RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572936.5

MPDU1-211, Transcript of mannose-P-dolichol utilization defect 1, humanhuman

TSL 5

Gene MPDU1, Length 1,102 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPDU1-211ENST00000572936 IGF1RP08069 1367 aa31.16■■■□□ 2.58
MPDU1-211ENST00000572936 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.06■■■□□ 2.56
MPDU1-211ENST00000572936 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.02■■■□□ 2.56
MPDU1-211ENST00000572936 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31■■■□□ 2.55
MPDU1-211ENST00000572936 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.98■■■□□ 2.55
MPDU1-211ENST00000572936 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
MPDU1-211ENST00000572936 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.83■■■□□ 2.53
MPDU1-211ENST00000572936 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.81■■■□□ 2.52
MPDU1-211ENST00000572936 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
MPDU1-211ENST00000572936 PTPRGP23470 1445 aa30.78■■■□□ 2.52
MPDU1-211ENST00000572936 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.78■■■□□ 2.52
MPDU1-211ENST00000572936 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.75■■■□□ 2.51
MPDU1-211ENST00000572936 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.74■■■□□ 2.51
MPDU1-211ENST00000572936 MAPKBP1O60336 1514 aa30.73■■■□□ 2.51
MPDU1-211ENST00000572936 IQGAP2Q13576 1575 aa30.72■■■□□ 2.51
MPDU1-211ENST00000572936 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.71■■■□□ 2.51
MPDU1-211ENST00000572936 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.7■■■□□ 2.5
MPDU1-211ENST00000572936 PRXQ9BXM0 1461 aa30.66■■■□□ 2.5
MPDU1-211ENST00000572936 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.65■■■□□ 2.5
MPDU1-211ENST00000572936 EEA1Q15075 1411 aa30.61■■■□□ 2.49
MPDU1-211ENST00000572936 DIP2BQ9P265 1576 aa30.6■■■□□ 2.49
MPDU1-211ENST00000572936 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.56■■■□□ 2.48
MPDU1-211ENST00000572936 ABCC2Q92887 1545 aa30.54■■■□□ 2.48
MPDU1-211ENST00000572936 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.54■■■□□ 2.48
MPDU1-211ENST00000572936 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.53■■■□□ 2.48
MPDU1-211ENST00000572936 DISP1Q96F81 1524 aa30.52■■■□□ 2.48
MPDU1-211ENST00000572936 UACAQ9BZF9 1416 aa30.51■■■□□ 2.47
MPDU1-211ENST00000572936 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.47■■■□□ 2.47
MPDU1-211ENST00000572936 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.45■■■□□ 2.47
MPDU1-211ENST00000572936 ASXL2Q76L83 1435 aa30.45■■■□□ 2.46
MPDU1-211ENST00000572936 KIAA0556O60303 1618 aa30.44■■■□□ 2.46
MPDU1-211ENST00000572936 KDM6BO15054 1643 aa30.37■■■□□ 2.45
MPDU1-211ENST00000572936 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
MPDU1-211ENST00000572936 KIF21BO75037 1637 aa30.35■■■□□ 2.45
MPDU1-211ENST00000572936 GOLGA3Q08378 1498 aa30.34■■■□□ 2.45
MPDU1-211ENST00000572936 TSPOAP1O95153 1857 aa30.33■■■□□ 2.45
MPDU1-211ENST00000572936 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.32■■■□□ 2.44
MPDU1-211ENST00000572936 GLI2P10070 1586 aa30.29■■■□□ 2.44
MPDU1-211ENST00000572936 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
MPDU1-211ENST00000572936 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
MPDU1-211ENST00000572936 SAMD9Q5K651 1589 aa30.19■■■□□ 2.42
MPDU1-211ENST00000572936 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.15■■■□□ 2.42
MPDU1-211ENST00000572936 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.13■■■□□ 2.41
MPDU1-211ENST00000572936 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.11■■■□□ 2.41
MPDU1-211ENST00000572936 P3H3Q8IVL6 736 aa30.11■■■□□ 2.41
MPDU1-211ENST00000572936 KCNH8Q96L42 1107 aa30.11■■■□□ 2.41
MPDU1-211ENST00000572936 ABCA8O94911 1581 aa30.11■■■□□ 2.41
MPDU1-211ENST00000572936 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
MPDU1-211ENST00000572936 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.08■■■□□ 2.41
MPDU1-211ENST00000572936 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
MPDU1-211ENST00000572936 ARID3CA6NKF2 412 aa30.01■■■□□ 2.39
MPDU1-211ENST00000572936 CD109Q6YHK3 1445 aa30.01■■■□□ 2.39
MPDU1-211ENST00000572936 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.01■■■□□ 2.39
MPDU1-211ENST00000572936 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
MPDU1-211ENST00000572936 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
MPDU1-211ENST00000572936 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.97■■■□□ 2.39
MPDU1-211ENST00000572936 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.93■■■□□ 2.38
MPDU1-211ENST00000572936 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.93■■■□□ 2.38
MPDU1-211ENST00000572936 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.92■■■□□ 2.38
MPDU1-211ENST00000572936 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
MPDU1-211ENST00000572936 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
MPDU1-211ENST00000572936 ATP10BO94823 1461 aa29.9■■■□□ 2.38
MPDU1-211ENST00000572936 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.88■■■□□ 2.37
MPDU1-211ENST00000572936 ADGRL1O94910 1474 aa29.86■■■□□ 2.37
MPDU1-211ENST00000572936 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.79■■■□□ 2.36
MPDU1-211ENST00000572936 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
MPDU1-211ENST00000572936 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.72■■■□□ 2.35
MPDU1-211ENST00000572936 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.7■■■□□ 2.35
MPDU1-211ENST00000572936 FMN1Q68DA7 1419 aa29.69■■■□□ 2.34
MPDU1-211ENST00000572936 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.68■■■□□ 2.34
MPDU1-211ENST00000572936 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.67■■■□□ 2.34
MPDU1-211ENST00000572936 HECW1Q76N89 1606 aa29.63■■■□□ 2.33
MPDU1-211ENST00000572936 NEO1Q92859 1461 aa29.6■■■□□ 2.33
MPDU1-211ENST00000572936 RAPGEF3O95398 923 aa29.59■■■□□ 2.33
MPDU1-211ENST00000572936 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
MPDU1-211ENST00000572936 CLIP1P30622 1438 aa29.54■■■□□ 2.32
MPDU1-211ENST00000572936 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
MPDU1-211ENST00000572936 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.5■■■□□ 2.31
MPDU1-211ENST00000572936 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
MPDU1-211ENST00000572936 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
MPDU1-211ENST00000572936 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.44■■■□□ 2.3
MPDU1-211ENST00000572936 AKNAQ7Z591 1439 aa29.43■■■□□ 2.3
MPDU1-211ENST00000572936 FANCAO15360 1455 aa29.42■■■□□ 2.3
MPDU1-211ENST00000572936 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
MPDU1-211ENST00000572936 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
MPDU1-211ENST00000572936 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
MPDU1-211ENST00000572936 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.39■■■□□ 2.29
MPDU1-211ENST00000572936 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.38■■■□□ 2.29
MPDU1-211ENST00000572936 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.37■■■□□ 2.29
MPDU1-211ENST00000572936 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.37■■■□□ 2.29
MPDU1-211ENST00000572936 CEP162Q5TB80 1403 aa29.37■■■□□ 2.29
MPDU1-211ENST00000572936 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.35■■■□□ 2.29
MPDU1-211ENST00000572936 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.35■■■□□ 2.29
MPDU1-211ENST00000572936 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
MPDU1-211ENST00000572936 KIF14Q15058 1648 aa29.3■■■□□ 2.28
MPDU1-211ENST00000572936 PLCH2O75038 1416 aa29.29■■■□□ 2.28
MPDU1-211ENST00000572936 PTPRMP28827 1452 aa29.28■■■□□ 2.28
MPDU1-211ENST00000572936 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.27■■■□□ 2.28
MPDU1-211ENST00000572936 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.27■■■□□ 2.28
MPDU1-211ENST00000572936 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.3 ms