RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584374.1

ITGB4-211, Transcript of integrin subunit beta 4, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB4, Length 950 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4-211ENST00000584374 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.84■■■□□ 2.21
ITGB4-211ENST00000584374 JPH4Q96JJ6 628 aa28.83■■■□□ 2.21
ITGB4-211ENST00000584374 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
ITGB4-211ENST00000584374 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.72■■■□□ 2.19
ITGB4-211ENST00000584374 PRXQ9BXM0 1461 aa28.63■■■□□ 2.17
ITGB4-211ENST00000584374 IQGAP2Q13576 1575 aa28.62■■■□□ 2.17
ITGB4-211ENST00000584374 DISP1Q96F81 1524 aa28.51■■■□□ 2.15
ITGB4-211ENST00000584374 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.5■■■□□ 2.15
ITGB4-211ENST00000584374 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
ITGB4-211ENST00000584374 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.46■■■□□ 2.15
ITGB4-211ENST00000584374 EEA1Q15075 1411 aa28.45■■■□□ 2.15
ITGB4-211ENST00000584374 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.45■■■□□ 2.15
ITGB4-211ENST00000584374 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.45■■■□□ 2.14
ITGB4-211ENST00000584374 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.45■■■□□ 2.14
ITGB4-211ENST00000584374 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.45■■■□□ 2.14
ITGB4-211ENST00000584374 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.43■■■□□ 2.14
ITGB4-211ENST00000584374 PTPRGP23470 1445 aa28.42■■■□□ 2.14
ITGB4-211ENST00000584374 KIAA0556O60303 1618 aa28.39■■■□□ 2.13
ITGB4-211ENST00000584374 MAPKBP1O60336 1514 aa28.32■■■□□ 2.12
ITGB4-211ENST00000584374 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ITGB4-211ENST00000584374 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ITGB4-211ENST00000584374 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.27■■■□□ 2.12
ITGB4-211ENST00000584374 UACAQ9BZF9 1416 aa28.25■■■□□ 2.11
ITGB4-211ENST00000584374 ABCC2Q92887 1545 aa28.24■■■□□ 2.11
ITGB4-211ENST00000584374 GOLGA3Q08378 1498 aa28.24■■■□□ 2.11
ITGB4-211ENST00000584374 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.22■■■□□ 2.11
ITGB4-211ENST00000584374 KIF21BO75037 1637 aa28.22■■■□□ 2.11
ITGB4-211ENST00000584374 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
ITGB4-211ENST00000584374 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.21■■■□□ 2.11
ITGB4-211ENST00000584374 DIP2BQ9P265 1576 aa28.16■■■□□ 2.1
ITGB4-211ENST00000584374 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.14■■■□□ 2.1
ITGB4-211ENST00000584374 SAMD9Q5K651 1589 aa28.14■■■□□ 2.1
ITGB4-211ENST00000584374 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.14■■■□□ 2.09
ITGB4-211ENST00000584374 ABCA8O94911 1581 aa28.11■■■□□ 2.09
ITGB4-211ENST00000584374 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.08■■■□□ 2.09
ITGB4-211ENST00000584374 ASXL2Q76L83 1435 aa28.08■■■□□ 2.09
ITGB4-211ENST00000584374 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
ITGB4-211ENST00000584374 P3H3Q8IVL6 736 aa28.02■■■□□ 2.08
ITGB4-211ENST00000584374 GLI2P10070 1586 aa27.95■■■□□ 2.07
ITGB4-211ENST00000584374 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.93■■■□□ 2.06
ITGB4-211ENST00000584374 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
ITGB4-211ENST00000584374 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.92■■■□□ 2.06
ITGB4-211ENST00000584374 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
ITGB4-211ENST00000584374 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.91■■■□□ 2.06
ITGB4-211ENST00000584374 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.9■■■□□ 2.06
ITGB4-211ENST00000584374 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.86■■■□□ 2.05
ITGB4-211ENST00000584374 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
ITGB4-211ENST00000584374 ATP10BO94823 1461 aa27.86■■■□□ 2.05
ITGB4-211ENST00000584374 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
ITGB4-211ENST00000584374 TSPOAP1O95153 1857 aa27.83■■■□□ 2.04
ITGB4-211ENST00000584374 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.82■■■□□ 2.04
ITGB4-211ENST00000584374 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
ITGB4-211ENST00000584374 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.8■■■□□ 2.04
ITGB4-211ENST00000584374 ARID3CA6NKF2 412 aa27.78■■■□□ 2.04
ITGB4-211ENST00000584374 KDM6BO15054 1643 aa27.71■■■□□ 2.03
ITGB4-211ENST00000584374 KCNH8Q96L42 1107 aa27.67■■■□□ 2.02
ITGB4-211ENST00000584374 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.66■■■□□ 2.02
ITGB4-211ENST00000584374 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.64■■■□□ 2.02
ITGB4-211ENST00000584374 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.64■■■□□ 2.01
ITGB4-211ENST00000584374 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
ITGB4-211ENST00000584374 FMN1Q68DA7 1419 aa27.63■■■□□ 2.01
ITGB4-211ENST00000584374 CD109Q6YHK3 1445 aa27.63■■■□□ 2.01
ITGB4-211ENST00000584374 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.59■■■□□ 2.01
ITGB4-211ENST00000584374 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
ITGB4-211ENST00000584374 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ITGB4-211ENST00000584374 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
ITGB4-211ENST00000584374 HECW1Q76N89 1606 aa27.55■■■□□ 2
ITGB4-211ENST00000584374 CLIP1P30622 1438 aa27.49■■□□□ 1.99
ITGB4-211ENST00000584374 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.48■■□□□ 1.99
ITGB4-211ENST00000584374 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.45■■□□□ 1.99
ITGB4-211ENST00000584374 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
ITGB4-211ENST00000584374 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.44■■□□□ 1.98
ITGB4-211ENST00000584374 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.43■■□□□ 1.98
ITGB4-211ENST00000584374 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.41■■□□□ 1.98
ITGB4-211ENST00000584374 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
ITGB4-211ENST00000584374 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.4■■□□□ 1.98
ITGB4-211ENST00000584374 NEO1Q92859 1461 aa27.37■■□□□ 1.97
ITGB4-211ENST00000584374 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.35■■□□□ 1.97
ITGB4-211ENST00000584374 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.35■■□□□ 1.97
ITGB4-211ENST00000584374 CEP162Q5TB80 1403 aa27.33■■□□□ 1.97
ITGB4-211ENST00000584374 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
ITGB4-211ENST00000584374 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.32■■□□□ 1.96
ITGB4-211ENST00000584374 KIF14Q15058 1648 aa27.31■■□□□ 1.96
ITGB4-211ENST00000584374 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.28■■□□□ 1.96
ITGB4-211ENST00000584374 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
ITGB4-211ENST00000584374 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.27■■□□□ 1.96
ITGB4-211ENST00000584374 FANCAO15360 1455 aa27.27■■□□□ 1.96
ITGB4-211ENST00000584374 PLCH2O75038 1416 aa27.25■■□□□ 1.95
ITGB4-211ENST00000584374 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.25■■□□□ 1.95
ITGB4-211ENST00000584374 AKNAQ7Z591 1439 aa27.24■■□□□ 1.95
ITGB4-211ENST00000584374 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.22■■□□□ 1.95
ITGB4-211ENST00000584374 RAPGEF3O95398 923 aa27.21■■□□□ 1.95
ITGB4-211ENST00000584374 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ITGB4-211ENST00000584374 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.18■■□□□ 1.94
ITGB4-211ENST00000584374 RICTORQ6R327 1708 aa27.16■■□□□ 1.94
ITGB4-211ENST00000584374 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
ITGB4-211ENST00000584374 ADGRL1O94910 1474 aa27.14■■□□□ 1.94
ITGB4-211ENST00000584374 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.09■■□□□ 1.93
ITGB4-211ENST00000584374 PREX2Q70Z35 1606 aa27.08■■□□□ 1.93
ITGB4-211ENST00000584374 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms