RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589600.5

ILF3-216, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ILF3, Length 839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-216ENST00000589600 PRXQ9BXM0 1461 aa41.34■■■■■ 4.21
ILF3-216ENST00000589600 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.25■■■■■ 4.19
ILF3-216ENST00000589600 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.23■■■■■ 4.19
ILF3-216ENST00000589600 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.2■■■■■ 4.19
ILF3-216ENST00000589600 ARAP1Q96P48 1450 aa41.19■■■■■ 4.18
ILF3-216ENST00000589600 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
ILF3-216ENST00000589600 JPH4Q96JJ6 628 aa41.1■■■■■ 4.17
ILF3-216ENST00000589600 IQGAP2Q13576 1575 aa41.08■■■■■ 4.17
ILF3-216ENST00000589600 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
ILF3-216ENST00000589600 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.04■■■■■ 4.16
ILF3-216ENST00000589600 KIF21BO75037 1637 aa41■■■■■ 4.15
ILF3-216ENST00000589600 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.96■■■■■ 4.15
ILF3-216ENST00000589600 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.88■■■■■ 4.14
ILF3-216ENST00000589600 DISP1Q96F81 1524 aa40.82■■■■■ 4.12
ILF3-216ENST00000589600 KIAA0556O60303 1618 aa40.72■■■■■ 4.11
ILF3-216ENST00000589600 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.72■■■■■ 4.11
ILF3-216ENST00000589600 GOLGA3Q08378 1498 aa40.7■■■■■ 4.11
ILF3-216ENST00000589600 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.62■■■■■ 4.09
ILF3-216ENST00000589600 PTPRGP23470 1445 aa40.56■■■■■ 4.08
ILF3-216ENST00000589600 SAMD9Q5K651 1589 aa40.56■■■■■ 4.08
ILF3-216ENST00000589600 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.55■■■■■ 4.08
ILF3-216ENST00000589600 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.5■■■■■ 4.07
ILF3-216ENST00000589600 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
ILF3-216ENST00000589600 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
ILF3-216ENST00000589600 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.35■■■■■ 4.05
ILF3-216ENST00000589600 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.33■■■■■ 4.05
ILF3-216ENST00000589600 UACAQ9BZF9 1416 aa40.33■■■■■ 4.05
ILF3-216ENST00000589600 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
ILF3-216ENST00000589600 ABCC2Q92887 1545 aa40.31■■■■■ 4.04
ILF3-216ENST00000589600 P3H3Q8IVL6 736 aa40.3■■■■■ 4.04
ILF3-216ENST00000589600 ABCA8O94911 1581 aa40.27■■■■■ 4.04
ILF3-216ENST00000589600 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.26■■■■■ 4.04
ILF3-216ENST00000589600 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.25■■■■■ 4.03
ILF3-216ENST00000589600 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.2■■■■■ 4.03
ILF3-216ENST00000589600 MAPKBP1O60336 1514 aa40.18■■■■■ 4.02
ILF3-216ENST00000589600 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.15■■■■■ 4.02
ILF3-216ENST00000589600 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.09■■■■■ 4.01
ILF3-216ENST00000589600 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
ILF3-216ENST00000589600 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.07■■■■■ 4.01
ILF3-216ENST00000589600 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.99■■■■□ 3.99
ILF3-216ENST00000589600 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
ILF3-216ENST00000589600 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.97■■■■□ 3.99
ILF3-216ENST00000589600 CLIP1P30622 1438 aa39.96■■■■□ 3.99
ILF3-216ENST00000589600 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
ILF3-216ENST00000589600 ASXL2Q76L83 1435 aa39.94■■■■□ 3.98
ILF3-216ENST00000589600 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.93■■■■□ 3.98
ILF3-216ENST00000589600 DIP2BQ9P265 1576 aa39.93■■■■□ 3.98
ILF3-216ENST00000589600 FMN1Q68DA7 1419 aa39.91■■■■□ 3.98
ILF3-216ENST00000589600 ATP10BO94823 1461 aa39.89■■■■□ 3.98
ILF3-216ENST00000589600 CEP162Q5TB80 1403 aa39.87■■■■□ 3.97
ILF3-216ENST00000589600 ARID3CA6NKF2 412 aa39.79■■■■□ 3.96
ILF3-216ENST00000589600 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.78■■■■□ 3.96
ILF3-216ENST00000589600 HECW1Q76N89 1606 aa39.75■■■■□ 3.95
ILF3-216ENST00000589600 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
ILF3-216ENST00000589600 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
ILF3-216ENST00000589600 GLI2P10070 1586 aa39.73■■■■□ 3.95
ILF3-216ENST00000589600 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.73■■■■□ 3.95
ILF3-216ENST00000589600 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.69■■■■□ 3.94
ILF3-216ENST00000589600 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
ILF3-216ENST00000589600 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.66■■■■□ 3.94
ILF3-216ENST00000589600 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.6■■■■□ 3.93
ILF3-216ENST00000589600 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.58■■■■□ 3.93
ILF3-216ENST00000589600 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
ILF3-216ENST00000589600 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
ILF3-216ENST00000589600 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
ILF3-216ENST00000589600 TSPOAP1O95153 1857 aa39.52■■■■□ 3.92
ILF3-216ENST00000589600 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
ILF3-216ENST00000589600 KCNH8Q96L42 1107 aa39.49■■■■□ 3.91
ILF3-216ENST00000589600 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.47■■■■□ 3.91
ILF3-216ENST00000589600 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.46■■■■□ 3.91
ILF3-216ENST00000589600 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.45■■■■□ 3.91
ILF3-216ENST00000589600 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.42■■■■□ 3.9
ILF3-216ENST00000589600 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.37■■■■□ 3.89
ILF3-216ENST00000589600 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.35■■■■□ 3.89
ILF3-216ENST00000589600 CD109Q6YHK3 1445 aa39.34■■■■□ 3.89
ILF3-216ENST00000589600 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.32■■■■□ 3.891e-24■■□□□ 12.1
ILF3-216ENST00000589600 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
ILF3-216ENST00000589600 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.29■■■■□ 3.88
ILF3-216ENST00000589600 KIF14Q15058 1648 aa39.29■■■■□ 3.88
ILF3-216ENST00000589600 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
ILF3-216ENST00000589600 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.26■■■■□ 3.88
ILF3-216ENST00000589600 KDM6BO15054 1643 aa39.17■■■■□ 3.86
ILF3-216ENST00000589600 TIAM1Q13009 1591 aa39.12■■■■□ 3.85
ILF3-216ENST00000589600 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
ILF3-216ENST00000589600 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.07■■■■□ 3.85
ILF3-216ENST00000589600 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.04■■■■□ 3.84
ILF3-216ENST00000589600 NEO1Q92859 1461 aa39.04■■■■□ 3.84
ILF3-216ENST00000589600 PLCH2O75038 1416 aa39.03■■■■□ 3.84
ILF3-216ENST00000589600 MAP3K1Q13233 1512 aa39.03■■■■□ 3.84
ILF3-216ENST00000589600 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.02■■■■□ 3.84
ILF3-216ENST00000589600 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.01■■■■□ 3.84
ILF3-216ENST00000589600 FANCAO15360 1455 aa38.98■■■■□ 3.83
ILF3-216ENST00000589600 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.97■■■■□ 3.83
ILF3-216ENST00000589600 PREX2Q70Z35 1606 aa38.96■■■■□ 3.83
ILF3-216ENST00000589600 PHLDB1Q86UU1 1377 aa38.95■■■■□ 3.83
ILF3-216ENST00000589600 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.95■■■■□ 3.83
ILF3-216ENST00000589600 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.95■■■■□ 3.83
ILF3-216ENST00000589600 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.92■■■■□ 3.82
ILF3-216ENST00000589600 AKNAQ7Z591 1439 aa38.89■■■■□ 3.82
ILF3-216ENST00000589600 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.87■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms