RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591914.5

SMAD4-213, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD4, Length 992 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-213ENST00000591914 JPH4Q96JJ6 628 aa46.4■■■■■ 5.02
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SMAD4-213ENST00000591914 PRXQ9BXM0 1461 aa46■■■■■ 4.95
SMAD4-213ENST00000591914 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
SMAD4-213ENST00000591914 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.86■■■■■ 4.93
SMAD4-213ENST00000591914 EEA1Q15075 1411 aa45.82■■■■■ 4.93
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SMAD4-213ENST00000591914 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.81■■■■■ 4.92
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SMAD4-213ENST00000591914 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.76■■■■■ 4.92
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SMAD4-213ENST00000591914 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.74■■■■■ 4.91
SMAD4-213ENST00000591914 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.74■■■■■ 4.91
SMAD4-213ENST00000591914 KIAA0556O60303 1618 aa45.63■■■■■ 4.9
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SMAD4-213ENST00000591914 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.46■■■■■ 4.87
SMAD4-213ENST00000591914 UACAQ9BZF9 1416 aa45.44■■■■■ 4.87
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SMAD4-213ENST00000591914 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.41■■■■■ 4.86
SMAD4-213ENST00000591914 KIF21BO75037 1637 aa45.39■■■■■ 4.86
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SMAD4-213ENST00000591914 SAMD9Q5K651 1589 aa45.23■■■■■ 4.83
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SMAD4-213ENST00000591914 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.21■■■■■ 4.83
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SMAD4-213ENST00000591914 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
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SMAD4-213ENST00000591914 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
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SMAD4-213ENST00000591914 TSPOAP1O95153 1857 aa44.86■■■■■ 4.77
SMAD4-213ENST00000591914 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.84■■■■■ 4.77
SMAD4-213ENST00000591914 ATP10BO94823 1461 aa44.78■■■■■ 4.76
SMAD4-213ENST00000591914 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.75■■■■■ 4.75
SMAD4-213ENST00000591914 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
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SMAD4-213ENST00000591914 KDM6BO15054 1643 aa44.63■■■■■ 4.73
SMAD4-213ENST00000591914 KCNH8Q96L42 1107 aa44.59■■■■■ 4.73
SMAD4-213ENST00000591914 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.55■■■■■ 4.72
SMAD4-213ENST00000591914 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.53■■■■■ 4.72
SMAD4-213ENST00000591914 FMN1Q68DA7 1419 aa44.5■■■■■ 4.71
SMAD4-213ENST00000591914 CD109Q6YHK3 1445 aa44.49■■■■■ 4.71
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SMAD4-213ENST00000591914 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.45■■■■■ 4.71
SMAD4-213ENST00000591914 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.39■■■■■ 4.7
SMAD4-213ENST00000591914 HECW1Q76N89 1606 aa44.35■■■■■ 4.69
SMAD4-213ENST00000591914 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
SMAD4-213ENST00000591914 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
SMAD4-213ENST00000591914 PLEKHD1A6NEE1 506 aa44.31■■■■■ 4.68
SMAD4-213ENST00000591914 CLIP1P30622 1438 aa44.24■■■■■ 4.67
SMAD4-213ENST00000591914 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
SMAD4-213ENST00000591914 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa44.13■■■■■ 4.65
SMAD4-213ENST00000591914 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
SMAD4-213ENST00000591914 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa44.11■■■■■ 4.65
SMAD4-213ENST00000591914 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP44.11■■■■■ 4.653e-12■□□□□ 9.1
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SMAD4-213ENST00000591914 NEO1Q92859 1461 aa44.06■■■■■ 4.64
SMAD4-213ENST00000591914 TTC37Q6PGP7 1564 aa44.05■■■■■ 4.64
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SMAD4-213ENST00000591914 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.99■■■■■ 4.63
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SMAD4-213ENST00000591914 FANCAO15360 1455 aa43.89■■■■■ 4.62
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SMAD4-213ENST00000591914 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.78■■■■■ 4.6
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SMAD4-213ENST00000591914 RICTORQ6R327 1708 aa43.7■■■■■ 4.59
SMAD4-213ENST00000591914 ADGRL1O94910 1474 aa43.66■■■■■ 4.58
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SMAD4-213ENST00000591914 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.57■■■■■ 4.57
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