RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 CEP170Q5SW79 1584 aa11.94□□□□□ -0.5
EFTUD2-210ENST00000588340 NUP160Q12769 1436 aa11.93□□□□□ -0.5
EFTUD2-210ENST00000588340 SHROOM2Q13796 1616 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-210ENST00000588340 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF27Q86VH2 1401 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-210ENST00000588340 CUL7Q14999 1698 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-210ENST00000588340 IGF1RP08069 1367 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-210ENST00000588340 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-210ENST00000588340 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-210ENST00000588340 JPH4Q96JJ6 628 aa11.81□□□□□ -0.52
EFTUD2-210ENST00000588340 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
EFTUD2-210ENST00000588340 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-210ENST00000588340 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.77□□□□□ -0.52
EFTUD2-210ENST00000588340 POTEHQ6S545 545 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-210ENST00000588340 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-210ENST00000588340 IQGAP2Q13576 1575 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-210ENST00000588340 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-210ENST00000588340 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-210ENST00000588340 ADRA2BP18089 450 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-210ENST00000588340 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-210ENST00000588340 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 PTPRGP23470 1445 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 MAPKBP1O60336 1514 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 DISP1Q96F81 1524 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 PRXQ9BXM0 1461 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 EEA1Q15075 1411 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-210ENST00000588340 KIAA0556O60303 1618 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-210ENST00000588340 DIP2BQ9P265 1576 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCC2Q92887 1545 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-210ENST00000588340 UACAQ9BZF9 1416 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-210ENST00000588340 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-210ENST00000588340 TSPOAP1O95153 1857 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-210ENST00000588340 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.54□□□□□ -0.56
EFTUD2-210ENST00000588340 GOLGA3Q08378 1498 aa11.52□□□□□ -0.56
EFTUD2-210ENST00000588340 ASXL2Q76L83 1435 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-210ENST00000588340 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-210ENST00000588340 GLI2P10070 1586 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF21BO75037 1637 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCA8O94911 1581 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-210ENST00000588340 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-210ENST00000588340 KDM6BO15054 1643 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-210ENST00000588340 SAMD9Q5K651 1589 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-210ENST00000588340 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-210ENST00000588340 P3H3Q8IVL6 736 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-210ENST00000588340 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-210ENST00000588340 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.38□□□□□ -0.59
EFTUD2-210ENST00000588340 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-210ENST00000588340 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNH8Q96L42 1107 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP10BO94823 1461 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-210ENST00000588340 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-210ENST00000588340 ARID3CA6NKF2 412 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-210ENST00000588340 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-210ENST00000588340 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-210ENST00000588340 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-210ENST00000588340 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-210ENST00000588340 CD109Q6YHK3 1445 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-210ENST00000588340 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-210ENST00000588340 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-210ENST00000588340 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-210ENST00000588340 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-210ENST00000588340 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-210ENST00000588340 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF39Q9H2S5 420 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-210ENST00000588340 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-210ENST00000588340 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-210ENST00000588340 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-210ENST00000588340 FMN1Q68DA7 1419 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-210ENST00000588340 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-210ENST00000588340 HECW1Q76N89 1606 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-210ENST00000588340 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-210ENST00000588340 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 ADGRL1O94910 1474 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 NEO1Q92859 1461 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.18□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 RAPGEF3O95398 923 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.16□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 RICTORQ6R327 1708 aa11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 FANCAO15360 1455 aa11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
EFTUD2-210ENST00000588340 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.15□□□□□ -0.63
EFTUD2-210ENST00000588340 AKNAQ7Z591 1439 aa11.14□□□□□ -0.63
EFTUD2-210ENST00000588340 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF14Q15058 1648 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms