RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584747.5

BMS1P4-202, Transcript of BMS1, ribosome biogenesis factor pseudogene 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BMS1P4, Length 1,716 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMS1P4-202ENST00000584747 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.59■■■□□ 2.33
BMS1P4-202ENST00000584747 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.41■■■□□ 2.3
BMS1P4-202ENST00000584747 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
BMS1P4-202ENST00000584747 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
BMS1P4-202ENST00000584747 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.33■■■□□ 2.29
BMS1P4-202ENST00000584747 JPH4Q96JJ6 628 aa29.31■■■□□ 2.28
BMS1P4-202ENST00000584747 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.24■■■□□ 2.27
BMS1P4-202ENST00000584747 IQGAP2Q13576 1575 aa29.24■■■□□ 2.27
BMS1P4-202ENST00000584747 EEA1Q15075 1411 aa29.2■■■□□ 2.26
BMS1P4-202ENST00000584747 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.19■■■□□ 2.26
BMS1P4-202ENST00000584747 PRXQ9BXM0 1461 aa29.1■■■□□ 2.25
BMS1P4-202ENST00000584747 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
BMS1P4-202ENST00000584747 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.09■■■□□ 2.25
BMS1P4-202ENST00000584747 DISP1Q96F81 1524 aa29.04■■■□□ 2.24
BMS1P4-202ENST00000584747 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.02■■■□□ 2.24
BMS1P4-202ENST00000584747 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.99■■■□□ 2.23
BMS1P4-202ENST00000584747 KIAA0556O60303 1618 aa28.99■■■□□ 2.23
BMS1P4-202ENST00000584747 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.99■■■□□ 2.23
BMS1P4-202ENST00000584747 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.95■■■□□ 2.23
BMS1P4-202ENST00000584747 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.94■■■□□ 2.22
BMS1P4-202ENST00000584747 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
BMS1P4-202ENST00000584747 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.91■■■□□ 2.22
BMS1P4-202ENST00000584747 PTPRGP23470 1445 aa28.91■■■□□ 2.22
BMS1P4-202ENST00000584747 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
BMS1P4-202ENST00000584747 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.89■■■□□ 2.21
BMS1P4-202ENST00000584747 MAPKBP1O60336 1514 aa28.85■■■□□ 2.21
BMS1P4-202ENST00000584747 KIF21BO75037 1637 aa28.8■■■□□ 2.2
BMS1P4-202ENST00000584747 GOLGA3Q08378 1498 aa28.79■■■□□ 2.2
BMS1P4-202ENST00000584747 DIP2BQ9P265 1576 aa28.78■■■□□ 2.2
BMS1P4-202ENST00000584747 ABCC2Q92887 1545 aa28.77■■■□□ 2.2
BMS1P4-202ENST00000584747 UACAQ9BZF9 1416 aa28.74■■■□□ 2.19
BMS1P4-202ENST00000584747 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.73■■■□□ 2.19
BMS1P4-202ENST00000584747 SAMD9Q5K651 1589 aa28.72■■■□□ 2.19
BMS1P4-202ENST00000584747 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.19
BMS1P4-202ENST00000584747 HRCP23327 699 aa28.72■■■□□ 2.19
BMS1P4-202ENST00000584747 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.71■■■□□ 2.19
BMS1P4-202ENST00000584747 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
BMS1P4-202ENST00000584747 CEP162Q5TB80 1403 aa28.7■■■□□ 2.18
BMS1P4-202ENST00000584747 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.69■■■□□ 2.18
BMS1P4-202ENST00000584747 TSPOAP1O95153 1857 aa28.68■■■□□ 2.18
BMS1P4-202ENST00000584747 ABCA8O94911 1581 aa28.65■■■□□ 2.18
BMS1P4-202ENST00000584747 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.64■■■□□ 2.18
BMS1P4-202ENST00000584747 ASXL2Q76L83 1435 aa28.6■■■□□ 2.17
BMS1P4-202ENST00000584747 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.6■■■□□ 2.17
BMS1P4-202ENST00000584747 P3H3Q8IVL6 736 aa28.6■■■□□ 2.17
BMS1P4-202ENST00000584747 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
BMS1P4-202ENST00000584747 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
BMS1P4-202ENST00000584747 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
BMS1P4-202ENST00000584747 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.49■■■□□ 2.15
BMS1P4-202ENST00000584747 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.48■■■□□ 2.15
BMS1P4-202ENST00000584747 GLI2P10070 1586 aa28.47■■■□□ 2.15
BMS1P4-202ENST00000584747 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
BMS1P4-202ENST00000584747 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.44■■■□□ 2.14
BMS1P4-202ENST00000584747 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.44■■■□□ 2.14
BMS1P4-202ENST00000584747 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.42■■■□□ 2.14
BMS1P4-202ENST00000584747 ARID3CA6NKF2 412 aa28.39■■■□□ 2.14
BMS1P4-202ENST00000584747 ATP10BO94823 1461 aa28.35■■■□□ 2.13
BMS1P4-202ENST00000584747 KDM6BO15054 1643 aa28.35■■■□□ 2.13
BMS1P4-202ENST00000584747 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
BMS1P4-202ENST00000584747 CLIP1P30622 1438 aa28.33■■■□□ 2.13
BMS1P4-202ENST00000584747 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.32■■■□□ 2.12
BMS1P4-202ENST00000584747 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.31■■■□□ 2.12
BMS1P4-202ENST00000584747 KCNH8Q96L42 1107 aa28.22■■■□□ 2.11
BMS1P4-202ENST00000584747 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.22■■■□□ 2.11
BMS1P4-202ENST00000584747 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
BMS1P4-202ENST00000584747 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.19■■■□□ 2.1
BMS1P4-202ENST00000584747 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.17■■■□□ 2.1
BMS1P4-202ENST00000584747 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
BMS1P4-202ENST00000584747 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
BMS1P4-202ENST00000584747 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.14■■■□□ 2.1
BMS1P4-202ENST00000584747 HECW1Q76N89 1606 aa28.14■■■□□ 2.1
BMS1P4-202ENST00000584747 CD109Q6YHK3 1445 aa28.13■■■□□ 2.09
BMS1P4-202ENST00000584747 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
BMS1P4-202ENST00000584747 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
BMS1P4-202ENST00000584747 FMN1Q68DA7 1419 aa28.11■■■□□ 2.09
BMS1P4-202ENST00000584747 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.11■■■□□ 2.09
BMS1P4-202ENST00000584747 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
BMS1P4-202ENST00000584747 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
BMS1P4-202ENST00000584747 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.04■■■□□ 2.08
BMS1P4-202ENST00000584747 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28■■■□□ 2.07
BMS1P4-202ENST00000584747 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
BMS1P4-202ENST00000584747 KIF14Q15058 1648 aa27.95■■■□□ 2.07
BMS1P4-202ENST00000584747 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.94■■■□□ 2.06
BMS1P4-202ENST00000584747 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.91■■■□□ 2.06
BMS1P4-202ENST00000584747 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.88■■■□□ 2.05
BMS1P4-202ENST00000584747 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.88■■■□□ 2.05
BMS1P4-202ENST00000584747 APLP2Q06481 763 aa27.87■■■□□ 2.05
BMS1P4-202ENST00000584747 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.86■■■□□ 2.05
BMS1P4-202ENST00000584747 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.86■■■□□ 2.05
BMS1P4-202ENST00000584747 NEO1Q92859 1461 aa27.85■■■□□ 2.05
BMS1P4-202ENST00000584747 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.82■■■□□ 2.04
BMS1P4-202ENST00000584747 RICTORQ6R327 1708 aa27.82■■■□□ 2.04
BMS1P4-202ENST00000584747 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.82■■■□□ 2.04
BMS1P4-202ENST00000584747 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
BMS1P4-202ENST00000584747 FANCAO15360 1455 aa27.79■■■□□ 2.04
BMS1P4-202ENST00000584747 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.76■■■□□ 2.04
BMS1P4-202ENST00000584747 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.74■■■□□ 2.03
BMS1P4-202ENST00000584747 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.73■■■□□ 2.03
BMS1P4-202ENST00000584747 RAPGEF3O95398 923 aa27.73■■■□□ 2.03
BMS1P4-202ENST00000584747 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms