RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589016.5

CCDC159-211, Transcript of coiled-coil domain containing 159, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC159, Length 954 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159-211ENST00000589016 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CCDC159-211ENST00000589016 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.39■■■□□ 2.14
CCDC159-211ENST00000589016 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.37■■■□□ 2.13
CCDC159-211ENST00000589016 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.37■■■□□ 2.13
CCDC159-211ENST00000589016 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.32■■■□□ 2.12
CCDC159-211ENST00000589016 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
CCDC159-211ENST00000589016 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.15■■■□□ 2.1
CCDC159-211ENST00000589016 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.13■■■□□ 2.09
CCDC159-211ENST00000589016 IQGAP2Q13576 1575 aa28.08■■■□□ 2.09
CCDC159-211ENST00000589016 PTPRGP23470 1445 aa28.07■■■□□ 2.08
CCDC159-211ENST00000589016 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.04■■■□□ 2.08
CCDC159-211ENST00000589016 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.98■■■□□ 2.07
CCDC159-211ENST00000589016 MAPKBP1O60336 1514 aa27.97■■■□□ 2.07
CCDC159-211ENST00000589016 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.94■■■□□ 2.06
CCDC159-211ENST00000589016 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CCDC159-211ENST00000589016 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.92■■■□□ 2.06
CCDC159-211ENST00000589016 PRXQ9BXM0 1461 aa27.92■■■□□ 2.06
CCDC159-211ENST00000589016 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.92■■■□□ 2.06
CCDC159-211ENST00000589016 DISP1Q96F81 1524 aa27.92■■■□□ 2.06
CCDC159-211ENST00000589016 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.86■■■□□ 2.05
CCDC159-211ENST00000589016 UACAQ9BZF9 1416 aa27.85■■■□□ 2.05
CCDC159-211ENST00000589016 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.85■■■□□ 2.05
CCDC159-211ENST00000589016 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.85■■■□□ 2.05
CCDC159-211ENST00000589016 ABCC2Q92887 1545 aa27.84■■■□□ 2.05
CCDC159-211ENST00000589016 GOLGA3Q08378 1498 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC159-211ENST00000589016 KIAA0556O60303 1618 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC159-211ENST00000589016 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.8■■■□□ 2.04
CCDC159-211ENST00000589016 EEA1Q15075 1411 aa27.79■■■□□ 2.04
CCDC159-211ENST00000589016 DIP2BQ9P265 1576 aa27.78■■■□□ 2.04
CCDC159-211ENST00000589016 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.75■■■□□ 2.03
CCDC159-211ENST00000589016 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CCDC159-211ENST00000589016 ASXL2Q76L83 1435 aa27.71■■■□□ 2.03
CCDC159-211ENST00000589016 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.69■■■□□ 2.02
CCDC159-211ENST00000589016 GLI2P10070 1586 aa27.6■■■□□ 2.01
CCDC159-211ENST00000589016 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CCDC159-211ENST00000589016 ABCA8O94911 1581 aa27.54■■■□□ 2
CCDC159-211ENST00000589016 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CCDC159-211ENST00000589016 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CCDC159-211ENST00000589016 P3H3Q8IVL6 736 aa27.53■■■□□ 2
CCDC159-211ENST00000589016 TSPOAP1O95153 1857 aa27.52■■■□□ 2
CCDC159-211ENST00000589016 KDM6BO15054 1643 aa27.49■■□□□ 1.99
CCDC159-211ENST00000589016 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.49■■□□□ 1.99
CCDC159-211ENST00000589016 SAMD9Q5K651 1589 aa27.45■■□□□ 1.99
CCDC159-211ENST00000589016 KIF21BO75037 1637 aa27.44■■□□□ 1.98
CCDC159-211ENST00000589016 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.41■■□□□ 1.98
CCDC159-211ENST00000589016 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.4■■□□□ 1.98
CCDC159-211ENST00000589016 KCNH8Q96L42 1107 aa27.39■■□□□ 1.98
CCDC159-211ENST00000589016 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CCDC159-211ENST00000589016 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CCDC159-211ENST00000589016 ATP10BO94823 1461 aa27.36■■□□□ 1.97
CCDC159-211ENST00000589016 CD109Q6YHK3 1445 aa27.33■■□□□ 1.96
CCDC159-211ENST00000589016 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CCDC159-211ENST00000589016 ARID3CA6NKF2 412 aa27.3■■□□□ 1.96
CCDC159-211ENST00000589016 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.3■■□□□ 1.96
CCDC159-211ENST00000589016 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.3■■□□□ 1.96
CCDC159-211ENST00000589016 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.28■■□□□ 1.96
CCDC159-211ENST00000589016 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.28■■□□□ 1.96
CCDC159-211ENST00000589016 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.27■■□□□ 1.96
CCDC159-211ENST00000589016 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CCDC159-211ENST00000589016 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CCDC159-211ENST00000589016 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CCDC159-211ENST00000589016 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CCDC159-211ENST00000589016 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.2■■□□□ 1.94
CCDC159-211ENST00000589016 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.18■■□□□ 1.94
CCDC159-211ENST00000589016 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.15■■□□□ 1.94
CCDC159-211ENST00000589016 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.15■■□□□ 1.94
CCDC159-211ENST00000589016 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.13■■□□□ 1.93
CCDC159-211ENST00000589016 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.12■■□□□ 1.93
CCDC159-211ENST00000589016 FMN1Q68DA7 1419 aa27.1■■□□□ 1.93
CCDC159-211ENST00000589016 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.06■■□□□ 1.92
CCDC159-211ENST00000589016 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.06■■□□□ 1.92
CCDC159-211ENST00000589016 NEO1Q92859 1461 aa27.02■■□□□ 1.92
CCDC159-211ENST00000589016 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CCDC159-211ENST00000589016 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CCDC159-211ENST00000589016 HECW1Q76N89 1606 aa26.94■■□□□ 1.9
CCDC159-211ENST00000589016 ADGRL1O94910 1474 aa26.94■■□□□ 1.9
CCDC159-211ENST00000589016 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CCDC159-211ENST00000589016 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
CCDC159-211ENST00000589016 RAPGEF3O95398 923 aa26.89■■□□□ 1.9
CCDC159-211ENST00000589016 AKNAQ7Z591 1439 aa26.85■■□□□ 1.89
CCDC159-211ENST00000589016 FANCAO15360 1455 aa26.85■■□□□ 1.89
CCDC159-211ENST00000589016 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.84■■□□□ 1.89
CCDC159-211ENST00000589016 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CCDC159-211ENST00000589016 PLCH2O75038 1416 aa26.82■■□□□ 1.88
CCDC159-211ENST00000589016 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.81■■□□□ 1.88
CCDC159-211ENST00000589016 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.8■■□□□ 1.88
CCDC159-211ENST00000589016 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CCDC159-211ENST00000589016 CLIP1P30622 1438 aa26.79■■□□□ 1.88
CCDC159-211ENST00000589016 CEP162Q5TB80 1403 aa26.79■■□□□ 1.88
CCDC159-211ENST00000589016 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.77■■□□□ 1.88
CCDC159-211ENST00000589016 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.75■■□□□ 1.87
CCDC159-211ENST00000589016 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.73■■□□□ 1.87
CCDC159-211ENST00000589016 KIF14Q15058 1648 aa26.72■■□□□ 1.87
CCDC159-211ENST00000589016 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.69■■□□□ 1.86
CCDC159-211ENST00000589016 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CCDC159-211ENST00000589016 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.69■■□□□ 1.86
CCDC159-211ENST00000589016 RICTORQ6R327 1708 aa26.68■■□□□ 1.86
CCDC159-211ENST00000589016 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CCDC159-211ENST00000589016 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.67■■□□□ 1.86
CCDC159-211ENST00000589016 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.66■■□□□ 1.86
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