RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572557.5

AKAP1-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AKAP1, Length 3,098 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP1-208ENST00000572557 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.69■□□□□ 0.26
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AKAP1-208ENST00000572557 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
AKAP1-208ENST00000572557 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.68■□□□□ 0.26
AKAP1-208ENST00000572557 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.68■□□□□ 0.26
AKAP1-208ENST00000572557 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.67■□□□□ 0.26
AKAP1-208ENST00000572557 ARAP1Q96P48 1450 aa16.67■□□□□ 0.26
AKAP1-208ENST00000572557 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.67■□□□□ 0.26
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AKAP1-208ENST00000572557 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa16.59■□□□□ 0.25
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AKAP1-208ENST00000572557 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.54■□□□□ 0.24
AKAP1-208ENST00000572557 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
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AKAP1-208ENST00000572557 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.46■□□□□ 0.23
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AKAP1-208ENST00000572557 AKNAQ7Z591 1439 aa16.28■□□□□ 0.2
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AKAP1-208ENST00000572557 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.27■□□□□ 0.19
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AKAP1-208ENST00000572557 NCAPD3P42695 1498 aa16.25■□□□□ 0.19
AKAP1-208ENST00000572557 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
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AKAP1-208ENST00000572557 GSE1Q14687 1217 aa16.11■□□□□ 0.17
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AKAP1-208ENST00000572557 CCDC7Q96M83 1385 aa16.08■□□□□ 0.17
AKAP1-208ENST00000572557 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 32.6
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AKAP1-208ENST00000572557 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.06■□□□□ 0.16
AKAP1-208ENST00000572557 CUX1P39880 1505 aa16.06■□□□□ 0.16
AKAP1-208ENST00000572557 NCOA1Q15788 1441 aa16.06■□□□□ 0.16
AKAP1-208ENST00000572557 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
AKAP1-208ENST00000572557 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
AKAP1-208ENST00000572557 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
AKAP1-208ENST00000572557 PKNOX2Q96KN3 472 aa16.05■□□□□ 0.16
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AKAP1-208ENST00000572557 HFM1A2PYH4 1435 aa16.04■□□□□ 0.16
AKAP1-208ENST00000572557 PTPRKQ15262 1439 aa16.04■□□□□ 0.16
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AKAP1-208ENST00000572557 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
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AKAP1-208ENST00000572557 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.01■□□□□ 0.15
AKAP1-208ENST00000572557 FGD6Q6ZV73 1430 aa16■□□□□ 0.15
AKAP1-208ENST00000572557 NAIPQ13075 1403 aa15.99■□□□□ 0.15
AKAP1-208ENST00000572557 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.99■□□□□ 0.15
AKAP1-208ENST00000572557 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.97■□□□□ 0.15
AKAP1-208ENST00000572557 SLC4A3P48751 1232 aa15.96■□□□□ 0.14
AKAP1-208ENST00000572557 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
AKAP1-208ENST00000572557 MS4A1P11836 297 aa15.95■□□□□ 0.14
AKAP1-208ENST00000572557 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.95■□□□□ 0.14
AKAP1-208ENST00000572557 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.95■□□□□ 0.14
AKAP1-208ENST00000572557 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.94■□□□□ 0.14
AKAP1-208ENST00000572557 RRP1P56182 461 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
AKAP1-208ENST00000572557 L3MBTL2Q969R5 705 aa15.93■□□□□ 0.14
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