RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592361.2

MBD3-210, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene MBD3, Length 907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-210ENST00000592361 JPH4Q96JJ6 628 aa29.51■■■□□ 2.31
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MBD3-210ENST00000592361 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.37■■■□□ 2.29
MBD3-210ENST00000592361 IQGAP2Q13576 1575 aa29.3■■■□□ 2.28
MBD3-210ENST00000592361 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
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MBD3-210ENST00000592361 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.26■■■□□ 2.27
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MBD3-210ENST00000592361 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.14■■■□□ 2.26
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MBD3-210ENST00000592361 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.92■■■□□ 2.22
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MBD3-210ENST00000592361 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
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MBD3-210ENST00000592361 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.62■■■□□ 2.17
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MBD3-210ENST00000592361 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.43■■■□□ 2.14
MBD3-210ENST00000592361 CD109Q6YHK3 1445 aa28.43■■■□□ 2.14
MBD3-210ENST00000592361 P3H3Q8IVL6 736 aa28.41■■■□□ 2.14
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MBD3-210ENST00000592361 KCNH8Q96L42 1107 aa28.38■■■□□ 2.13
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MBD3-210ENST00000592361 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.26■■■□□ 2.11
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MBD3-210ENST00000592361 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.16■■■□□ 2.1
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MBD3-210ENST00000592361 FMN1Q68DA7 1419 aa28.1■■■□□ 2.09
MBD3-210ENST00000592361 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.1■■■□□ 2.09
MBD3-210ENST00000592361 TTC37Q6PGP7 1564 aa28■■■□□ 2.07
MBD3-210ENST00000592361 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28■■■□□ 2.077e-8■□□□□ 9
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MBD3-210ENST00000592361 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.97■■■□□ 2.07
MBD3-210ENST00000592361 FANCAO15360 1455 aa27.96■■■□□ 2.07
MBD3-210ENST00000592361 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.96■■■□□ 2.07
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MBD3-210ENST00000592361 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.92■■■□□ 2.06
MBD3-210ENST00000592361 KIF14Q15058 1648 aa27.91■■■□□ 2.06
MBD3-210ENST00000592361 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
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MBD3-210ENST00000592361 RAPGEF3O95398 923 aa27.89■■■□□ 2.06
MBD3-210ENST00000592361 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.86■■■□□ 2.05
MBD3-210ENST00000592361 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.86■■■□□ 2.05
MBD3-210ENST00000592361 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.86■■■□□ 2.05
MBD3-210ENST00000592361 CLIP1P30622 1438 aa27.85■■■□□ 2.05
MBD3-210ENST00000592361 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.85■■■□□ 2.05
MBD3-210ENST00000592361 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.85■■■□□ 2.05
MBD3-210ENST00000592361 PLCH2O75038 1416 aa27.81■■■□□ 2.04
MBD3-210ENST00000592361 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.81■■■□□ 2.04
MBD3-210ENST00000592361 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
MBD3-210ENST00000592361 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.79■■■□□ 2.04
MBD3-210ENST00000592361 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.78■■■□□ 2.04
MBD3-210ENST00000592361 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
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