RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 CUL7Q14999 1698 aa28.61■■■□□ 2.17
SPNS1-211ENST00000568829 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.54■■■□□ 2.16
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.53■■■□□ 2.16
SPNS1-211ENST00000568829 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.51■■■□□ 2.16
SPNS1-211ENST00000568829 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
SPNS1-211ENST00000568829 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.35■■■□□ 2.13
SPNS1-211ENST00000568829 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.28■■■□□ 2.12
SPNS1-211ENST00000568829 PTPRGP23470 1445 aa28.27■■■□□ 2.12
SPNS1-211ENST00000568829 IQGAP2Q13576 1575 aa28.25■■■□□ 2.11
SPNS1-211ENST00000568829 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.24■■■□□ 2.11
SPNS1-211ENST00000568829 MAPKBP1O60336 1514 aa28.22■■■□□ 2.11
SPNS1-211ENST00000568829 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.19■■■□□ 2.1
SPNS1-211ENST00000568829 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.18■■■□□ 2.1
SPNS1-211ENST00000568829 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.17■■■□□ 2.1
SPNS1-211ENST00000568829 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
SPNS1-211ENST00000568829 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.09■■■□□ 2.09
SPNS1-211ENST00000568829 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.08■■■□□ 2.08
SPNS1-211ENST00000568829 ABCC2Q92887 1545 aa28.05■■■□□ 2.08
SPNS1-211ENST00000568829 DISP1Q96F81 1524 aa28.04■■■□□ 2.08
SPNS1-211ENST00000568829 UACAQ9BZF9 1416 aa28.04■■■□□ 2.08
SPNS1-211ENST00000568829 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.03■■■□□ 2.08
SPNS1-211ENST00000568829 DIP2BQ9P265 1576 aa28.03■■■□□ 2.08
SPNS1-211ENST00000568829 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
SPNS1-211ENST00000568829 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SPNS1-211ENST00000568829 GOLGA3Q08378 1498 aa27.99■■■□□ 2.07
SPNS1-211ENST00000568829 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.99■■■□□ 2.07
SPNS1-211ENST00000568829 PRXQ9BXM0 1461 aa27.97■■■□□ 2.07
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA0556O60303 1618 aa27.95■■■□□ 2.06
SPNS1-211ENST00000568829 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.93■■■□□ 2.06
SPNS1-211ENST00000568829 ASXL2Q76L83 1435 aa27.92■■■□□ 2.06
SPNS1-211ENST00000568829 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.9■■■□□ 2.06
SPNS1-211ENST00000568829 EEA1Q15075 1411 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-211ENST00000568829 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.87■■■□□ 2.05
SPNS1-211ENST00000568829 GLI2P10070 1586 aa27.82■■■□□ 2.04
SPNS1-211ENST00000568829 KDM6BO15054 1643 aa27.8■■■□□ 2.04
SPNS1-211ENST00000568829 TSPOAP1O95153 1857 aa27.76■■■□□ 2.04
SPNS1-211ENST00000568829 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
SPNS1-211ENST00000568829 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
SPNS1-211ENST00000568829 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.7■■■□□ 2.03
SPNS1-211ENST00000568829 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.7■■■□□ 2.02
SPNS1-211ENST00000568829 ABCA8O94911 1581 aa27.68■■■□□ 2.02
SPNS1-211ENST00000568829 P3H3Q8IVL6 736 aa27.63■■■□□ 2.01
SPNS1-211ENST00000568829 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.6■■■□□ 2.01
SPNS1-211ENST00000568829 KCNH8Q96L42 1107 aa27.59■■■□□ 2.01
SPNS1-211ENST00000568829 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
SPNS1-211ENST00000568829 CD109Q6YHK3 1445 aa27.55■■■□□ 2
SPNS1-211ENST00000568829 SAMD9Q5K651 1589 aa27.55■■■□□ 2
SPNS1-211ENST00000568829 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SPNS1-211ENST00000568829 KIF21BO75037 1637 aa27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-211ENST00000568829 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-211ENST00000568829 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-211ENST00000568829 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-211ENST00000568829 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.49■■□□□ 1.99
SPNS1-211ENST00000568829 ATP10BO94823 1461 aa27.48■■□□□ 1.99
SPNS1-211ENST00000568829 ARID3CA6NKF2 412 aa27.46■■□□□ 1.99
SPNS1-211ENST00000568829 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.45■■□□□ 1.98
SPNS1-211ENST00000568829 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.45■■□□□ 1.98
SPNS1-211ENST00000568829 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.42■■□□□ 1.98
SPNS1-211ENST00000568829 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
SPNS1-211ENST00000568829 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SPNS1-211ENST00000568829 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.4■■□□□ 1.98
SPNS1-211ENST00000568829 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.39■■□□□ 1.98
SPNS1-211ENST00000568829 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.38■■□□□ 1.97
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.35■■□□□ 1.97
SPNS1-211ENST00000568829 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SPNS1-211ENST00000568829 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.3■■□□□ 1.96
SPNS1-211ENST00000568829 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.26■■□□□ 1.96
SPNS1-211ENST00000568829 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRL1O94910 1474 aa27.25■■□□□ 1.95
SPNS1-211ENST00000568829 FMN1Q68DA7 1419 aa27.24■■□□□ 1.95
SPNS1-211ENST00000568829 NEO1Q92859 1461 aa27.23■■□□□ 1.95
SPNS1-211ENST00000568829 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
SPNS1-211ENST00000568829 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.11■■□□□ 1.93
SPNS1-211ENST00000568829 HECW1Q76N89 1606 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-211ENST00000568829 RAPGEF3O95398 923 aa27.09■■□□□ 1.93
SPNS1-211ENST00000568829 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.07■■□□□ 1.92
SPNS1-211ENST00000568829 FANCAO15360 1455 aa27.05■■□□□ 1.92
SPNS1-211ENST00000568829 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SPNS1-211ENST00000568829 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
SPNS1-211ENST00000568829 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
SPNS1-211ENST00000568829 AKNAQ7Z591 1439 aa27.03■■□□□ 1.92
SPNS1-211ENST00000568829 CLIP1P30622 1438 aa26.99■■□□□ 1.91
SPNS1-211ENST00000568829 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-211ENST00000568829 PLCH2O75038 1416 aa26.96■■□□□ 1.91
SPNS1-211ENST00000568829 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.95■■□□□ 1.9
SPNS1-211ENST00000568829 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.95■■□□□ 1.9
SPNS1-211ENST00000568829 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.9■■□□□ 1.9
SPNS1-211ENST00000568829 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.89■■□□□ 1.9
SPNS1-211ENST00000568829 KIF14Q15058 1648 aa26.89■■□□□ 1.9
SPNS1-211ENST00000568829 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.89■■□□□ 1.89
SPNS1-211ENST00000568829 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS1-211ENST00000568829 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS1-211ENST00000568829 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS1-211ENST00000568829 RICTORQ6R327 1708 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS1-211ENST00000568829 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.84■■□□□ 1.89
SPNS1-211ENST00000568829 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS1-211ENST00000568829 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.8■■□□□ 1.88
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