RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586407.1

LIG3-208, Transcript of DNA ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene LIG3, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG3-208ENST00000586407 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.12■■■■■ 5.29
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LIG3-208ENST00000586407 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
LIG3-208ENST00000586407 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.79■■■■■ 5.24
LIG3-208ENST00000586407 IQGAP2Q13576 1575 aa47.73■■■■■ 5.23
LIG3-208ENST00000586407 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.52■■■■■ 5.2
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LIG3-208ENST00000586407 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.47■■■■■ 5.19
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LIG3-208ENST00000586407 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.4■■■■■ 5.18
LIG3-208ENST00000586407 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.39■■■■■ 5.18
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LIG3-208ENST00000586407 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.3■■■■■ 5.16
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LIG3-208ENST00000586407 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
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LIG3-208ENST00000586407 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.19■■■■■ 5.14
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LIG3-208ENST00000586407 UACAQ9BZF9 1416 aa47.09■■■■■ 5.13
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LIG3-208ENST00000586407 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.08■■■■■ 5.13
LIG3-208ENST00000586407 DIP2BQ9P265 1576 aa47.07■■■■■ 5.12
LIG3-208ENST00000586407 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.04■■■■■ 5.12
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LIG3-208ENST00000586407 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.02■■■■■ 5.12
LIG3-208ENST00000586407 PLB1Q6P1J6 1458 aa46.9■■■■■ 5.1
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LIG3-208ENST00000586407 ASXL2Q76L83 1435 aa46.87■■■■■ 5.09
LIG3-208ENST00000586407 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.85■■■■■ 5.09
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LIG3-208ENST00000586407 ABCA8O94911 1581 aa46.81■■■■■ 5.08
LIG3-208ENST00000586407 SAMD9Q5K651 1589 aa46.8■■■■■ 5.08
LIG3-208ENST00000586407 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.78■■■■■ 5.08
LIG3-208ENST00000586407 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.76■■■■■ 5.08
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LIG3-208ENST00000586407 KDM6BO15054 1643 aa46.45■■■■■ 5.03
LIG3-208ENST00000586407 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.45■■■■■ 5.03
LIG3-208ENST00000586407 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.41■■■■■ 5.02
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LIG3-208ENST00000586407 CD109Q6YHK3 1445 aa46.14■■■■■ 4.98
LIG3-208ENST00000586407 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
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LIG3-208ENST00000586407 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
LIG3-208ENST00000586407 HECW1Q76N89 1606 aa45.9■■■■■ 4.94
LIG3-208ENST00000586407 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.88■■■■■ 4.94
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LIG3-208ENST00000586407 CLIP1P30622 1438 aa45.71■■■■■ 4.91
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LIG3-208ENST00000586407 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.59■■■■■ 4.89
LIG3-208ENST00000586407 KIF14Q15058 1648 aa45.55■■■■■ 4.88
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LIG3-208ENST00000586407 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.18■■■■■ 4.82
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