RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.4■■■■■ 5.66
RAB40C-211ENST00000568586 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP50.32■■■■■ 5.65
RAB40C-211ENST00000568586 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa50.31■■■■■ 5.65
RAB40C-211ENST00000568586 TRHP20396 242 aaPredicted RBP50.06■■■■■ 5.6
RAB40C-211ENST00000568586 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa50.02■■■■■ 5.6
RAB40C-211ENST00000568586 IQGAP2Q13576 1575 aa49.87■■■■■ 5.57
RAB40C-211ENST00000568586 PRXQ9BXM0 1461 aa49.78■■■■■ 5.56
RAB40C-211ENST00000568586 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa49.75■■■■■ 5.55
RAB40C-211ENST00000568586 UGGT2Q9NYU1 1516 aa49.66■■■■■ 5.54
RAB40C-211ENST00000568586 PTPRGP23470 1445 aa49.66■■■■■ 5.54
RAB40C-211ENST00000568586 TNIKQ9UKE5 1360 aa49.66■■■■■ 5.54
RAB40C-211ENST00000568586 DISP1Q96F81 1524 aa49.63■■■■■ 5.54
RAB40C-211ENST00000568586 ADCY10Q96PN6 1610 aa49.61■■■■■ 5.53
RAB40C-211ENST00000568586 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.55■■■■■ 5.52
RAB40C-211ENST00000568586 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP49.53■■■■■ 5.52
RAB40C-211ENST00000568586 EEA1Q15075 1411 aa49.51■■■■■ 5.52
RAB40C-211ENST00000568586 MAPKBP1O60336 1514 aa49.48■■■■■ 5.51
RAB40C-211ENST00000568586 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa49.48■■■■■ 5.51
RAB40C-211ENST00000568586 KIAA0556O60303 1618 aa49.4■■■■■ 5.5
RAB40C-211ENST00000568586 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa49.37■■■■■ 5.49
RAB40C-211ENST00000568586 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP49.34■■■■■ 5.49
RAB40C-211ENST00000568586 ABCC10Q5T3U5 1492 aa49.33■■■■■ 5.49
RAB40C-211ENST00000568586 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.32■■■■■ 5.49
RAB40C-211ENST00000568586 UACAQ9BZF9 1416 aa49.32■■■■■ 5.49
RAB40C-211ENST00000568586 ABCC2Q92887 1545 aa49.31■■■■■ 5.48
RAB40C-211ENST00000568586 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.31■■■■■ 5.48
RAB40C-211ENST00000568586 GOLGA3Q08378 1498 aa49.29■■■■■ 5.48
RAB40C-211ENST00000568586 FAM69CQ0P6D2 419 aa49.18■■■■■ 5.46
RAB40C-211ENST00000568586 DIP2BQ9P265 1576 aa49.17■■■■■ 5.46
RAB40C-211ENST00000568586 KDM5BQ9UGL1 1544 aa49.11■■■■■ 5.45
RAB40C-211ENST00000568586 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49.08■■■■■ 5.45
RAB40C-211ENST00000568586 PLB1Q6P1J6 1458 aa49.04■■■■■ 5.44
RAB40C-211ENST00000568586 ASXL2Q76L83 1435 aa49.02■■■■■ 5.44
RAB40C-211ENST00000568586 KIF21BO75037 1637 aa49■■■■■ 5.43
RAB40C-211ENST00000568586 ABCA8O94911 1581 aa48.96■■■■■ 5.43
RAB40C-211ENST00000568586 SAMD9Q5K651 1589 aa48.92■■■■■ 5.42
RAB40C-211ENST00000568586 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP48.89■■■■■ 5.42
RAB40C-211ENST00000568586 GLI2P10070 1586 aa48.86■■■■■ 5.41
RAB40C-211ENST00000568586 P3H3Q8IVL6 736 aa48.8■■■■■ 5.4
RAB40C-211ENST00000568586 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP48.76■■■■■ 5.4
RAB40C-211ENST00000568586 WDR7Q9Y4E6 1490 aa48.68■■■■■ 5.38
RAB40C-211ENST00000568586 TSPOAP1O95153 1857 aa48.63■■■■■ 5.38
RAB40C-211ENST00000568586 EFCAB5A4FU69 1503 aa48.59■■■■■ 5.37
RAB40C-211ENST00000568586 ATP10BO94823 1461 aa48.56■■■■■ 5.36
RAB40C-211ENST00000568586 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
RAB40C-211ENST00000568586 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa48.55■■■■■ 5.36
RAB40C-211ENST00000568586 FHOD3Q2V2M9 1422 aa48.55■■■■■ 5.36
RAB40C-211ENST00000568586 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48.54■■■■■ 5.36
RAB40C-211ENST00000568586 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.52■■■■■ 5.36
RAB40C-211ENST00000568586 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa48.51■■■■■ 5.36
RAB40C-211ENST00000568586 KDM6BO15054 1643 aa48.48■■■■■ 5.35
RAB40C-211ENST00000568586 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
RAB40C-211ENST00000568586 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.38■■■■■ 5.34
RAB40C-211ENST00000568586 TEX14Q8IWB6 1497 aa48.37■■■■■ 5.33
RAB40C-211ENST00000568586 KCNH8Q96L42 1107 aa48.37■■■■■ 5.33
RAB40C-211ENST00000568586 ARID3CA6NKF2 412 aa48.36■■■■■ 5.33
RAB40C-211ENST00000568586 CD109Q6YHK3 1445 aa48.31■■■■■ 5.32
RAB40C-211ENST00000568586 CFAP43Q8NDM7 1665 aa48.31■■■■■ 5.32
RAB40C-211ENST00000568586 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa48.3■■■■■ 5.32
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa48.27■■■■■ 5.32
RAB40C-211ENST00000568586 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP48.23■■■■■ 5.31
RAB40C-211ENST00000568586 FMN1Q68DA7 1419 aa48.15■■■■■ 5.3
RAB40C-211ENST00000568586 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
RAB40C-211ENST00000568586 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
RAB40C-211ENST00000568586 ABCA9Q8IUA7 1624 aa48.12■■■■■ 5.29
RAB40C-211ENST00000568586 PLEKHD1A6NEE1 506 aa48.05■■■■■ 5.28
RAB40C-211ENST00000568586 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.94■■■■■ 5.26
RAB40C-211ENST00000568586 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.93■■■■■ 5.26
RAB40C-211ENST00000568586 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
RAB40C-211ENST00000568586 HECW1Q76N89 1606 aa47.92■■■■■ 5.26
RAB40C-211ENST00000568586 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.91■■■■■ 5.26
RAB40C-211ENST00000568586 NEO1Q92859 1461 aa47.84■■■■■ 5.25
RAB40C-211ENST00000568586 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.79■■■■■ 5.242e-6■■■□□ 16.1
RAB40C-211ENST00000568586 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
RAB40C-211ENST00000568586 CLIP1P30622 1438 aa47.75■■■■■ 5.23
RAB40C-211ENST00000568586 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.75■■■■■ 5.23
RAB40C-211ENST00000568586 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa47.74■■■■■ 5.23
RAB40C-211ENST00000568586 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.73■■■■■ 5.23
RAB40C-211ENST00000568586 TTC37Q6PGP7 1564 aa47.67■■■■■ 5.22
RAB40C-211ENST00000568586 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa47.63■■■■■ 5.22
RAB40C-211ENST00000568586 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
RAB40C-211ENST00000568586 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP47.61■■■■■ 5.21
RAB40C-211ENST00000568586 FANCAO15360 1455 aa47.58■■■■■ 5.21
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC18Q5T9S5 1454 aa47.58■■■■■ 5.21
RAB40C-211ENST00000568586 FYCO1Q9BQS8 1478 aa47.56■■■■■ 5.2
RAB40C-211ENST00000568586 PLCH2O75038 1416 aa47.56■■■■■ 5.2
RAB40C-211ENST00000568586 AKNAQ7Z591 1439 aa47.55■■■■■ 5.2
RAB40C-211ENST00000568586 RAPGEF3O95398 923 aa47.54■■■■■ 5.2
RAB40C-211ENST00000568586 CFAP74Q9C0B2 1584 aa47.53■■■■■ 5.2
RAB40C-211ENST00000568586 ADGRL1O94910 1474 aa47.49■■■■■ 5.19
RAB40C-211ENST00000568586 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa47.48■■■■■ 5.19
RAB40C-211ENST00000568586 KIF14Q15058 1648 aa47.46■■■■■ 5.19
RAB40C-211ENST00000568586 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP47.45■■■■■ 5.19
RAB40C-211ENST00000568586 CEP162Q5TB80 1403 aa47.39■■■■■ 5.18
RAB40C-211ENST00000568586 RICTORQ6R327 1708 aa47.36■■■■■ 5.17
RAB40C-211ENST00000568586 MYO5CQ9NQX4 1742 aa47.36■■■■■ 5.17
RAB40C-211ENST00000568586 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa47.35■■■■■ 5.17
RAB40C-211ENST00000568586 SCAPERQ9BY12 1400 aa47.26■■■■■ 5.16
RAB40C-211ENST00000568586 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa47.25■■■■■ 5.16
RAB40C-211ENST00000568586 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.24■■■■■ 5.15
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