RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.92	■■■■□ 3.02
PSME3-209	ENST00000589469	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.91	■■■■□ 3.02
PSME3-209	ENST00000589469	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
PSME3-209	ENST00000589469	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.85	■■■■□ 3.01
PSME3-209	ENST00000589469	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PSME3-209	ENST00000589469	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PSME3-209	ENST00000589469	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.66	■■■□□ 2.98
PSME3-209	ENST00000589469	EEA1	Q15075	1411 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PSME3-209	ENST00000589469	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PSME3-209	ENST00000589469	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PSME3-209	ENST00000589469	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
PSME3-209	ENST00000589469	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PSME3-209	ENST00000589469	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
PSME3-209	ENST00000589469	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PSME3-209	ENST00000589469	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PSME3-209	ENST00000589469	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.46	■■■□□ 2.95
PSME3-209	ENST00000589469	PTPRG	P23470	1445 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PSME3-209	ENST00000589469	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
PSME3-209	ENST00000589469	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PSME3-209	ENST00000589469	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PSME3-209	ENST00000589469	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.34	■■■□□ 2.93
PSME3-209	ENST00000589469	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PSME3-209	ENST00000589469	KIF21B	O75037	1637 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PSME3-209	ENST00000589469	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
PSME3-209	ENST00000589469	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PSME3-209	ENST00000589469	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PSME3-209	ENST00000589469	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PSME3-209	ENST00000589469	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PSME3-209	ENST00000589469	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PSME3-209	ENST00000589469	P3H3	Q8IVL6	736 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PSME3-209	ENST00000589469	SAMD9	Q5K651	1589 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PSME3-209	ENST00000589469	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PSME3-209	ENST00000589469	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PSME3-209	ENST00000589469	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PSME3-209	ENST00000589469	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
PSME3-209	ENST00000589469	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PSME3-209	ENST00000589469	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.01	■■■□□ 2.87
PSME3-209	ENST00000589469	ABCA8	O94911	1581 aa		33	■■■□□ 2.87
PSME3-209	ENST00000589469	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PSME3-209	ENST00000589469	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PSME3-209	ENST00000589469	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PSME3-209	ENST00000589469	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PSME3-209	ENST00000589469	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PSME3-209	ENST00000589469	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PSME3-209	ENST00000589469	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PSME3-209	ENST00000589469	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PSME3-209	ENST00000589469	GLI2	P10070	1586 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PSME3-209	ENST00000589469	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PSME3-209	ENST00000589469	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PSME3-209	ENST00000589469	ATP10B	O94823	1461 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PSME3-209	ENST00000589469	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PSME3-209	ENST00000589469	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PSME3-209	ENST00000589469	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PSME3-209	ENST00000589469	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PSME3-209	ENST00000589469	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PSME3-209	ENST00000589469	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PSME3-209	ENST00000589469	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PSME3-209	ENST00000589469	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PSME3-209	ENST00000589469	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
PSME3-209	ENST00000589469	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PSME3-209	ENST00000589469	KDM6B	O15054	1643 aa		32.51	■■■□□ 2.8
PSME3-209	ENST00000589469	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PSME3-209	ENST00000589469	CLIP1	P30622	1438 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PSME3-209	ENST00000589469	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PSME3-209	ENST00000589469	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PSME3-209	ENST00000589469	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PSME3-209	ENST00000589469	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PSME3-209	ENST00000589469	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PSME3-209	ENST00000589469	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PSME3-209	ENST00000589469	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PSME3-209	ENST00000589469	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PSME3-209	ENST00000589469	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
PSME3-209	ENST00000589469	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PSME3-209	ENST00000589469	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PSME3-209	ENST00000589469	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PSME3-209	ENST00000589469	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PSME3-209	ENST00000589469	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PSME3-209	ENST00000589469	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.24	■■■□□ 2.75
PSME3-209	ENST00000589469	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PSME3-209	ENST00000589469	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
PSME3-209	ENST00000589469	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.2	■■■□□ 2.74
PSME3-209	ENST00000589469	NEO1	Q92859	1461 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PSME3-209	ENST00000589469	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PSME3-209	ENST00000589469	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PSME3-209	ENST00000589469	KIF14	Q15058	1648 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PSME3-209	ENST00000589469	FANCA	O15360	1455 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PSME3-209	ENST00000589469	PLCH2	O75038	1416 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PSME3-209	ENST00000589469	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PSME3-209	ENST00000589469	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PSME3-209	ENST00000589469	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PSME3-209	ENST00000589469	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PSME3-209	ENST00000589469	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PSME3-209	ENST00000589469	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PSME3-209	ENST00000589469	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PSME3-209	ENST00000589469	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PSME3-209	ENST00000589469	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PSME3-209	ENST00000589469	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PSME3-209	ENST00000589469	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PSME3-209	ENST00000589469	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.88	■■■□□ 2.69

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