RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586291.1

REXO1-202, Transcript of RNA exonuclease 1 homolog, humanhuman

TSL 3

Gene REXO1, Length 544 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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REXO1-202ENST00000586291 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
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REXO1-202ENST00000586291 CD109Q6YHK3 1445 aa26.92■■□□□ 1.9
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REXO1-202ENST00000586291 KIF21BO75037 1637 aa26.9■■□□□ 1.9
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REXO1-202ENST00000586291 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
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REXO1-202ENST00000586291 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.54■■□□□ 1.84
REXO1-202ENST00000586291 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
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REXO1-202ENST00000586291 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.48■■□□□ 1.83
REXO1-202ENST00000586291 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.45■■□□□ 1.82
REXO1-202ENST00000586291 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.45■■□□□ 1.82
REXO1-202ENST00000586291 FMN1Q68DA7 1419 aa26.43■■□□□ 1.82
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REXO1-202ENST00000586291 FBXO41Q8TF61 875 aa26.42■■□□□ 1.82
REXO1-202ENST00000586291 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.42■■□□□ 1.82
REXO1-202ENST00000586291 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
REXO1-202ENST00000586291 HECW1Q76N89 1606 aa26.4■■□□□ 1.82
REXO1-202ENST00000586291 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
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REXO1-202ENST00000586291 MADDQ8WXG6 1647 aa26.36■■□□□ 1.81
REXO1-202ENST00000586291 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
REXO1-202ENST00000586291 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.34■■□□□ 1.81
REXO1-202ENST00000586291 AKNAQ7Z591 1439 aa26.33■■□□□ 1.81
REXO1-202ENST00000586291 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.33■■□□□ 1.81
REXO1-202ENST00000586291 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.33■■□□□ 1.81
REXO1-202ENST00000586291 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.33■■□□□ 1.8
REXO1-202ENST00000586291 RICTORQ6R327 1708 aa26.32■■□□□ 1.8
REXO1-202ENST00000586291 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
REXO1-202ENST00000586291 FANCAO15360 1455 aa26.3■■□□□ 1.8
REXO1-202ENST00000586291 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.3■■□□□ 1.8
REXO1-202ENST00000586291 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.24■■□□□ 1.79
REXO1-202ENST00000586291 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
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REXO1-202ENST00000586291 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.22■■□□□ 1.79
REXO1-202ENST00000586291 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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