RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585730.5

SEH1L-203, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 2

Gene SEH1L, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-203ENST00000585730 CUL7Q14999 1698 aa30.65■■■□□ 2.5
SEH1L-203ENST00000585730 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.63■■■□□ 2.49
SEH1L-203ENST00000585730 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.61■■■□□ 2.49
SEH1L-203ENST00000585730 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.56■■■□□ 2.48
SEH1L-203ENST00000585730 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.46
SEH1L-203ENST00000585730 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
SEH1L-203ENST00000585730 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.34■■■□□ 2.45
SEH1L-203ENST00000585730 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.3■■■□□ 2.44
SEH1L-203ENST00000585730 IQGAP2Q13576 1575 aa30.29■■■□□ 2.44
SEH1L-203ENST00000585730 PTPRGP23470 1445 aa30.29■■■□□ 2.44
SEH1L-203ENST00000585730 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.25■■■□□ 2.43
SEH1L-203ENST00000585730 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.23■■■□□ 2.43
SEH1L-203ENST00000585730 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.19■■■□□ 2.42
SEH1L-203ENST00000585730 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.15■■■□□ 2.42
SEH1L-203ENST00000585730 MAPKBP1O60336 1514 aa30.14■■■□□ 2.42
SEH1L-203ENST00000585730 DISP1Q96F81 1524 aa30.12■■■□□ 2.41
SEH1L-203ENST00000585730 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.12■■■□□ 2.41
SEH1L-203ENST00000585730 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.09■■■□□ 2.41
SEH1L-203ENST00000585730 PRXQ9BXM0 1461 aa30.06■■■□□ 2.4
SEH1L-203ENST00000585730 UACAQ9BZF9 1416 aa30.03■■■□□ 2.4
SEH1L-203ENST00000585730 ABCC2Q92887 1545 aa30.02■■■□□ 2.4
SEH1L-203ENST00000585730 DIP2BQ9P265 1576 aa30.02■■■□□ 2.4
SEH1L-203ENST00000585730 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.01■■■□□ 2.39
SEH1L-203ENST00000585730 KIAA0556O60303 1618 aa30■■■□□ 2.39
SEH1L-203ENST00000585730 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30■■■□□ 2.39
SEH1L-203ENST00000585730 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.98■■■□□ 2.39
SEH1L-203ENST00000585730 ASXL2Q76L83 1435 aa29.93■■■□□ 2.38
SEH1L-203ENST00000585730 GOLGA3Q08378 1498 aa29.93■■■□□ 2.38
SEH1L-203ENST00000585730 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.89■■■□□ 2.38
SEH1L-203ENST00000585730 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SEH1L-203ENST00000585730 TSPOAP1O95153 1857 aa29.86■■■□□ 2.37
SEH1L-203ENST00000585730 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.85■■■□□ 2.37
SEH1L-203ENST00000585730 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
SEH1L-203ENST00000585730 EEA1Q15075 1411 aa29.84■■■□□ 2.37
SEH1L-203ENST00000585730 P3H3Q8IVL6 736 aa29.82■■■□□ 2.36
SEH1L-203ENST00000585730 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
SEH1L-203ENST00000585730 GLI2P10070 1586 aa29.74■■■□□ 2.35
SEH1L-203ENST00000585730 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
SEH1L-203ENST00000585730 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SEH1L-203ENST00000585730 KDM6BO15054 1643 aa29.72■■■□□ 2.35
SEH1L-203ENST00000585730 ABCA8O94911 1581 aa29.7■■■□□ 2.35
SEH1L-203ENST00000585730 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.69■■■□□ 2.34
SEH1L-203ENST00000585730 ARID3CA6NKF2 412 aa29.66■■■□□ 2.34
SEH1L-203ENST00000585730 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.66■■■□□ 2.34
SEH1L-203ENST00000585730 KCNH8Q96L42 1107 aa29.65■■■□□ 2.34
SEH1L-203ENST00000585730 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
SEH1L-203ENST00000585730 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.6■■■□□ 2.33
SEH1L-203ENST00000585730 SAMD9Q5K651 1589 aa29.59■■■□□ 2.33
SEH1L-203ENST00000585730 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.59■■■□□ 2.33
SEH1L-203ENST00000585730 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.55■■■□□ 2.32
