RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595304.1

ZNF428-202, Transcript of zinc finger protein 428, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF428, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428-202ENST00000595304 JPH4Q96JJ6 628 aa41.66■■■■■ 4.26
ZNF428-202ENST00000595304 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
ZNF428-202ENST00000595304 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.56■■■■■ 4.24
ZNF428-202ENST00000595304 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.49■■■■■ 4.23
ZNF428-202ENST00000595304 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.32■■■■■ 4.21
ZNF428-202ENST00000595304 IQGAP2Q13576 1575 aa41.29■■■■■ 4.2
ZNF428-202ENST00000595304 PRXQ9BXM0 1461 aa41.28■■■■■ 4.2
ZNF428-202ENST00000595304 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
ZNF428-202ENST00000595304 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.25■■■■■ 4.19
ZNF428-202ENST00000595304 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
ZNF428-202ENST00000595304 EEA1Q15075 1411 aa41.14■■■■■ 4.18
ZNF428-202ENST00000595304 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.14■■■■■ 4.18
ZNF428-202ENST00000595304 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
ZNF428-202ENST00000595304 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.07■■■■■ 4.16
ZNF428-202ENST00000595304 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.05■■■■■ 4.16
ZNF428-202ENST00000595304 PTPRGP23470 1445 aa41.05■■■■■ 4.16
ZNF428-202ENST00000595304 DISP1Q96F81 1524 aa41.04■■■■■ 4.16
ZNF428-202ENST00000595304 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.03■■■■■ 4.16
ZNF428-202ENST00000595304 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.95■■■■■ 4.15
ZNF428-202ENST00000595304 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.92■■■■■ 4.14
ZNF428-202ENST00000595304 KIAA0556O60303 1618 aa40.9■■■■■ 4.14
ZNF428-202ENST00000595304 GOLGA3Q08378 1498 aa40.8■■■■■ 4.12
ZNF428-202ENST00000595304 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.75■■■■■ 4.11
ZNF428-202ENST00000595304 UACAQ9BZF9 1416 aa40.75■■■■■ 4.11
ZNF428-202ENST00000595304 KIF21BO75037 1637 aa40.75■■■■■ 4.11
ZNF428-202ENST00000595304 P3H3Q8IVL6 736 aa40.69■■■■■ 4.1
ZNF428-202ENST00000595304 MAPKBP1O60336 1514 aa40.68■■■■■ 4.1
ZNF428-202ENST00000595304 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
ZNF428-202ENST00000595304 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.67■■■■■ 4.1
ZNF428-202ENST00000595304 ABCC2Q92887 1545 aa40.67■■■■■ 4.1
ZNF428-202ENST00000595304 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.6■■■■■ 4.09
ZNF428-202ENST00000595304 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.58■■■■■ 4.09
ZNF428-202ENST00000595304 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.58■■■■■ 4.09
ZNF428-202ENST00000595304 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.57■■■■■ 4.08
ZNF428-202ENST00000595304 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
ZNF428-202ENST00000595304 SAMD9Q5K651 1589 aa40.53■■■■■ 4.08
ZNF428-202ENST00000595304 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.49■■■■■ 4.07
ZNF428-202ENST00000595304 DIP2BQ9P265 1576 aa40.48■■■■■ 4.07
ZNF428-202ENST00000595304 ASXL2Q76L83 1435 aa40.48■■■■■ 4.07
ZNF428-202ENST00000595304 ABCA8O94911 1581 aa40.47■■■■■ 4.07
ZNF428-202ENST00000595304 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
ZNF428-202ENST00000595304 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.38■■■■■ 4.05
ZNF428-202ENST00000595304 ARID3CA6NKF2 412 aa40.33■■■■■ 4.05
ZNF428-202ENST00000595304 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.29■■■■■ 4.04
ZNF428-202ENST00000595304 TSPOAP1O95153 1857 aa40.25■■■■■ 4.03
ZNF428-202ENST00000595304 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.22■■■■■ 4.03
ZNF428-202ENST00000595304 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
ZNF428-202ENST00000595304 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.2■■■■■ 4.03
ZNF428-202ENST00000595304 GLI2P10070 1586 aa40.18■■■■■ 4.02
ZNF428-202ENST00000595304 ATP10BO94823 1461 aa40.18■■■■■ 4.02
ZNF428-202ENST00000595304 KCNH8Q96L42 1107 aa40.15■■■■■ 4.02
ZNF428-202ENST00000595304 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.13■■■■■ 4.01
ZNF428-202ENST00000595304 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
ZNF428-202ENST00000595304 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
ZNF428-202ENST00000595304 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
ZNF428-202ENST00000595304 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.02■■■■■ 4
ZNF428-202ENST00000595304 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
ZNF428-202ENST00000595304 FMN1Q68DA7 1419 aa39.96■■■■□ 3.99
ZNF428-202ENST00000595304 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
ZNF428-202ENST00000595304 KDM6BO15054 1643 aa39.92■■■■□ 3.98
ZNF428-202ENST00000595304 CD109Q6YHK3 1445 aa39.9■■■■□ 3.98
ZNF428-202ENST00000595304 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.86■■■■□ 3.97
ZNF428-202ENST00000595304 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.85■■■■□ 3.97
ZNF428-202ENST00000595304 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.84■■■■□ 3.97
ZNF428-202ENST00000595304 CLIP1P30622 1438 aa39.83■■■■□ 3.97
ZNF428-202ENST00000595304 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
ZNF428-202ENST00000595304 HECW1Q76N89 1606 aa39.79■■■■□ 3.96
ZNF428-202ENST00000595304 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.77■■■■□ 3.96
ZNF428-202ENST00000595304 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.73■■■■□ 3.95
ZNF428-202ENST00000595304 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
ZNF428-202ENST00000595304 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.71■■■■□ 3.95
ZNF428-202ENST00000595304 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
ZNF428-202ENST00000595304 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.64■■■■□ 3.94
ZNF428-202ENST00000595304 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
ZNF428-202ENST00000595304 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.6■■■■□ 3.93
ZNF428-202ENST00000595304 CEP162Q5TB80 1403 aa39.59■■■■□ 3.93
ZNF428-202ENST00000595304 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.55■■■■□ 3.92
ZNF428-202ENST00000595304 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.5■■■■□ 3.91
ZNF428-202ENST00000595304 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.5■■■■□ 3.91
ZNF428-202ENST00000595304 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.47■■■■□ 3.91
ZNF428-202ENST00000595304 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
ZNF428-202ENST00000595304 NEO1Q92859 1461 aa39.43■■■■□ 3.9
ZNF428-202ENST00000595304 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.43■■■■□ 3.9
ZNF428-202ENST00000595304 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.43■■■■□ 3.9
ZNF428-202ENST00000595304 KIF14Q15058 1648 aa39.4■■■■□ 3.9
ZNF428-202ENST00000595304 FANCAO15360 1455 aa39.36■■■■□ 3.89
ZNF428-202ENST00000595304 RAPGEF3O95398 923 aa39.34■■■■□ 3.89
ZNF428-202ENST00000595304 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
ZNF428-202ENST00000595304 PLCH2O75038 1416 aa39.32■■■■□ 3.89
ZNF428-202ENST00000595304 AKNAQ7Z591 1439 aa39.31■■■■□ 3.88
ZNF428-202ENST00000595304 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.27■■■■□ 3.88
ZNF428-202ENST00000595304 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.26■■■■□ 3.87
ZNF428-202ENST00000595304 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.21■■■■□ 3.87
ZNF428-202ENST00000595304 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
ZNF428-202ENST00000595304 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.19■■■■□ 3.86
ZNF428-202ENST00000595304 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.18■■■■□ 3.86
ZNF428-202ENST00000595304 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.15■■■■□ 3.86
ZNF428-202ENST00000595304 ADGRL1O94910 1474 aa39.14■■■■□ 3.86
ZNF428-202ENST00000595304 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.12■■■■□ 3.85
ZNF428-202ENST00000595304 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.12■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.7 ms