601247 ARID3CA6NKF2 412 aa23.83■■□□□ 1.41
FCHO1-235ENST00000601247 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-235ENST00000601247 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-235ENST00000601247 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-235ENST00000601247 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
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FCHO1-235ENST00000601247 MAP3K1Q13233 1512 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-235ENST00000601247 TIAM1Q13009 1591 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-235ENST00000601247 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-235ENST00000601247 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-235ENST00000601247 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-235ENST00000601247 ATP10BO94823 1461 aa23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-235ENST00000601247 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.7■■□□□ 1.39
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FCHO1-235ENST00000601247 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-235ENST00000601247 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-235ENST00000601247 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-235ENST00000601247 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-235ENST00000601247 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-235ENST00000601247 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.64■■□□□ 1.37
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FCHO1-235ENST00000601247 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
FCHO1-235ENST00000601247 ASXL2Q76L83 1435 aa23.55■■□□□ 1.36
FCHO1-235ENST00000601247 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-235ENST00000601247 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-235ENST00000601247 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.54■■□□□ 1.36
FCHO1-235ENST00000601247 KIF14Q15058 1648 aa23.53■■□□□ 1.36
FCHO1-235ENST00000601247 KCNH8Q96L42 1107 aa23.52■■□□□ 1.36
FCHO1-235ENST00000601247 MAPKBP1O60336 1514 aa23.5■■□□□ 1.35
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FCHO1-235ENST00000601247 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
FCHO1-235ENST00000601247 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.36■■□□□ 1.33
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FCHO1-235ENST00000601247 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.35■■□□□ 1.33
FCHO1-235ENST00000601247 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.33■■□□□ 1.33
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FCHO1-235ENST00000601247 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.32■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.3■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 GLI2P10070 1586 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 MIA2Q96PC5 1412 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 DIP2BQ9P265 1576 aa23.29■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.28■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 CD109Q6YHK3 1445 aa23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
FCHO1-235ENST00000601247 PREX2Q70Z35 1606 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-235ENST00000601247 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-235ENST00000601247 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
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