SEH1L-203ENST00000585730 KIF21BO75037 1637 aa29.54■■■□□ 2.32
SEH1L-203ENST00000585730 ATP10BO94823 1461 aa29.51■■■□□ 2.31
SEH1L-203ENST00000585730 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
SEH1L-203ENST00000585730 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
SEH1L-203ENST00000585730 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SEH1L-203ENST00000585730 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.49■■■□□ 2.31
SEH1L-203ENST00000585730 CD109Q6YHK3 1445 aa29.49■■■□□ 2.31
SEH1L-203ENST00000585730 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.46■■■□□ 2.31
SEH1L-203ENST00000585730 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
SEH1L-203ENST00000585730 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.41■■■□□ 2.3
SEH1L-203ENST00000585730 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.39■■■□□ 2.3
SEH1L-203ENST00000585730 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.37■■■□□ 2.29
SEH1L-203ENST00000585730 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.37■■■□□ 2.29
SEH1L-203ENST00000585730 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SEH1L-203ENST00000585730 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.3■■■□□ 2.28
SEH1L-203ENST00000585730 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
SEH1L-203ENST00000585730 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.24■■■□□ 2.27
SEH1L-203ENST00000585730 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.18■■■□□ 2.26
SEH1L-203ENST00000585730 ADGRL1O94910 1474 aa29.17■■■□□ 2.26
SEH1L-203ENST00000585730 FMN1Q68DA7 1419 aa29.16■■■□□ 2.26
SEH1L-203ENST00000585730 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.15■■■□□ 2.26
SEH1L-203ENST00000585730 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.15■■■□□ 2.26
SEH1L-203ENST00000585730 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
SEH1L-203ENST00000585730 NEO1Q92859 1461 aa29.1■■■□□ 2.25
SEH1L-203ENST00000585730 RAPGEF3O95398 923 aa29.1■■■□□ 2.25
SEH1L-203ENST00000585730 HECW1Q76N89 1606 aa29.05■■■□□ 2.24
SEH1L-203ENST00000585730 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.04■■■□□ 2.242e-7■■■■□ 26.2
SEH1L-203ENST00000585730 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SEH1L-203ENST00000585730 FANCAO15360 1455 aa28.98■■■□□ 2.23
SEH1L-203ENST00000585730 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.98■■■□□ 2.23
SEH1L-203ENST00000585730 AKNAQ7Z591 1439 aa28.98■■■□□ 2.23
SEH1L-203ENST00000585730 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
SEH1L-203ENST00000585730 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.91■■■□□ 2.22
SEH1L-203ENST00000585730 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.9■■■□□ 2.22
SEH1L-203ENST00000585730 PLCH2O75038 1416 aa28.89■■■□□ 2.22
SEH1L-203ENST00000585730 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SEH1L-203ENST00000585730 CLIP1P30622 1438 aa28.87■■■□□ 2.21
SEH1L-203ENST00000585730 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
SEH1L-203ENST00000585730 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.86■■■□□ 2.21
SEH1L-203ENST00000585730 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.85■■■□□ 2.21
SEH1L-203ENST00000585730 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
SEH1L-203ENST00000585730 KIF14Q15058 1648 aa28.83■■■□□ 2.21
SEH1L-203ENST00000585730 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.83■■■□□ 2.21
SEH1L-203ENST00000585730 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.82■■■□□ 2.2
SEH1L-203ENST00000585730 RICTORQ6R327 1708 aa28.81■■■□□ 2.2
SEH1L-203ENST00000585730 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.79■■■□□ 2.2
SEH1L-203ENST00000585730 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.78■■■□□ 2.2
SEH1L-203ENST00000585730 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.74■■■□□ 2.19
SEH1L-203ENST00000585730 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.74■■■□□ 2.19
SEH1L-203ENST00000585730 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.74■■■□□ 2.19
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