RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588238.1

UBXN6-205, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

Gene UBXN6, Length 4,598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-205ENST00000588238 SMARCA4P51532 1647 aa21■□□□□ 0.95
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UBXN6-205ENST00000588238 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.84■□□□□ 0.93
UBXN6-205ENST00000588238 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.81■□□□□ 0.92
UBXN6-205ENST00000588238 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.76■□□□□ 0.91
UBXN6-205ENST00000588238 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
UBXN6-205ENST00000588238 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.7■□□□□ 0.91
UBXN6-205ENST00000588238 NCAPD3P42695 1498 aa20.7■□□□□ 0.9
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UBXN6-205ENST00000588238 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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UBXN6-205ENST00000588238 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.64■□□□□ 0.9
UBXN6-205ENST00000588238 SLC24A1O60721 1099 aa20.64■□□□□ 0.9
UBXN6-205ENST00000588238 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
UBXN6-205ENST00000588238 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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UBXN6-205ENST00000588238 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.61■□□□□ 0.89
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UBXN6-205ENST00000588238 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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UBXN6-205ENST00000588238 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.57■□□□□ 0.88
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UBXN6-205ENST00000588238 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
UBXN6-205ENST00000588238 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.51■□□□□ 0.87
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UBXN6-205ENST00000588238 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.48■□□□□ 0.87
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UBXN6-205ENST00000588238 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.46■□□□□ 0.87
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UBXN6-205ENST00000588238 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-205ENST00000588238 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-205ENST00000588238 TMC1Q8TDI8 760 aa20.44■□□□□ 0.86
UBXN6-205ENST00000588238 MIER1Q8N108 512 aa20.43■□□□□ 0.86
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UBXN6-205ENST00000588238 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.4■□□□□ 0.86
UBXN6-205ENST00000588238 GGT6Q6P531 493 aa20.39■□□□□ 0.85
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UBXN6-205ENST00000588238 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.38■□□□□ 0.85
UBXN6-205ENST00000588238 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.37■□□□□ 0.85
UBXN6-205ENST00000588238 BCL11AQ9H165 835 aa20.37■□□□□ 0.85
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UBXN6-205ENST00000588238 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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UBXN6-205ENST00000588238 CFTRP13569 1480 aa20.35■□□□□ 0.85
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UBXN6-205ENST00000588238 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.22■□□□□ 0.83
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UBXN6-205ENST00000588238 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.05■□□□□ 0.8
UBXN6-205ENST00000588238 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.04■□□□□ 0.8
UBXN6-205ENST00000588238 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
UBXN6-205ENST00000588238 CFAP53Q96M91 514 aa20.04■□□□□ 0.8
UBXN6-205ENST00000588238 A0A0G2JS52 829 aa20.03■□□□□ 0.8
UBXN6-205ENST00000588238 TMF1P82094 1093 aa20.03■□□□□ 0.8
UBXN6-205ENST00000588238 STK26Q9P289 416 aa20.03■□□□□ 0.8
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UBXN6-205ENST00000588238 IFT140Q96RY7 1462 aa20.02■□□□□ 0.8
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