RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589536.5

GRN-215, Transcript of granulin precursor, human

TSL 3

Gene GRN, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRN-215	ENST00000589536	CUL7	Q14999	1698 aa		42.57	■■■■■ 4.4
GRN-215	ENST00000589536	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.56	■■■■■ 4.4
GRN-215	ENST00000589536	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GRN-215	ENST00000589536	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GRN-215	ENST00000589536	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.09	■■■■■ 4.33
GRN-215	ENST00000589536	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.05	■■■■■ 4.32
GRN-215	ENST00000589536	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.03	■■■■■ 4.32
GRN-215	ENST00000589536	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.01	■■■■■ 4.32
GRN-215	ENST00000589536	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42	■■■■■ 4.31
GRN-215	ENST00000589536	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	41.95	■■■■■ 4.31
GRN-215	ENST00000589536	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		41.95	■■■■■ 4.31
GRN-215	ENST00000589536	PTPRG	P23470	1445 aa		41.94	■■■■■ 4.3
GRN-215	ENST00000589536	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		41.91	■■■■■ 4.3
GRN-215	ENST00000589536	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		41.9	■■■■■ 4.3
GRN-215	ENST00000589536	DISP1	Q96F81	1524 aa		41.85	■■■■■ 4.29
GRN-215	ENST00000589536	DIP2B	Q9P265	1576 aa		41.83	■■■■■ 4.29
GRN-215	ENST00000589536	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		41.82	■■■■■ 4.29
GRN-215	ENST00000589536	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.79	■■■■■ 4.28
GRN-215	ENST00000589536	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
GRN-215	ENST00000589536	ABCC2	Q92887	1545 aa		41.72	■■■■■ 4.27
GRN-215	ENST00000589536	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		41.69	■■■■■ 4.26
GRN-215	ENST00000589536	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.69	■■■■■ 4.26
GRN-215	ENST00000589536	KIAA0556	O60303	1618 aa		41.68	■■■■■ 4.26
GRN-215	ENST00000589536	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		41.66	■■■■■ 4.26
GRN-215	ENST00000589536	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.65	■■■■■ 4.26
GRN-215	ENST00000589536	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.53	■■■■■ 4.24
GRN-215	ENST00000589536	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.5	■■■■■ 4.23
GRN-215	ENST00000589536	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.5	■■■■■ 4.23
GRN-215	ENST00000589536	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.46	■■■■■ 4.23
GRN-215	ENST00000589536	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.43	■■■■■ 4.22
GRN-215	ENST00000589536	GLI2	P10070	1586 aa		41.42	■■■■■ 4.22
GRN-215	ENST00000589536	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.4	■■■■■ 4.22
GRN-215	ENST00000589536	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.35	■■■■■ 4.21
GRN-215	ENST00000589536	KDM6B	O15054	1643 aa		41.35	■■■■■ 4.21
GRN-215	ENST00000589536	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.3	■■■■■ 4.2
GRN-215	ENST00000589536	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.3	■■■■■ 4.2
GRN-215	ENST00000589536	ABCA8	O94911	1581 aa		41.29	■■■■■ 4.2
GRN-215	ENST00000589536	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.29	■■■■■ 4.2
GRN-215	ENST00000589536	EEA1	Q15075	1411 aa		41.27	■■■■■ 4.2
GRN-215	ENST00000589536	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.2	■■■■■ 4.19
GRN-215	ENST00000589536	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.19	■■■■■ 4.18
GRN-215	ENST00000589536	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.12	■■■■■ 4.17
GRN-215	ENST00000589536	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.06	■■■■■ 4.16
GRN-215	ENST00000589536	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.02	■■■■■ 4.16
GRN-215	ENST00000589536	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	40.99	■■■■■ 4.15
GRN-215	ENST00000589536	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	40.97	■■■■■ 4.15
GRN-215	ENST00000589536	KIF21B	O75037	1637 aa		40.96	■■■■■ 4.15
GRN-215	ENST00000589536	ATP10B	O94823	1461 aa		40.93	■■■■■ 4.14
GRN-215	ENST00000589536	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		40.91	■■■■■ 4.14
GRN-215	ENST00000589536	KCNH8	Q96L42	1107 aa		40.88	■■■■■ 4.13
GRN-215	ENST00000589536	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		40.88	■■■■■ 4.13
GRN-215	ENST00000589536	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		40.88	■■■■■ 4.13
GRN-215	ENST00000589536	CD109	Q6YHK3	1445 aa		40.87	■■■■■ 4.13
GRN-215	ENST00000589536	ARID3C	A6NKF2	412 aa		40.85	■■■■■ 4.13
GRN-215	ENST00000589536	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		40.84	■■■■■ 4.13
GRN-215	ENST00000589536	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		40.82	■■■■■ 4.12
GRN-215	ENST00000589536	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		40.81	■■■■■ 4.12
GRN-215	ENST00000589536	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
GRN-215	ENST00000589536	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
GRN-215	ENST00000589536	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		40.75	■■■■■ 4.11
GRN-215	ENST00000589536	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GRN-215	ENST00000589536	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
GRN-215	ENST00000589536	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
GRN-215	ENST00000589536	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.58	■■■■■ 4.09
GRN-215	ENST00000589536	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.55	■■■■■ 4.08
GRN-215	ENST00000589536	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
GRN-215	ENST00000589536	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.52	■■■■■ 4.08
GRN-215	ENST00000589536	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.46	■■■■■ 4.07
GRN-215	ENST00000589536	NEO1	Q92859	1461 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GRN-215	ENST00000589536	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GRN-215	ENST00000589536	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.41	■■■■■ 4.06
GRN-215	ENST00000589536	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.37	■■■■■ 4.05
GRN-215	ENST00000589536	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.35	■■■■■ 4.05
GRN-215	ENST00000589536	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.32	■■■■■ 4.04
GRN-215	ENST00000589536	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.28	■■■■■ 4.04
GRN-215	ENST00000589536	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.27	■■■■■ 4.04
GRN-215	ENST00000589536	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.27	■■■■■ 4.04
GRN-215	ENST00000589536	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.26	■■■■■ 4.04
GRN-215	ENST00000589536	FANCA	O15360	1455 aa		40.19	■■■■■ 4.02
GRN-215	ENST00000589536	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.18	■■■■■ 4.02
GRN-215	ENST00000589536	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.16	■■■■■ 4.02
GRN-215	ENST00000589536	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.14	■■■■■ 4.02
GRN-215	ENST00000589536	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.12	■■■■■ 4.01
GRN-215	ENST00000589536	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.11	■■■■■ 4.01
GRN-215	ENST00000589536	PLCH2	O75038	1416 aa		40.06	■■■■■ 4
GRN-215	ENST00000589536	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.05	■■■■■ 4
GRN-215	ENST00000589536	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
GRN-215	ENST00000589536	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.02	■■■■■ 4
GRN-215	ENST00000589536	KIF14	Q15058	1648 aa		40.01	■■■■■ 4
GRN-215	ENST00000589536	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40	■■■■□ 3.99
GRN-215	ENST00000589536	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		39.99	■■■■□ 3.99
GRN-215	ENST00000589536	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	39.98	■■■■□ 3.99
GRN-215	ENST00000589536	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		39.97	■■■■□ 3.99
GRN-215	ENST00000589536	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		39.97	■■■■□ 3.99
GRN-215	ENST00000589536	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		39.96	■■■■□ 3.99
GRN-215	ENST00000589536	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		39.93	■■■■□ 3.98
GRN-215	ENST00000589536	CLIP1	P30622	1438 aa		39.91	■■■■□ 3.98
GRN-215	ENST00000589536	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		39.91	■■■■□ 3.98
GRN-215	ENST00000589536	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		39.89	■■■■□ 3.98
GRN-215	ENST00000589536	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		39.89	■■■■□ 3.98

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