RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579814.1

LIMD2-208, Transcript of LIM domain containing 2, human

TSL 2

Gene LIMD2, Length 709 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LIMD2-208	ENST00000579814	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		44.45	■■■■■ 4.71
LIMD2-208	ENST00000579814	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		44.42	■■■■■ 4.7
LIMD2-208	ENST00000579814	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		44.4	■■■■■ 4.7
LIMD2-208	ENST00000579814	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	44.32	■■■■■ 4.69
LIMD2-208	ENST00000579814	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		44.26	■■■■■ 4.68
LIMD2-208	ENST00000579814	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		44.01	■■■■■ 4.64
LIMD2-208	ENST00000579814	IQGAP2	Q13576	1575 aa		44.01	■■■■■ 4.64
LIMD2-208	ENST00000579814	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		44	■■■■■ 4.63
LIMD2-208	ENST00000579814	PRX	Q9BXM0	1461 aa		43.98	■■■■■ 4.63
LIMD2-208	ENST00000579814	PTPRG	P23470	1445 aa		43.93	■■■■■ 4.62
LIMD2-208	ENST00000579814	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.93	■■■■■ 4.62
LIMD2-208	ENST00000579814	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.9	■■■■■ 4.62
LIMD2-208	ENST00000579814	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.89	■■■■■ 4.62
LIMD2-208	ENST00000579814	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		43.88	■■■■■ 4.62
LIMD2-208	ENST00000579814	EEA1	Q15075	1411 aa		43.87	■■■■■ 4.61
LIMD2-208	ENST00000579814	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		43.79	■■■■■ 4.6
LIMD2-208	ENST00000579814	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	43.77	■■■■■ 4.6
LIMD2-208	ENST00000579814	DISP1	Q96F81	1524 aa		43.77	■■■■■ 4.6
LIMD2-208	ENST00000579814	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.66	■■■■■ 4.58
LIMD2-208	ENST00000579814	GOLGA3	Q08378	1498 aa		43.59	■■■■■ 4.57
LIMD2-208	ENST00000579814	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		43.58	■■■■■ 4.57
LIMD2-208	ENST00000579814	UACA	Q9BZF9	1416 aa		43.57	■■■■■ 4.57
LIMD2-208	ENST00000579814	KIAA0556	O60303	1618 aa		43.56	■■■■■ 4.56
LIMD2-208	ENST00000579814	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.53	■■■■■ 4.56
LIMD2-208	ENST00000579814	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.51	■■■■■ 4.56
LIMD2-208	ENST00000579814	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		43.51	■■■■■ 4.56
LIMD2-208	ENST00000579814	ABCC2	Q92887	1545 aa		43.48	■■■■■ 4.55
LIMD2-208	ENST00000579814	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.45	■■■■■ 4.55
LIMD2-208	ENST00000579814	P3H3	Q8IVL6	736 aa		43.38	■■■■■ 4.53
LIMD2-208	ENST00000579814	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	43.29	■■■■■ 4.52
LIMD2-208	ENST00000579814	KIF21B	O75037	1637 aa		43.29	■■■■■ 4.52
LIMD2-208	ENST00000579814	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		43.28	■■■■■ 4.52
LIMD2-208	ENST00000579814	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		43.28	■■■■■ 4.52
LIMD2-208	ENST00000579814	ASXL2	Q76L83	1435 aa		43.28	■■■■■ 4.52
LIMD2-208	ENST00000579814	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.24	■■■■■ 4.51
LIMD2-208	ENST00000579814	DIP2B	Q9P265	1576 aa		43.24	■■■■■ 4.51
LIMD2-208	ENST00000579814	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	43.23	■■■■■ 4.51
LIMD2-208	ENST00000579814	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		43.23	■■■■■ 4.51
LIMD2-208	ENST00000579814	ABCA8	O94911	1581 aa		43.15	■■■■■ 4.5
LIMD2-208	ENST00000579814	SAMD9	Q5K651	1589 aa		43.12	■■■■■ 4.49
LIMD2-208	ENST00000579814	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	43.07	■■■■■ 4.48
LIMD2-208	ENST00000579814	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.99	■■■■■ 4.47
LIMD2-208	ENST00000579814	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.99	■■■■■ 4.47
LIMD2-208	ENST00000579814	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.99	■■■■■ 4.47
LIMD2-208	ENST00000579814	GLI2	P10070	1586 aa		42.99	■■■■■ 4.47
LIMD2-208	ENST00000579814	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.97	■■■■■ 4.47
LIMD2-208	ENST00000579814	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		42.93	■■■■■ 4.46
LIMD2-208	ENST00000579814	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.92	■■■■■ 4.46
LIMD2-208	ENST00000579814	ATP10B	O94823	1461 aa		42.9	■■■■■ 4.46
LIMD2-208	ENST00000579814	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
LIMD2-208	ENST00000579814	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
LIMD2-208	ENST00000579814	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LIMD2-208	ENST00000579814	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.81	■■■■■ 4.44
LIMD2-208	ENST00000579814	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
LIMD2-208	ENST00000579814	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		42.7	■■■■■ 4.43
LIMD2-208	ENST00000579814	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.69	■■■■■ 4.42
LIMD2-208	ENST00000579814	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.69	■■■■■ 4.42
LIMD2-208	ENST00000579814	KDM6B	O15054	1643 aa		42.68	■■■■■ 4.42
LIMD2-208	ENST00000579814	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.68	■■■■■ 4.42
LIMD2-208	ENST00000579814	FMN1	Q68DA7	1419 aa		42.65	■■■■■ 4.42
LIMD2-208	ENST00000579814	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		42.64	■■■■■ 4.42
LIMD2-208	ENST00000579814	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
LIMD2-208	ENST00000579814	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
LIMD2-208	ENST00000579814	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42.56	■■■■■ 4.4
LIMD2-208	ENST00000579814	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.5	■■■■■ 4.39
LIMD2-208	ENST00000579814	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.47	■■■■■ 4.39
LIMD2-208	ENST00000579814	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.4	■■■■■ 4.38
LIMD2-208	ENST00000579814	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
LIMD2-208	ENST00000579814	CLIP1	P30622	1438 aa		42.38	■■■■■ 4.38
LIMD2-208	ENST00000579814	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		42.37	■■■■■ 4.37
LIMD2-208	ENST00000579814	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
LIMD2-208	ENST00000579814	HECW1	Q76N89	1606 aa		42.35	■■■■■ 4.37
LIMD2-208	ENST00000579814	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.32	■■■■■ 4.37
LIMD2-208	ENST00000579814	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		42.25	■■■■■ 4.35
LIMD2-208	ENST00000579814	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		42.2	■■■■■ 4.35
LIMD2-208	ENST00000579814	NEO1	Q92859	1461 aa		42.19	■■■■■ 4.34
LIMD2-208	ENST00000579814	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	42.16	■■■■■ 4.34
LIMD2-208	ENST00000579814	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		42.11	■■■■■ 4.33
LIMD2-208	ENST00000579814	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	42.11	■■■■■ 4.33
LIMD2-208	ENST00000579814	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		42.09	■■■■■ 4.33
LIMD2-208	ENST00000579814	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.08	■■■■■ 4.33
LIMD2-208	ENST00000579814	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
LIMD2-208	ENST00000579814	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.07	■■■■■ 4.33
LIMD2-208	ENST00000579814	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		42.06	■■■■■ 4.32
LIMD2-208	ENST00000579814	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.06	■■■■■ 4.32
LIMD2-208	ENST00000579814	FANCA	O15360	1455 aa		42.04	■■■■■ 4.32
LIMD2-208	ENST00000579814	PLCH2	O75038	1416 aa		42.03	■■■■■ 4.32
LIMD2-208	ENST00000579814	AKNA	Q7Z591	1439 aa		42.03	■■■■■ 4.32
LIMD2-208	ENST00000579814	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		42.02	■■■■■ 4.32
LIMD2-208	ENST00000579814	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.97	■■■■■ 4.31
LIMD2-208	ENST00000579814	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.93	■■■■■ 4.3
LIMD2-208	ENST00000579814	KIF14	Q15058	1648 aa		41.92	■■■■■ 4.3
LIMD2-208	ENST00000579814	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.91	■■■■■ 4.3
LIMD2-208	ENST00000579814	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.89	■■■■■ 4.3
LIMD2-208	ENST00000579814	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.83	■■■■■ 4.29
LIMD2-208	ENST00000579814	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.81	■■■■■ 4.28
LIMD2-208	ENST00000579814	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.75	■■■■■ 4.27
LIMD2-208	ENST00000579814	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.74	■■■■■ 4.27
LIMD2-208	ENST00000579814	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.73	■■■■■ 4.27
LIMD2-208	ENST00000579814	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		41.72	■■■■■ 4.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms