RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.21■■■■■ 4.67
SPNS1-209ENST00000567771 CUL7Q14999 1698 aa44.13■■■■■ 4.66
SPNS1-209ENST00000567771 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.04■■■■■ 4.64
SPNS1-209ENST00000567771 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.02■■■■■ 4.64
SPNS1-209ENST00000567771 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.7■■■■■ 4.59
SPNS1-209ENST00000567771 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.69■■■■■ 4.58
SPNS1-209ENST00000567771 IQGAP2Q13576 1575 aa43.63■■■■■ 4.58
SPNS1-209ENST00000567771 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.63■■■■■ 4.57
SPNS1-209ENST00000567771 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.63■■■■■ 4.57
SPNS1-209ENST00000567771 PTPRGP23470 1445 aa43.61■■■■■ 4.57
SPNS1-209ENST00000567771 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.59■■■■■ 4.57
SPNS1-209ENST00000567771 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
SPNS1-209ENST00000567771 MAPKBP1O60336 1514 aa43.57■■■■■ 4.56
SPNS1-209ENST00000567771 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.54■■■■■ 4.56
SPNS1-209ENST00000567771 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.53■■■■■ 4.56
SPNS1-209ENST00000567771 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.52■■■■■ 4.56
SPNS1-209ENST00000567771 DISP1Q96F81 1524 aa43.44■■■■■ 4.54
SPNS1-209ENST00000567771 DIP2BQ9P265 1576 aa43.41■■■■■ 4.54
SPNS1-209ENST00000567771 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.38■■■■■ 4.53
SPNS1-209ENST00000567771 ABCC2Q92887 1545 aa43.32■■■■■ 4.52
SPNS1-209ENST00000567771 UACAQ9BZF9 1416 aa43.28■■■■■ 4.52
SPNS1-209ENST00000567771 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.26■■■■■ 4.52
SPNS1-209ENST00000567771 KIAA0556O60303 1618 aa43.25■■■■■ 4.51
SPNS1-209ENST00000567771 PRXQ9BXM0 1461 aa43.25■■■■■ 4.51
SPNS1-209ENST00000567771 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.2■■■■■ 4.51
SPNS1-209ENST00000567771 ASXL2Q76L83 1435 aa43.16■■■■■ 4.5
SPNS1-209ENST00000567771 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.12■■■■■ 4.49
SPNS1-209ENST00000567771 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
SPNS1-209ENST00000567771 TSPOAP1O95153 1857 aa43.08■■■■■ 4.49
SPNS1-209ENST00000567771 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.07■■■■■ 4.49
SPNS1-209ENST00000567771 GOLGA3Q08378 1498 aa43.04■■■■■ 4.48
SPNS1-209ENST00000567771 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.01■■■■■ 4.48
SPNS1-209ENST00000567771 GLI2P10070 1586 aa42.98■■■■■ 4.47
SPNS1-209ENST00000567771 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
SPNS1-209ENST00000567771 KDM6BO15054 1643 aa42.96■■■■■ 4.47
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SPNS1-209ENST00000567771 ABCA8O94911 1581 aa42.84■■■■■ 4.45
SPNS1-209ENST00000567771 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
SPNS1-209ENST00000567771 EEA1Q15075 1411 aa42.81■■■■■ 4.44
SPNS1-209ENST00000567771 P3H3Q8IVL6 736 aa42.78■■■■■ 4.44
SPNS1-209ENST00000567771 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.76■■■■■ 4.44
SPNS1-209ENST00000567771 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.75■■■■■ 4.43
SPNS1-209ENST00000567771 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
SPNS1-209ENST00000567771 SAMD9Q5K651 1589 aa42.63■■■■■ 4.41
SPNS1-209ENST00000567771 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.61■■■■■ 4.41
SPNS1-209ENST00000567771 KCNH8Q96L42 1107 aa42.6■■■■■ 4.41
SPNS1-209ENST00000567771 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
SPNS1-209ENST00000567771 ARID3CA6NKF2 412 aa42.57■■■■■ 4.41
SPNS1-209ENST00000567771 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
SPNS1-209ENST00000567771 ATP10BO94823 1461 aa42.51■■■■■ 4.4
SPNS1-209ENST00000567771 CD109Q6YHK3 1445 aa42.5■■■■■ 4.39
SPNS1-209ENST00000567771 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.49■■■■■ 4.39
SPNS1-209ENST00000567771 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.46■■■■■ 4.39
SPNS1-209ENST00000567771 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.45■■■■■ 4.39
SPNS1-209ENST00000567771 KIF21BO75037 1637 aa42.45■■■■■ 4.39
SPNS1-209ENST00000567771 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.44■■■■■ 4.38
SPNS1-209ENST00000567771 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.42■■■■■ 4.38
SPNS1-209ENST00000567771 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.4■■■■■ 4.38
SPNS1-209ENST00000567771 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
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SPNS1-209ENST00000567771 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.24■■■■■ 4.35
SPNS1-209ENST00000567771 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.2■■■■■ 4.35
SPNS1-209ENST00000567771 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
SPNS1-209ENST00000567771 ADGRL1O94910 1474 aa42.17■■■■■ 4.34
SPNS1-209ENST00000567771 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.09■■■■■ 4.33
SPNS1-209ENST00000567771 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.07■■■■■ 4.33
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SPNS1-209ENST00000567771 NEO1Q92859 1461 aa41.97■■■■■ 4.31
SPNS1-209ENST00000567771 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.96■■■■■ 4.31
SPNS1-209ENST00000567771 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
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SPNS1-209ENST00000567771 FMN1Q68DA7 1419 aa41.89■■■■■ 4.3
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SPNS1-209ENST00000567771 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
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SPNS1-209ENST00000567771 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.5■■■■■ 4.23
SPNS1-209ENST00000567771 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.49■■■■■ 4.23
SPNS1-209ENST00000567771 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.48■■■■■ 4.23
SPNS1-209ENST00000567771 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.48■■■■■ 4.23
SPNS1-209ENST00000567771 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.46■■■■■ 4.23
SPNS1-209ENST00000567771 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
SPNS1-209ENST00000567771 CLIP1P30622 1438 aa41.45■■■■■ 4.23
SPNS1-209ENST00000567771 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.45■■■■■ 4.23
SPNS1-209ENST00000567771 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.45■■■■■ 4.23
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