RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585047.5

THRA-210, Transcript of thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

TSL 4

Gene THRA, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRA-210ENST00000585047 JPH4Q96JJ6 628 aa42.42■■■■■ 4.38
THRA-210ENST00000585047 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
THRA-210ENST00000585047 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.36■■■■■ 4.37
THRA-210ENST00000585047 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
THRA-210ENST00000585047 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.14■■■■■ 4.34
THRA-210ENST00000585047 IQGAP2Q13576 1575 aa42.03■■■■■ 4.32
THRA-210ENST00000585047 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.9■■■■■ 4.3
THRA-210ENST00000585047 PRXQ9BXM0 1461 aa41.9■■■■■ 4.3
THRA-210ENST00000585047 PTPRGP23470 1445 aa41.82■■■■■ 4.29
THRA-210ENST00000585047 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.81■■■■■ 4.28
THRA-210ENST00000585047 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.8■■■■■ 4.28
THRA-210ENST00000585047 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.8■■■■■ 4.28
THRA-210ENST00000585047 DISP1Q96F81 1524 aa41.79■■■■■ 4.28
THRA-210ENST00000585047 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.72■■■■■ 4.27
THRA-210ENST00000585047 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.72■■■■■ 4.27
THRA-210ENST00000585047 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.72■■■■■ 4.27
THRA-210ENST00000585047 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
THRA-210ENST00000585047 EEA1Q15075 1411 aa41.68■■■■■ 4.26
THRA-210ENST00000585047 KIAA0556O60303 1618 aa41.65■■■■■ 4.26
THRA-210ENST00000585047 MAPKBP1O60336 1514 aa41.64■■■■■ 4.26
THRA-210ENST00000585047 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.57■■■■■ 4.25
THRA-210ENST00000585047 UACAQ9BZF9 1416 aa41.53■■■■■ 4.24
THRA-210ENST00000585047 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.53■■■■■ 4.24
THRA-210ENST00000585047 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.53■■■■■ 4.24
THRA-210ENST00000585047 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.53■■■■■ 4.24
THRA-210ENST00000585047 ABCC2Q92887 1545 aa41.52■■■■■ 4.24
THRA-210ENST00000585047 GOLGA3Q08378 1498 aa41.51■■■■■ 4.24
THRA-210ENST00000585047 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
THRA-210ENST00000585047 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.44■■■■■ 4.22
THRA-210ENST00000585047 DIP2BQ9P265 1576 aa41.43■■■■■ 4.22
THRA-210ENST00000585047 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.34■■■■■ 4.21
THRA-210ENST00000585047 ASXL2Q76L83 1435 aa41.31■■■■■ 4.2
THRA-210ENST00000585047 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.29■■■■■ 4.2
THRA-210ENST00000585047 KIF21BO75037 1637 aa41.29■■■■■ 4.2
THRA-210ENST00000585047 ABCA8O94911 1581 aa41.23■■■■■ 4.19
THRA-210ENST00000585047 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
THRA-210ENST00000585047 SAMD9Q5K651 1589 aa41.21■■■■■ 4.19
THRA-210ENST00000585047 P3H3Q8IVL6 736 aa41.19■■■■■ 4.18
THRA-210ENST00000585047 GLI2P10070 1586 aa41.11■■■■■ 4.17
THRA-210ENST00000585047 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
THRA-210ENST00000585047 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
THRA-210ENST00000585047 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.02■■■■■ 4.16
THRA-210ENST00000585047 TSPOAP1O95153 1857 aa41.02■■■■■ 4.16
THRA-210ENST00000585047 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.98■■■■■ 4.15
THRA-210ENST00000585047 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.96■■■■■ 4.15
THRA-210ENST00000585047 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
THRA-210ENST00000585047 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.93■■■■■ 4.14
THRA-210ENST00000585047 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
THRA-210ENST00000585047 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.89■■■■■ 4.14
THRA-210ENST00000585047 ATP10BO94823 1461 aa40.89■■■■■ 4.14
THRA-210ENST00000585047 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.89■■■■■ 4.14
THRA-210ENST00000585047 KDM6BO15054 1643 aa40.87■■■■■ 4.13
THRA-210ENST00000585047 ARID3CA6NKF2 412 aa40.87■■■■■ 4.13
THRA-210ENST00000585047 KCNH8Q96L42 1107 aa40.79■■■■■ 4.12
THRA-210ENST00000585047 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
THRA-210ENST00000585047 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.74■■■■■ 4.11
THRA-210ENST00000585047 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.69■■■■■ 4.1
THRA-210ENST00000585047 CD109Q6YHK3 1445 aa40.68■■■■■ 4.1
THRA-210ENST00000585047 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.68■■■■■ 4.1
THRA-210ENST00000585047 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
THRA-210ENST00000585047 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
THRA-210ENST00000585047 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.63■■■■■ 4.1
THRA-210ENST00000585047 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
THRA-210ENST00000585047 FMN1Q68DA7 1419 aa40.56■■■■■ 4.08
THRA-210ENST00000585047 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.53■■■■■ 4.08
THRA-210ENST00000585047 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.47■■■■■ 4.07
THRA-210ENST00000585047 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
THRA-210ENST00000585047 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
THRA-210ENST00000585047 HECW1Q76N89 1606 aa40.42■■■■■ 4.06
THRA-210ENST00000585047 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
THRA-210ENST00000585047 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.3■■■■■ 4.04
THRA-210ENST00000585047 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.28■■■■■ 4.04
THRA-210ENST00000585047 CLIP1P30622 1438 aa40.27■■■■■ 4.04
THRA-210ENST00000585047 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.04
THRA-210ENST00000585047 NEO1Q92859 1461 aa40.26■■■■■ 4.04
THRA-210ENST00000585047 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.21■■■■■ 4.03
THRA-210ENST00000585047 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.21■■■■■ 4.03
THRA-210ENST00000585047 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
THRA-210ENST00000585047 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.19■■■■■ 4.02
THRA-210ENST00000585047 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
THRA-210ENST00000585047 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.16■■■■■ 4.02
THRA-210ENST00000585047 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
THRA-210ENST00000585047 FANCAO15360 1455 aa40.09■■■■■ 4.01
THRA-210ENST00000585047 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.08■■■■■ 4.01
THRA-210ENST00000585047 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.08■■■■■ 4.01
THRA-210ENST00000585047 RAPGEF3O95398 923 aa40.07■■■■■ 4.01
THRA-210ENST00000585047 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.06■■■■■ 4
THRA-210ENST00000585047 AKNAQ7Z591 1439 aa40.05■■■■■ 4
THRA-210ENST00000585047 ADGRL1O94910 1474 aa40.04■■■■■ 4
THRA-210ENST00000585047 KIF14Q15058 1648 aa40.03■■■■■ 4
THRA-210ENST00000585047 PLCH2O75038 1416 aa40.03■■■■■ 4
THRA-210ENST00000585047 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.01■■■■■ 4
THRA-210ENST00000585047 CEP162Q5TB80 1403 aa39.99■■■■□ 3.99
THRA-210ENST00000585047 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
THRA-210ENST00000585047 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.92■■■■□ 3.98
THRA-210ENST00000585047 RICTORQ6R327 1708 aa39.88■■■■□ 3.98
THRA-210ENST00000585047 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.86■■■■□ 3.97
THRA-210ENST00000585047 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.86■■■■□ 3.97
THRA-210ENST00000585047 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.82■■■■□ 3.97
THRA-210ENST00000585047 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.8■■■■□ 3.96
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