RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591714.5

HDAC5-210, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC5, Length 667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-210ENST00000591714 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.11■■■□□ 2.25
HDAC5-210ENST00000591714 CUL7Q14999 1698 aa29.05■■■□□ 2.24
HDAC5-210ENST00000591714 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.01■■■□□ 2.23
HDAC5-210ENST00000591714 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.99■■■□□ 2.23
HDAC5-210ENST00000591714 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.8■■■□□ 2.2
HDAC5-210ENST00000591714 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.8■■■□□ 2.2
HDAC5-210ENST00000591714 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
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HDAC5-210ENST00000591714 IQGAP2Q13576 1575 aa28.73■■■□□ 2.19
HDAC5-210ENST00000591714 PTPRGP23470 1445 aa28.72■■■□□ 2.19
HDAC5-210ENST00000591714 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.67■■■□□ 2.18
HDAC5-210ENST00000591714 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.66■■■□□ 2.18
HDAC5-210ENST00000591714 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.65■■■□□ 2.18
HDAC5-210ENST00000591714 MAPKBP1O60336 1514 aa28.65■■■□□ 2.18
HDAC5-210ENST00000591714 DISP1Q96F81 1524 aa28.64■■■□□ 2.18
HDAC5-210ENST00000591714 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.64■■■□□ 2.17
HDAC5-210ENST00000591714 DIP2BQ9P265 1576 aa28.58■■■□□ 2.17
HDAC5-210ENST00000591714 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.57■■■□□ 2.16
HDAC5-210ENST00000591714 ABCC2Q92887 1545 aa28.51■■■□□ 2.15
HDAC5-210ENST00000591714 PRXQ9BXM0 1461 aa28.51■■■□□ 2.15
HDAC5-210ENST00000591714 UACAQ9BZF9 1416 aa28.49■■■□□ 2.15
HDAC5-210ENST00000591714 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.48■■■□□ 2.15
HDAC5-210ENST00000591714 KIAA0556O60303 1618 aa28.48■■■□□ 2.15
HDAC5-210ENST00000591714 TSPOAP1O95153 1857 aa28.47■■■□□ 2.15
HDAC5-210ENST00000591714 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.46■■■□□ 2.15
HDAC5-210ENST00000591714 ASXL2Q76L83 1435 aa28.43■■■□□ 2.14
HDAC5-210ENST00000591714 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.38■■■□□ 2.13
HDAC5-210ENST00000591714 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.36■■■□□ 2.13
HDAC5-210ENST00000591714 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.34■■■□□ 2.13
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HDAC5-210ENST00000591714 GOLGA3Q08378 1498 aa28.29■■■□□ 2.12
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HDAC5-210ENST00000591714 GLI2P10070 1586 aa28.28■■■□□ 2.12
HDAC5-210ENST00000591714 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
HDAC5-210ENST00000591714 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
HDAC5-210ENST00000591714 KDM6BO15054 1643 aa28.26■■■□□ 2.11
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HDAC5-210ENST00000591714 ABCA8O94911 1581 aa28.23■■■□□ 2.11
HDAC5-210ENST00000591714 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.15■■■□□ 2.1
HDAC5-210ENST00000591714 EEA1Q15075 1411 aa28.15■■■□□ 2.1
HDAC5-210ENST00000591714 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.15■■■□□ 2.1
HDAC5-210ENST00000591714 ARID3CA6NKF2 412 aa28.14■■■□□ 2.1
HDAC5-210ENST00000591714 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
HDAC5-210ENST00000591714 KCNH8Q96L42 1107 aa28.12■■■□□ 2.09
HDAC5-210ENST00000591714 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
HDAC5-210ENST00000591714 SAMD9Q5K651 1589 aa28.1■■■□□ 2.09
HDAC5-210ENST00000591714 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.09■■■□□ 2.09
HDAC5-210ENST00000591714 ATP10BO94823 1461 aa28.04■■■□□ 2.08
HDAC5-210ENST00000591714 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.03■■■□□ 2.08
HDAC5-210ENST00000591714 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.01■■■□□ 2.07
HDAC5-210ENST00000591714 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.98■■■□□ 2.07
HDAC5-210ENST00000591714 CD109Q6YHK3 1445 aa27.98■■■□□ 2.07
HDAC5-210ENST00000591714 KIF21BO75037 1637 aa27.97■■■□□ 2.07
HDAC5-210ENST00000591714 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.97■■■□□ 2.07
HDAC5-210ENST00000591714 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.95■■■□□ 2.06
HDAC5-210ENST00000591714 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.94■■■□□ 2.06
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HDAC5-210ENST00000591714 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
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HDAC5-210ENST00000591714 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.78■■■□□ 2.04
HDAC5-210ENST00000591714 ADGRL1O94910 1474 aa27.76■■■□□ 2.03
HDAC5-210ENST00000591714 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.71■■■□□ 2.03
HDAC5-210ENST00000591714 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.7■■■□□ 2.02
HDAC5-210ENST00000591714 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.69■■■□□ 2.02
HDAC5-210ENST00000591714 RAPGEF3O95398 923 aa27.66■■■□□ 2.02
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HDAC5-210ENST00000591714 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
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HDAC5-210ENST00000591714 NEO1Q92859 1461 aa27.59■■■□□ 2.01
HDAC5-210ENST00000591714 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
HDAC5-210ENST00000591714 FMN1Q68DA7 1419 aa27.56■■■□□ 2
HDAC5-210ENST00000591714 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.56■■■□□ 2
HDAC5-210ENST00000591714 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.53■■■□□ 2
HDAC5-210ENST00000591714 HECW1Q76N89 1606 aa27.49■■□□□ 1.99
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HDAC5-210ENST00000591714 AKNAQ7Z591 1439 aa27.49■■□□□ 1.99
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HDAC5-210ENST00000591714 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
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HDAC5-210ENST00000591714 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.34■■□□□ 1.97
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HDAC5-210ENST00000591714 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.33■■□□□ 1.96
HDAC5-210ENST00000591714 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.33■■□□□ 1.96
HDAC5-210ENST00000591714 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.33■■□□□ 1.96
HDAC5-210ENST00000591714 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.31■■□□□ 1.96
HDAC5-210ENST00000591714 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.31■■□□□ 1.96
HDAC5-210ENST00000591714 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.3■■□□□ 1.96
HDAC5-210ENST00000591714 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.3■■□□□ 1.96
HDAC5-210ENST00000591714 CLIP1P30622 1438 aa27.29■■□□□ 1.96
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