RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588909.1

TPGS2-208, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 2, human

TSL 5

Gene TPGS2, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPGS2-208	ENST00000588909	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		44.35	■■■■■ 4.69
TPGS2-208	ENST00000588909	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	44.35	■■■■■ 4.69
TPGS2-208	ENST00000588909	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		44.28	■■■■■ 4.68
TPGS2-208	ENST00000588909	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.17	■■■■■ 4.66
TPGS2-208	ENST00000588909	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.9	■■■■■ 4.62
TPGS2-208	ENST00000588909	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.85	■■■■■ 4.61
TPGS2-208	ENST00000588909	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.84	■■■■■ 4.61
TPGS2-208	ENST00000588909	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.74	■■■■■ 4.59
TPGS2-208	ENST00000588909	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.72	■■■■■ 4.59
TPGS2-208	ENST00000588909	PTPRG	P23470	1445 aa		43.71	■■■■■ 4.59
TPGS2-208	ENST00000588909	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.69	■■■■■ 4.58
TPGS2-208	ENST00000588909	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.65	■■■■■ 4.58
TPGS2-208	ENST00000588909	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.63	■■■■■ 4.57
TPGS2-208	ENST00000588909	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.57	■■■■■ 4.57
TPGS2-208	ENST00000588909	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.55	■■■■■ 4.56
TPGS2-208	ENST00000588909	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.52	■■■■■ 4.56
TPGS2-208	ENST00000588909	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.5	■■■■■ 4.55
TPGS2-208	ENST00000588909	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.48	■■■■■ 4.55
TPGS2-208	ENST00000588909	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.48	■■■■■ 4.55
TPGS2-208	ENST00000588909	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.45	■■■■■ 4.55
TPGS2-208	ENST00000588909	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.44	■■■■■ 4.55
TPGS2-208	ENST00000588909	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		43.43	■■■■■ 4.54
TPGS2-208	ENST00000588909	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.37	■■■■■ 4.53
TPGS2-208	ENST00000588909	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.37	■■■■■ 4.53
TPGS2-208	ENST00000588909	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.37	■■■■■ 4.53
TPGS2-208	ENST00000588909	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	43.35	■■■■■ 4.53
TPGS2-208	ENST00000588909	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.31	■■■■■ 4.52
TPGS2-208	ENST00000588909	GOLGA3	Q08378	1498 aa		43.23	■■■■■ 4.51
TPGS2-208	ENST00000588909	EEA1	Q15075	1411 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TPGS2-208	ENST00000588909	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TPGS2-208	ENST00000588909	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.17	■■■■■ 4.5
TPGS2-208	ENST00000588909	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.17	■■■■■ 4.5
TPGS2-208	ENST00000588909	P3H3	Q8IVL6	736 aa		43.15	■■■■■ 4.5
TPGS2-208	ENST00000588909	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.13	■■■■■ 4.5
TPGS2-208	ENST00000588909	TSPOAP1	O95153	1857 aa		43.08	■■■■■ 4.49
TPGS2-208	ENST00000588909	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
TPGS2-208	ENST00000588909	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	43.05	■■■■■ 4.48
TPGS2-208	ENST00000588909	ABCA8	O94911	1581 aa		43	■■■■■ 4.47
TPGS2-208	ENST00000588909	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.97	■■■■■ 4.47
TPGS2-208	ENST00000588909	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.93	■■■■■ 4.46
TPGS2-208	ENST00000588909	GLI2	P10070	1586 aa		42.92	■■■■■ 4.46
TPGS2-208	ENST00000588909	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.91	■■■■■ 4.46
TPGS2-208	ENST00000588909	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.9	■■■■■ 4.46
TPGS2-208	ENST00000588909	KIF21B	O75037	1637 aa		42.88	■■■■■ 4.45
TPGS2-208	ENST00000588909	KDM6B	O15054	1643 aa		42.86	■■■■■ 4.45
TPGS2-208	ENST00000588909	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.85	■■■■■ 4.45
TPGS2-208	ENST00000588909	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.44
TPGS2-208	ENST00000588909	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.78	■■■■■ 4.44
TPGS2-208	ENST00000588909	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.76	■■■■■ 4.44
TPGS2-208	ENST00000588909	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.75	■■■■■ 4.43
TPGS2-208	ENST00000588909	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
TPGS2-208	ENST00000588909	ATP10B	O94823	1461 aa		42.69	■■■■■ 4.42
TPGS2-208	ENST00000588909	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.42
TPGS2-208	ENST00000588909	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.65	■■■■■ 4.42
TPGS2-208	ENST00000588909	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.57	■■■■■ 4.41
TPGS2-208	ENST00000588909	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
TPGS2-208	ENST00000588909	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
TPGS2-208	ENST00000588909	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
TPGS2-208	ENST00000588909	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.55	■■■■■ 4.4
TPGS2-208	ENST00000588909	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.55	■■■■■ 4.4
TPGS2-208	ENST00000588909	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.54	■■■■■ 4.4
TPGS2-208	ENST00000588909	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.48	■■■■■ 4.39
TPGS2-208	ENST00000588909	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.42	■■■■■ 4.38
TPGS2-208	ENST00000588909	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.36	■■■■■ 4.37
TPGS2-208	ENST00000588909	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.28	■■■■■ 4.36
TPGS2-208	ENST00000588909	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.27	■■■■■ 4.36
TPGS2-208	ENST00000588909	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.27	■■■■■ 4.36
TPGS2-208	ENST00000588909	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.25	■■■■■ 4.35
TPGS2-208	ENST00000588909	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.24	■■■■■ 4.35
TPGS2-208	ENST00000588909	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.2	■■■■■ 4.35
TPGS2-208	ENST00000588909	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.09	■■■■■ 4.33
TPGS2-208	ENST00000588909	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.08	■■■■■ 4.33
TPGS2-208	ENST00000588909	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.04	■■■■■ 4.32	6e-6	■■■■■ 38.2
TPGS2-208	ENST00000588909	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.03	■■■■■ 4.32
TPGS2-208	ENST00000588909	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.01	■■■■■ 4.32
TPGS2-208	ENST00000588909	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		42.01	■■■■■ 4.32
TPGS2-208	ENST00000588909	NEO1	Q92859	1461 aa		42	■■■■■ 4.31
TPGS2-208	ENST00000588909	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.98	■■■■■ 4.31
TPGS2-208	ENST00000588909	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.89	■■■■■ 4.3
TPGS2-208	ENST00000588909	CLIP1	P30622	1438 aa		41.88	■■■■■ 4.3
TPGS2-208	ENST00000588909	FANCA	O15360	1455 aa		41.88	■■■■■ 4.29
TPGS2-208	ENST00000588909	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.88	■■■■■ 4.29
TPGS2-208	ENST00000588909	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.87	■■■■■ 4.29
TPGS2-208	ENST00000588909	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.85	■■■■■ 4.29
TPGS2-208	ENST00000588909	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.84	■■■■■ 4.29
TPGS2-208	ENST00000588909	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.82	■■■■■ 4.29
TPGS2-208	ENST00000588909	KIF14	Q15058	1648 aa		41.8	■■■■■ 4.28
TPGS2-208	ENST00000588909	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.78	■■■■■ 4.28
TPGS2-208	ENST00000588909	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
TPGS2-208	ENST00000588909	PLCH2	O75038	1416 aa		41.76	■■■■■ 4.28
TPGS2-208	ENST00000588909	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.76	■■■■■ 4.27
TPGS2-208	ENST00000588909	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.69	■■■■■ 4.26
TPGS2-208	ENST00000588909	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		41.67	■■■■■ 4.26
TPGS2-208	ENST00000588909	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.67	■■■■■ 4.26
TPGS2-208	ENST00000588909	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.64	■■■■■ 4.26
TPGS2-208	ENST00000588909	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.62	■■■■■ 4.25
TPGS2-208	ENST00000588909	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.61	■■■■■ 4.25
TPGS2-208	ENST00000588909	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.56	■■■■■ 4.24
TPGS2-208	ENST00000588909	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.56	■■■■■ 4.24
TPGS2-208	ENST00000588909	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.55	■■■■■ 4.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms