RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588672.1

LDLRAD4-AS1-201, LDLRAD4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LDLRAD4-AS1, Length 2,190 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.56■□□□□ 0.88
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.55■□□□□ 0.88
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TIAM1Q13009 1591 aa20.52■□□□□ 0.88
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.5■□□□□ 0.87
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MAP3K1Q13233 1512 aa20.49■□□□□ 0.87
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PBRM1Q86U86 1689 aa20.45■□□□□ 0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.45■□□□□ 0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.43■□□□□ 0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.41■□□□□ 0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 WDR62O43379 1518 aa20.41■□□□□ 0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.4■□□□□ 0.86
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LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SAMD9Q5K651 1589 aa20.39■□□□□ 0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 IFT140Q96RY7 1462 aa20.37■□□□□ 0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.37■□□□□ 0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ADAMTS12P58397 1594 aa20.36■□□□□ 0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GRIN2BQ13224 1484 aa20.36■□□□□ 0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ITGAEP38570 1179 aa20.36■□□□□ 0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FMN1Q68DA7 1419 aa20.36■□□□□ 0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ERCC6Q03468 1493 aa20.35■□□□□ 0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.34■□□□□ 0.85
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 IQGAP2Q13576 1575 aa20.25■□□□□ 0.83
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.19■□□□□ 0.82
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.17■□□□□ 0.82
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.16■□□□□ 0.82
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GRIN2AQ12879 1464 aa20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.12■□□□□ 0.81
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.12■□□□□ 0.81
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.12■□□□□ 0.81
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.11■□□□□ 0.81
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NCOA2Q15596 1464 aa20.1■□□□□ 0.81
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 HECW1Q76N89 1606 aa20.09■□□□□ 0.81
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.08■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DISP1Q96F81 1524 aa20.08■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.08■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ARID3CA6NKF2 412 aa20.07■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
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LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KIAA0556O60303 1618 aa20.06■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SYNJ2O15056 1496 aa20.05■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FBLN2P98095 1184 aa20.05■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 FOXD1Q16676 465 aa20.05■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CEP170Q5SW79 1584 aa20.04■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.04■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MAPKBP1O60336 1514 aa20.02■□□□□ 0.8
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ARHGEF11O15085 1522 aa20.01■□□□□ 0.79
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PTPRKQ15262 1439 aa20■□□□□ 0.79
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.95■□□□□ 0.78
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NUP160Q12769 1436 aa19.94■□□□□ 0.78
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.92■□□□□ 0.78
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 JPH4Q96JJ6 628 aa19.9■□□□□ 0.78
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 HFM1A2PYH4 1435 aa19.89■□□□□ 0.77
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.87■□□□□ 0.77
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NAIPQ13075 1403 aa19.86■□□□□ 0.77
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.85■□□□□ 0.77
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 NEUROD1Q13562 356 aa19.84■□□□□ 0.77
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.84■□□□□ 0.77
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.83■□□□□ 0.77
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MIA2Q96PC5 1412 aa19.83■□□□□ 0.76
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.81■□□□□ 0.76
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 MIER1Q8N108 512 aa19.79■□□□□ 0.76
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 UACAQ9BZF9 1416 aa19.78■□□□□ 0.76
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KDM6BO15054 1643 aa19.72■□□□□ 0.75
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 CHD1O14646 1710 aa19.72■□□□□ 0.75
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.72■□□□□ 0.75
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ABCA8O94911 1581 aa19.72■□□□□ 0.75
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 KIF14Q15058 1648 aa19.7■□□□□ 0.74
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DAPK1P53355 1430 aa19.7■□□□□ 0.74
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 AKNAQ7Z591 1439 aa19.7■□□□□ 0.74
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ABCC5O15440 1437 aa19.68■□□□□ 0.74
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.67■□□□□ 0.74
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 ATP10BO94823 1461 aa19.67■□□□□ 0.74
LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
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