RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.71■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.64■■□□□ 1.54
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.64■■□□□ 1.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.538e-8■■■■□ 21.3
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.6■■□□□ 1.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.58■■□□□ 1.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.58■■□□□ 1.53
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SAMD9Q5K651 1589 aa24.56■■□□□ 1.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.56■■□□□ 1.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PBRM1Q86U86 1689 aa24.55■■□□□ 1.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.52■■□□□ 1.52
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FMN1Q68DA7 1419 aa24.51■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 P3H3Q8IVL6 736 aa24.51■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.46■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.46■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADAMTS12P58397 1594 aa24.41■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.4■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR62O43379 1518 aa24.39■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRIN2BQ13224 1484 aa24.35■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFT140Q96RY7 1462 aa24.34■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.32■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IQGAP2Q13576 1575 aa24.31■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ITGAEP38570 1179 aa24.31■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.29■■□□□ 1.48
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.23■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAPKBP1O60336 1514 aa24.22■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.22■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.22■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.21■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HECW1Q76N89 1606 aa24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.19■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCOA2Q15596 1464 aa24.16■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGEF11O15085 1522 aa24.15■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.13■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.11■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERCC6Q03468 1493 aa24.11■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GRIN2AQ12879 1464 aa24.07■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIAA0556O60303 1618 aa24.07■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.06■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DISP1Q96F81 1524 aa24.02■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HFM1A2PYH4 1435 aa24.02■■□□□ 1.44
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPRKQ15262 1439 aa24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MIER1Q8N108 512 aa23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEUROD1Q13562 356 aa23.98■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SYNJ2O15056 1496 aa23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.95■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.94■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEP170Q5SW79 1584 aa23.93■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NAIPQ13075 1403 aa23.93■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MIA2Q96PC5 1412 aa23.93■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UACAQ9BZF9 1416 aa23.92■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.91■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AKNAQ7Z591 1439 aa23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUP160Q12769 1436 aa23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.75■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.74■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARID3CA6NKF2 412 aa23.73■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.71■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDM6BO15054 1643 aa23.7■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DAPK1P53355 1430 aa23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ROCK1Q13464 1354 aa23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 JPH4Q96JJ6 628 aa23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TONSLQ96HA7 1378 aa23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBLN2P98095 1184 aa23.68■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.67■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.66■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCA8O94911 1581 aa23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms