RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
EFTUD2-226ENST00000593200 CUL7Q14999 1698 aa18.18■□□□□ 0.5
EFTUD2-226ENST00000593200 IGF1RP08069 1367 aa18.17■□□□□ 0.5
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF27Q86VH2 1401 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.16■□□□□ 0.5
EFTUD2-226ENST00000593200 MAPKBP1O60336 1514 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-226ENST00000593200 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.13■□□□□ 0.49
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.12■□□□□ 0.49
EFTUD2-226ENST00000593200 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.49
EFTUD2-226ENST00000593200 DIP2BQ9P265 1576 aa18.08■□□□□ 0.49
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.08■□□□□ 0.48
EFTUD2-226ENST00000593200 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.04■□□□□ 0.48
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPRGP23470 1445 aa17.99■□□□□ 0.47
EFTUD2-226ENST00000593200 IQGAP2Q13576 1575 aa17.98■□□□□ 0.47
EFTUD2-226ENST00000593200 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.97■□□□□ 0.47
EFTUD2-226ENST00000593200 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.96■□□□□ 0.47
EFTUD2-226ENST00000593200 KDM6BO15054 1643 aa17.95■□□□□ 0.46
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPOAP1O95153 1857 aa17.95■□□□□ 0.46
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCC2Q92887 1545 aa17.93■□□□□ 0.46
EFTUD2-226ENST00000593200 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
EFTUD2-226ENST00000593200 DISP1Q96F81 1524 aa17.9■□□□□ 0.46
EFTUD2-226ENST00000593200 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.89■□□□□ 0.45
EFTUD2-226ENST00000593200 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.88■□□□□ 0.45
EFTUD2-226ENST00000593200 ASXL2Q76L83 1435 aa17.88■□□□□ 0.45
EFTUD2-226ENST00000593200 UACAQ9BZF9 1416 aa17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-226ENST00000593200 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-226ENST00000593200 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.87■□□□□ 0.45
EFTUD2-226ENST00000593200 GLI2P10070 1586 aa17.86■□□□□ 0.45
EFTUD2-226ENST00000593200 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA0556O60303 1618 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-226ENST00000593200 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.82■□□□□ 0.44
EFTUD2-226ENST00000593200 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17.79■□□□□ 0.44
EFTUD2-226ENST00000593200 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
EFTUD2-226ENST00000593200 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
EFTUD2-226ENST00000593200 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.77■□□□□ 0.44
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa17.76■□□□□ 0.43
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.7■□□□□ 0.42
EFTUD2-226ENST00000593200 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA3Q08378 1498 aa17.69■□□□□ 0.42
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR7Q9Y4E6 1490 aa17.69■□□□□ 0.42
EFTUD2-226ENST00000593200 PRXQ9BXM0 1461 aa17.68■□□□□ 0.42
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCA8O94911 1581 aa17.66■□□□□ 0.42
EFTUD2-226ENST00000593200 ADGRL1O94910 1474 aa17.64■□□□□ 0.41
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.61■□□□□ 0.41
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.59■□□□□ 0.41
EFTUD2-226ENST00000593200 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.59■□□□□ 0.41
EFTUD2-226ENST00000593200 CD109Q6YHK3 1445 aa17.58■□□□□ 0.41
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNH8Q96L42 1107 aa17.55■□□□□ 0.4
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP10BO94823 1461 aa17.5■□□□□ 0.39
EFTUD2-226ENST00000593200 SAMD9Q5K651 1589 aa17.5■□□□□ 0.39
EFTUD2-226ENST00000593200 P3H3Q8IVL6 736 aa17.49■□□□□ 0.39
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
EFTUD2-226ENST00000593200 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.48■□□□□ 0.39
EFTUD2-226ENST00000593200 ARID3CA6NKF2 412 aa17.47■□□□□ 0.39
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17.46■□□□□ 0.39
EFTUD2-226ENST00000593200 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa17.46■□□□□ 0.39
EFTUD2-226ENST00000593200 ARAP3Q8WWN8 1544 aa17.46■□□□□ 0.39
EFTUD2-226ENST00000593200 HECW2Q9P2P5 1572 aa17.45■□□□□ 0.38
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF21BO75037 1637 aa17.43■□□□□ 0.38
EFTUD2-226ENST00000593200 EEA1Q15075 1411 aa17.41■□□□□ 0.38
EFTUD2-226ENST00000593200 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.4■□□□□ 0.38
EFTUD2-226ENST00000593200 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
EFTUD2-226ENST00000593200 NEO1Q92859 1461 aa17.37■□□□□ 0.37
EFTUD2-226ENST00000593200 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.36■□□□□ 0.37
EFTUD2-226ENST00000593200 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
EFTUD2-226ENST00000593200 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
EFTUD2-226ENST00000593200 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
EFTUD2-226ENST00000593200 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa17.32■□□□□ 0.36
EFTUD2-226ENST00000593200 RAPGEF3O95398 923 aa17.32■□□□□ 0.36
EFTUD2-226ENST00000593200 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAMTSL3P82987 1691 aa17.31■□□□□ 0.36
EFTUD2-226ENST00000593200 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.3■□□□□ 0.36
EFTUD2-226ENST00000593200 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.27■□□□□ 0.36
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPRMP28827 1452 aa17.26■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.26■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 RICTORQ6R327 1708 aa17.25■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.24■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.24■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 FANCAO15360 1455 aa17.23■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.23■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 AKNAQ7Z591 1439 aa17.22■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 MADDQ8WXG6 1647 aa17.21■□□□□ 0.35
EFTUD2-226ENST00000593200 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
EFTUD2-226ENST00000593200 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
EFTUD2-226ENST00000593200 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa17.18■□□□□ 0.34
EFTUD2-226ENST00000593200 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
EFTUD2-226ENST00000593200 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.14■□□□□ 0.33
EFTUD2-226ENST00000593200 HECW1Q76N89 1606 aa17.14■□□□□ 0.33
EFTUD2-226ENST00000593200 FMN1Q68DA7 1419 aa17.13■□□□□ 0.33
EFTUD2-226ENST00000593200 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa17.13■□□□□ 0.33
EFTUD2-226ENST00000593200 PLCH2O75038 1416 aa17.13■□□□□ 0.33
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGI2Q86UL8 1455 aa17.12■□□□□ 0.33
EFTUD2-226ENST00000593200 LMTK3Q96Q04 1460 aa17.12■□□□□ 0.33
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.12■□□□□ 0.33
EFTUD2-226ENST00000593200 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
EFTUD2-226ENST00000593200 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.12■□□□□ 0.33
EFTUD2-226ENST00000593200 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms