RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589335.5

USP32-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 32, human

TSL 5

Gene USP32, Length 691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP32-208	ENST00000589335	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.97	■■■■□ 3.03
USP32-208	ENST00000589335	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.92	■■■■□ 3.02
USP32-208	ENST00000589335	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.86	■■■■□ 3.01
USP32-208	ENST00000589335	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.84	■■■■□ 3.01
USP32-208	ENST00000589335	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.61	■■■□□ 2.97
USP32-208	ENST00000589335	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.61	■■■□□ 2.97
USP32-208	ENST00000589335	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.59	■■■□□ 2.97
USP32-208	ENST00000589335	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.47	■■■□□ 2.95
USP32-208	ENST00000589335	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.46	■■■□□ 2.95
USP32-208	ENST00000589335	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
USP32-208	ENST00000589335	PTPRG	P23470	1445 aa		33.45	■■■□□ 2.95
USP32-208	ENST00000589335	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.45	■■■□□ 2.94
USP32-208	ENST00000589335	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.43	■■■□□ 2.94
USP32-208	ENST00000589335	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.41	■■■□□ 2.94
USP32-208	ENST00000589335	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.41	■■■□□ 2.94
USP32-208	ENST00000589335	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.39	■■■□□ 2.94
USP32-208	ENST00000589335	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.37	■■■□□ 2.93
USP32-208	ENST00000589335	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.36	■■■□□ 2.93
USP32-208	ENST00000589335	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.36	■■■□□ 2.93
USP32-208	ENST00000589335	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.33	■■■□□ 2.93
USP32-208	ENST00000589335	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.33	■■■□□ 2.93
USP32-208	ENST00000589335	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.31	■■■□□ 2.92
USP32-208	ENST00000589335	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.26	■■■□□ 2.91
USP32-208	ENST00000589335	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.26	■■■□□ 2.91
USP32-208	ENST00000589335	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.23	■■■□□ 2.91
USP32-208	ENST00000589335	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.22	■■■□□ 2.91
USP32-208	ENST00000589335	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.16	■■■□□ 2.9
USP32-208	ENST00000589335	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.11	■■■□□ 2.89
USP32-208	ENST00000589335	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.1	■■■□□ 2.89
USP32-208	ENST00000589335	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.08	■■■□□ 2.89
USP32-208	ENST00000589335	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.07	■■■□□ 2.88
USP32-208	ENST00000589335	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
USP32-208	ENST00000589335	EEA1	Q15075	1411 aa		33.05	■■■□□ 2.88
USP32-208	ENST00000589335	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.04	■■■□□ 2.88
USP32-208	ENST00000589335	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
USP32-208	ENST00000589335	ABCA8	O94911	1581 aa		33	■■■□□ 2.87
USP32-208	ENST00000589335	GLI2	P10070	1586 aa		32.96	■■■□□ 2.87
USP32-208	ENST00000589335	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
USP32-208	ENST00000589335	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.93	■■■□□ 2.86
USP32-208	ENST00000589335	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
USP32-208	ENST00000589335	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.92	■■■□□ 2.86
USP32-208	ENST00000589335	KDM6B	O15054	1643 aa		32.89	■■■□□ 2.86
USP32-208	ENST00000589335	KIF21B	O75037	1637 aa		32.87	■■■□□ 2.85
USP32-208	ENST00000589335	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.85	■■■□□ 2.85
USP32-208	ENST00000589335	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.84	■■■□□ 2.85
USP32-208	ENST00000589335	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
USP32-208	ENST00000589335	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.77	■■■□□ 2.84
USP32-208	ENST00000589335	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.73	■■■□□ 2.83
USP32-208	ENST00000589335	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.71	■■■□□ 2.83
USP32-208	ENST00000589335	ATP10B	O94823	1461 aa		32.71	■■■□□ 2.83
USP32-208	ENST00000589335	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.7	■■■□□ 2.83
USP32-208	ENST00000589335	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
USP32-208	ENST00000589335	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.66	■■■□□ 2.82
USP32-208	ENST00000589335	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
USP32-208	ENST00000589335	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.62	■■■□□ 2.81
USP32-208	ENST00000589335	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
USP32-208	ENST00000589335	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.61	■■■□□ 2.81
USP32-208	ENST00000589335	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.61	■■■□□ 2.81
USP32-208	ENST00000589335	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.58	■■■□□ 2.81
USP32-208	ENST00000589335	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.55	■■■□□ 2.8
USP32-208	ENST00000589335	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
USP32-208	ENST00000589335	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.47	■■■□□ 2.79
USP32-208	ENST00000589335	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
USP32-208	ENST00000589335	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
USP32-208	ENST00000589335	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.44	■■■□□ 2.78
USP32-208	ENST00000589335	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.42	■■■□□ 2.78
USP32-208	ENST00000589335	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
USP32-208	ENST00000589335	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.28	■■■□□ 2.76
USP32-208	ENST00000589335	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.27	■■■□□ 2.76
USP32-208	ENST00000589335	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.26	■■■□□ 2.76
USP32-208	ENST00000589335	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.25	■■■□□ 2.75
USP32-208	ENST00000589335	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.25	■■■□□ 2.75
USP32-208	ENST00000589335	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75
USP32-208	ENST00000589335	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		32.23	■■■□□ 2.75
USP32-208	ENST00000589335	NEO1	Q92859	1461 aa		32.2	■■■□□ 2.75
USP32-208	ENST00000589335	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
USP32-208	ENST00000589335	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.17	■■■□□ 2.74
USP32-208	ENST00000589335	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.16	■■■□□ 2.74
USP32-208	ENST00000589335	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.15	■■■□□ 2.74
USP32-208	ENST00000589335	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.13	■■■□□ 2.73
USP32-208	ENST00000589335	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
USP32-208	ENST00000589335	FANCA	O15360	1455 aa		32.08	■■■□□ 2.73
USP32-208	ENST00000589335	KIF14	Q15058	1648 aa		32.07	■■■□□ 2.72
USP32-208	ENST00000589335	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.06	■■■□□ 2.72
USP32-208	ENST00000589335	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.05	■■■□□ 2.72
USP32-208	ENST00000589335	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.03	■■■□□ 2.72
USP32-208	ENST00000589335	CLIP1	P30622	1438 aa		32.01	■■■□□ 2.72
USP32-208	ENST00000589335	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.01	■■■□□ 2.72
USP32-208	ENST00000589335	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.01	■■■□□ 2.72
USP32-208	ENST00000589335	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
USP32-208	ENST00000589335	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
USP32-208	ENST00000589335	PLCH2	O75038	1416 aa		31.98	■■■□□ 2.71
USP32-208	ENST00000589335	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.95	■■■□□ 2.7
USP32-208	ENST00000589335	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
USP32-208	ENST00000589335	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.91	■■■□□ 2.7
USP32-208	ENST00000589335	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.91	■■■□□ 2.7
USP32-208	ENST00000589335	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.91	■■■□□ 2.7
USP32-208	ENST00000589335	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.87	■■■□□ 2.69
USP32-208	ENST00000589335	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.85	■■■□□ 2.69
USP32-208	ENST00000589335	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.83	■■■□□ 2.69

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