RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593908.5

NFKB2-208, Transcript of nuclear factor kappa B subunit 2, human

TSL 4

Gene NFKB2, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFKB2-208	ENST00000593908	SHROOM2	Q13796	1616 aa		34.41	■■■■□ 3.1
NFKB2-208	ENST00000593908	JPH4	Q96JJ6	628 aa		34.31	■■■■□ 3.08
NFKB2-208	ENST00000593908	IGF1R	P08069	1367 aa		34.28	■■■■□ 3.08
NFKB2-208	ENST00000593908	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	34.27	■■■■□ 3.08
NFKB2-208	ENST00000593908	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		34.25	■■■■□ 3.07
NFKB2-208	ENST00000593908	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		34.09	■■■■□ 3.05
NFKB2-208	ENST00000593908	KIF21B	O75037	1637 aa		34.03	■■■■□ 3.04
NFKB2-208	ENST00000593908	CUL7	Q14999	1698 aa		34.03	■■■■□ 3.04
NFKB2-208	ENST00000593908	PRX	Q9BXM0	1461 aa		34.01	■■■■□ 3.03
NFKB2-208	ENST00000593908	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.99	■■■■□ 3.03
NFKB2-208	ENST00000593908	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.95	■■■■□ 3.03
NFKB2-208	ENST00000593908	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.94	■■■■□ 3.02
NFKB2-208	ENST00000593908	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.93	■■■■□ 3.02
NFKB2-208	ENST00000593908	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.88	■■■■□ 3.01
NFKB2-208	ENST00000593908	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.84	■■■■□ 3.01
NFKB2-208	ENST00000593908	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.81	■■■■□ 3
NFKB2-208	ENST00000593908	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.79	■■■■□ 3
NFKB2-208	ENST00000593908	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.79	■■■■□ 3
NFKB2-208	ENST00000593908	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.79	■■■■□ 3
NFKB2-208	ENST00000593908	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
NFKB2-208	ENST00000593908	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.75	■■■□□ 2.99
NFKB2-208	ENST00000593908	PTPRG	P23470	1445 aa		33.75	■■■□□ 2.99
NFKB2-208	ENST00000593908	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.7	■■■□□ 2.98
NFKB2-208	ENST00000593908	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.7	■■■□□ 2.98
NFKB2-208	ENST00000593908	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.67	■■■□□ 2.98
NFKB2-208	ENST00000593908	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.63	■■■□□ 2.97
NFKB2-208	ENST00000593908	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.59	■■■□□ 2.97
NFKB2-208	ENST00000593908	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
NFKB2-208	ENST00000593908	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.55	■■■□□ 2.96
NFKB2-208	ENST00000593908	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
NFKB2-208	ENST00000593908	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.54	■■■□□ 2.96
NFKB2-208	ENST00000593908	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.53	■■■□□ 2.96
NFKB2-208	ENST00000593908	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.53	■■■□□ 2.96
NFKB2-208	ENST00000593908	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.49	■■■□□ 2.95
NFKB2-208	ENST00000593908	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.43	■■■□□ 2.94
NFKB2-208	ENST00000593908	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.43	■■■□□ 2.94
NFKB2-208	ENST00000593908	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.41	■■■□□ 2.94
NFKB2-208	ENST00000593908	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.37	■■■□□ 2.93
NFKB2-208	ENST00000593908	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.36	■■■□□ 2.93
NFKB2-208	ENST00000593908	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
NFKB2-208	ENST00000593908	CLIP1	P30622	1438 aa		33.33	■■■□□ 2.93
NFKB2-208	ENST00000593908	GLI2	P10070	1586 aa		33.33	■■■□□ 2.93
NFKB2-208	ENST00000593908	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.27	■■■□□ 2.92
NFKB2-208	ENST00000593908	KDM6B	O15054	1643 aa		33.27	■■■□□ 2.92
NFKB2-208	ENST00000593908	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
NFKB2-208	ENST00000593908	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		33.19	■■■□□ 2.9
NFKB2-208	ENST00000593908	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		33.18	■■■□□ 2.9
NFKB2-208	ENST00000593908	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
NFKB2-208	ENST00000593908	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
NFKB2-208	ENST00000593908	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.14	■■■□□ 2.9
NFKB2-208	ENST00000593908	ABCA8	O94911	1581 aa		33.12	■■■□□ 2.89
NFKB2-208	ENST00000593908	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NFKB2-208	ENST00000593908	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NFKB2-208	ENST00000593908	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NFKB2-208	ENST00000593908	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
NFKB2-208	ENST00000593908	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.05	■■■□□ 2.88
NFKB2-208	ENST00000593908	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		33.02	■■■□□ 2.88
NFKB2-208	ENST00000593908	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		33	■■■□□ 2.87
NFKB2-208	ENST00000593908	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.95	■■■□□ 2.87
NFKB2-208	ENST00000593908	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.93	■■■□□ 2.86
NFKB2-208	ENST00000593908	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.91	■■■□□ 2.86
NFKB2-208	ENST00000593908	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.9	■■■□□ 2.86
NFKB2-208	ENST00000593908	ATP10B	O94823	1461 aa		32.88	■■■□□ 2.85
NFKB2-208	ENST00000593908	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.86	■■■□□ 2.85
NFKB2-208	ENST00000593908	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.81	■■■□□ 2.84
NFKB2-208	ENST00000593908	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.8	■■■□□ 2.84
NFKB2-208	ENST00000593908	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.84
NFKB2-208	ENST00000593908	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.73	■■■□□ 2.83
NFKB2-208	ENST00000593908	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.72	■■■□□ 2.83
NFKB2-208	ENST00000593908	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.7	■■■□□ 2.83
NFKB2-208	ENST00000593908	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NFKB2-208	ENST00000593908	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
NFKB2-208	ENST00000593908	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.65	■■■□□ 2.82
NFKB2-208	ENST00000593908	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
NFKB2-208	ENST00000593908	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.62	■■■□□ 2.81
NFKB2-208	ENST00000593908	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.62	■■■□□ 2.81
NFKB2-208	ENST00000593908	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.61	■■■□□ 2.81
NFKB2-208	ENST00000593908	APLP2	Q06481	763 aa		32.61	■■■□□ 2.81
NFKB2-208	ENST00000593908	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
NFKB2-208	ENST00000593908	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
NFKB2-208	ENST00000593908	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.51	■■■□□ 2.8
NFKB2-208	ENST00000593908	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.51	■■■□□ 2.79
NFKB2-208	ENST00000593908	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.5	■■■□□ 2.79
NFKB2-208	ENST00000593908	NEO1	Q92859	1461 aa		32.5	■■■□□ 2.79
NFKB2-208	ENST00000593908	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.5	■■■□□ 2.79
NFKB2-208	ENST00000593908	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.48	■■■□□ 2.79
NFKB2-208	ENST00000593908	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.45	■■■□□ 2.79
NFKB2-208	ENST00000593908	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
NFKB2-208	ENST00000593908	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
NFKB2-208	ENST00000593908	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
NFKB2-208	ENST00000593908	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.33	■■■□□ 2.77
NFKB2-208	ENST00000593908	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.32	■■■□□ 2.76
NFKB2-208	ENST00000593908	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.32	■■■□□ 2.76
NFKB2-208	ENST00000593908	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.29	■■■□□ 2.76
NFKB2-208	ENST00000593908	FANCA	O15360	1455 aa		32.26	■■■□□ 2.75
NFKB2-208	ENST00000593908	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
NFKB2-208	ENST00000593908	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.25	■■■□□ 2.75
NFKB2-208	ENST00000593908	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.25	■■■□□ 2.75
NFKB2-208	ENST00000593908	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
NFKB2-208	ENST00000593908	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.24	■■■□□ 2.75

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