RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593068.6

TMEM259-211, Transcript of transmembrane protein 259, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM259, Length 1,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259-211ENST00000593068 ARAP1Q96P48 1450 aa27.96■■■□□ 2.07
TMEM259-211ENST00000593068 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.95■■■□□ 2.07
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TMEM259-211ENST00000593068 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.89■■■□□ 2.06
TMEM259-211ENST00000593068 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
TMEM259-211ENST00000593068 GRIN2AQ12879 1464 aa27.83■■■□□ 2.05
TMEM259-211ENST00000593068 SYNJ2O15056 1496 aa27.81■■■□□ 2.04
TMEM259-211ENST00000593068 P3H3Q8IVL6 736 aa27.79■■■□□ 2.04
TMEM259-211ENST00000593068 FBLN2P98095 1184 aa27.77■■■□□ 2.04
TMEM259-211ENST00000593068 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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TMEM259-211ENST00000593068 IQGAP2Q13576 1575 aa27.73■■■□□ 2.03
TMEM259-211ENST00000593068 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.73■■■□□ 2.03
TMEM259-211ENST00000593068 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.72■■■□□ 2.03
TMEM259-211ENST00000593068 CEP170Q5SW79 1584 aa27.71■■■□□ 2.03
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TMEM259-211ENST00000593068 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
TMEM259-211ENST00000593068 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.65■■■□□ 2.02
TMEM259-211ENST00000593068 CHD1O14646 1710 aa27.62■■■□□ 2.01
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TMEM259-211ENST00000593068 KIAA0556O60303 1618 aa27.47■■□□□ 1.99
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TMEM259-211ENST00000593068 FMN1Q68DA7 1419 aa27.47■■□□□ 1.99
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TMEM259-211ENST00000593068 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.44■■□□□ 1.98
TMEM259-211ENST00000593068 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.43■■□□□ 1.98
TMEM259-211ENST00000593068 TIAM1Q13009 1591 aa27.42■■□□□ 1.98
TMEM259-211ENST00000593068 JPH4Q96JJ6 628 aa27.41■■□□□ 1.98
TMEM259-211ENST00000593068 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.37■■□□□ 1.97
TMEM259-211ENST00000593068 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.36■■□□□ 1.97
TMEM259-211ENST00000593068 MAP3K1Q13233 1512 aa27.33■■□□□ 1.97
TMEM259-211ENST00000593068 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.28■■□□□ 1.96
TMEM259-211ENST00000593068 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.27■■□□□ 1.96
TMEM259-211ENST00000593068 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
TMEM259-211ENST00000593068 SHROOM2Q13796 1616 aa27.25■■□□□ 1.95
TMEM259-211ENST00000593068 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.25■■□□□ 1.95
TMEM259-211ENST00000593068 HECW1Q76N89 1606 aa27.24■■□□□ 1.95
TMEM259-211ENST00000593068 ARID3CA6NKF2 412 aa27.21■■□□□ 1.95
TMEM259-211ENST00000593068 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.2■■□□□ 1.94
TMEM259-211ENST00000593068 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.19■■□□□ 1.94
TMEM259-211ENST00000593068 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.18■■□□□ 1.94
TMEM259-211ENST00000593068 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
TMEM259-211ENST00000593068 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TMEM259-211ENST00000593068 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
TMEM259-211ENST00000593068 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.13■■□□□ 1.93
TMEM259-211ENST00000593068 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.13■■□□□ 1.93
TMEM259-211ENST00000593068 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.09■■□□□ 1.93
TMEM259-211ENST00000593068 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.08■■□□□ 1.93
TMEM259-211ENST00000593068 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.92
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TMEM259-211ENST00000593068 ABCA8O94911 1581 aa27.06■■□□□ 1.92
TMEM259-211ENST00000593068 PTPRGP23470 1445 aa27.06■■□□□ 1.92
TMEM259-211ENST00000593068 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TMEM259-211ENST00000593068 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.03■■□□□ 1.92
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TMEM259-211ENST00000593068 OSCARQ8IYS5 282 aa26.97■■□□□ 1.91
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TMEM259-211ENST00000593068 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.97■■□□□ 1.91
TMEM259-211ENST00000593068 NCOA2Q15596 1464 aa26.96■■□□□ 1.91
TMEM259-211ENST00000593068 ATP10BO94823 1461 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM259-211ENST00000593068 UACAQ9BZF9 1416 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM259-211ENST00000593068 ARHGEF11O15085 1522 aa26.9■■□□□ 1.9
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TMEM259-211ENST00000593068 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.72■■□□□ 1.87
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TMEM259-211ENST00000593068 MIA2Q96PC5 1412 aa26.62■■□□□ 1.85
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TMEM259-211ENST00000593068 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM259-211ENST00000593068 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.58■■□□□ 1.85
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
TMEM259-211ENST00000593068 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.58■■□□□ 1.84
TMEM259-211ENST00000593068 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.53■■□□□ 1.84
TMEM259-211ENST00000593068 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TMEM259-211ENST00000593068 KCNH8Q96L42 1107 aa26.51■■□□□ 1.83
TMEM259-211ENST00000593068 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.837e-7■■■□□ 18.3
TMEM259-211ENST00000593068 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.5■■□□□ 1.83
TMEM259-211ENST00000593068 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.49■■□□□ 1.83
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
TMEM259-211ENST00000593068 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.48■■□□□ 1.83
TMEM259-211ENST00000593068 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.48■■□□□ 1.83
TMEM259-211ENST00000593068 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.48■■□□□ 1.83
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