RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574894.1

NOMO3-212, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 2

Gene NOMO3, Length 1,269 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-212ENST00000574894 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.33■■□□□ 1.65
NOMO3-212ENST00000574894 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NOMO3-212ENST00000574894 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.31■■□□□ 1.64
NOMO3-212ENST00000574894 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.21■■□□□ 1.63
NOMO3-212ENST00000574894 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
NOMO3-212ENST00000574894 IQGAP2Q13576 1575 aa25.14■■□□□ 1.61
NOMO3-212ENST00000574894 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.12■■□□□ 1.61
NOMO3-212ENST00000574894 PRXQ9BXM0 1461 aa25.05■■□□□ 1.6
NOMO3-212ENST00000574894 EEA1Q15075 1411 aa25.04■■□□□ 1.6
NOMO3-212ENST00000574894 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
NOMO3-212ENST00000574894 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.02■■□□□ 1.6
NOMO3-212ENST00000574894 PTPRGP23470 1445 aa25.01■■□□□ 1.59
NOMO3-212ENST00000574894 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.01■■□□□ 1.59
NOMO3-212ENST00000574894 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.97■■□□□ 1.59
NOMO3-212ENST00000574894 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.95■■□□□ 1.58
NOMO3-212ENST00000574894 DISP1Q96F81 1524 aa24.94■■□□□ 1.58
NOMO3-212ENST00000574894 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.93■■□□□ 1.58
NOMO3-212ENST00000574894 MAPKBP1O60336 1514 aa24.91■■□□□ 1.58
NOMO3-212ENST00000574894 GOLGA3Q08378 1498 aa24.9■■□□□ 1.58
NOMO3-212ENST00000574894 KIAA0556O60303 1618 aa24.89■■□□□ 1.57
NOMO3-212ENST00000574894 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.86■■□□□ 1.57
NOMO3-212ENST00000574894 UACAQ9BZF9 1416 aa24.84■■□□□ 1.57
NOMO3-212ENST00000574894 ABCC2Q92887 1545 aa24.82■■□□□ 1.56
NOMO3-212ENST00000574894 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
NOMO3-212ENST00000574894 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.81■■□□□ 1.56
NOMO3-212ENST00000574894 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.8■■□□□ 1.56
NOMO3-212ENST00000574894 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
NOMO3-212ENST00000574894 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.75■■□□□ 1.55
NOMO3-212ENST00000574894 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.73■■□□□ 1.55
NOMO3-212ENST00000574894 KIF21BO75037 1637 aa24.72■■□□□ 1.55
NOMO3-212ENST00000574894 DIP2BQ9P265 1576 aa24.72■■□□□ 1.55
NOMO3-212ENST00000574894 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.71■■□□□ 1.55
NOMO3-212ENST00000574894 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.71■■□□□ 1.55
NOMO3-212ENST00000574894 ASXL2Q76L83 1435 aa24.66■■□□□ 1.54
NOMO3-212ENST00000574894 SAMD9Q5K651 1589 aa24.64■■□□□ 1.54
NOMO3-212ENST00000574894 ABCA8O94911 1581 aa24.63■■□□□ 1.53
NOMO3-212ENST00000574894 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
NOMO3-212ENST00000574894 GLI2P10070 1586 aa24.59■■□□□ 1.53
NOMO3-212ENST00000574894 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.55■■□□□ 1.52
NOMO3-212ENST00000574894 P3H3Q8IVL6 736 aa24.54■■□□□ 1.52
NOMO3-212ENST00000574894 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.52■■□□□ 1.52
NOMO3-212ENST00000574894 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
NOMO3-212ENST00000574894 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NOMO3-212ENST00000574894 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.45■■□□□ 1.5
NOMO3-212ENST00000574894 TSPOAP1O95153 1857 aa24.45■■□□□ 1.5
NOMO3-212ENST00000574894 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
NOMO3-212ENST00000574894 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.44■■□□□ 1.5
NOMO3-212ENST00000574894 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.43■■□□□ 1.5
NOMO3-212ENST00000574894 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.43■■□□□ 1.5
NOMO3-212ENST00000574894 KDM6BO15054 1643 aa24.42■■□□□ 1.5
NOMO3-212ENST00000574894 ATP10BO94823 1461 aa24.41■■□□□ 1.5
NOMO3-212ENST00000574894 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NOMO3-212ENST00000574894 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.36■■□□□ 1.49
NOMO3-212ENST00000574894 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NOMO3-212ENST00000574894 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.34■■□□□ 1.49
NOMO3-212ENST00000574894 FMN1Q68DA7 1419 aa24.34■■□□□ 1.49
NOMO3-212ENST00000574894 KCNH8Q96L42 1107 aa24.33■■□□□ 1.49
NOMO3-212ENST00000574894 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.32■■□□□ 1.48
NOMO3-212ENST00000574894 CD109Q6YHK3 1445 aa24.32■■□□□ 1.48
NOMO3-212ENST00000574894 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NOMO3-212ENST00000574894 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NOMO3-212ENST00000574894 ARID3CA6NKF2 412 aa24.3■■□□□ 1.48
NOMO3-212ENST00000574894 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.29■■□□□ 1.48
NOMO3-212ENST00000574894 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.24■■□□□ 1.47
NOMO3-212ENST00000574894 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.22■■□□□ 1.47
NOMO3-212ENST00000574894 HECW1Q76N89 1606 aa24.21■■□□□ 1.47
NOMO3-212ENST00000574894 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.2■■□□□ 1.46
NOMO3-212ENST00000574894 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NOMO3-212ENST00000574894 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NOMO3-212ENST00000574894 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
NOMO3-212ENST00000574894 NEO1Q92859 1461 aa24.12■■□□□ 1.45
NOMO3-212ENST00000574894 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NOMO3-212ENST00000574894 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NOMO3-212ENST00000574894 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.1■■□□□ 1.45
NOMO3-212ENST00000574894 CLIP1P30622 1438 aa24.1■■□□□ 1.45
NOMO3-212ENST00000574894 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.07■■□□□ 1.44
NOMO3-212ENST00000574894 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.05■■□□□ 1.44
NOMO3-212ENST00000574894 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
NOMO3-212ENST00000574894 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.03■■□□□ 1.44
NOMO3-212ENST00000574894 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24■■□□□ 1.43
NOMO3-212ENST00000574894 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
NOMO3-212ENST00000574894 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
NOMO3-212ENST00000574894 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.98■■□□□ 1.43
NOMO3-212ENST00000574894 FANCAO15360 1455 aa23.97■■□□□ 1.43
NOMO3-212ENST00000574894 KIF14Q15058 1648 aa23.97■■□□□ 1.43
NOMO3-212ENST00000574894 PLCH2O75038 1416 aa23.94■■□□□ 1.42
NOMO3-212ENST00000574894 AKNAQ7Z591 1439 aa23.94■■□□□ 1.42
NOMO3-212ENST00000574894 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.92■■□□□ 1.42
NOMO3-212ENST00000574894 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.91■■□□□ 1.42
NOMO3-212ENST00000574894 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
NOMO3-212ENST00000574894 CEP162Q5TB80 1403 aa23.91■■□□□ 1.42
NOMO3-212ENST00000574894 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.89■■□□□ 1.41
NOMO3-212ENST00000574894 RAPGEF3O95398 923 aa23.88■■□□□ 1.41
NOMO3-212ENST00000574894 ADGRL1O94910 1474 aa23.87■■□□□ 1.41
NOMO3-212ENST00000574894 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.87■■□□□ 1.41
NOMO3-212ENST00000574894 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.84■■□□□ 1.41
NOMO3-212ENST00000574894 RICTORQ6R327 1708 aa23.82■■□□□ 1.4
NOMO3-212ENST00000574894 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.81■■□□□ 1.4
NOMO3-212ENST00000574894 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.8■■□□□ 1.4
NOMO3-212ENST00000574894 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.79■■□□□ 1.4
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