RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 JPH4Q96JJ6 628 aa36.26■■■■□ 3.4
PPP4C-211ENST00000567642 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
PPP4C-211ENST00000567642 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.09■■■■□ 3.37
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.08■■■■□ 3.37
PPP4C-211ENST00000567642 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.84■■■■□ 3.33
PPP4C-211ENST00000567642 IQGAP2Q13576 1575 aa35.83■■■■□ 3.33
PPP4C-211ENST00000567642 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.83■■■■□ 3.33
PPP4C-211ENST00000567642 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.82■■■■□ 3.32
PPP4C-211ENST00000567642 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.8■■■■□ 3.32
PPP4C-211ENST00000567642 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
PPP4C-211ENST00000567642 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.75■■■■□ 3.31
PPP4C-211ENST00000567642 PTPRGP23470 1445 aa35.73■■■■□ 3.31
PPP4C-211ENST00000567642 MAPKBP1O60336 1514 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP4C-211ENST00000567642 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP4C-211ENST00000567642 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.62■■■■□ 3.29
PPP4C-211ENST00000567642 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.61■■■■□ 3.29
PPP4C-211ENST00000567642 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.59■■■■□ 3.29
PPP4C-211ENST00000567642 DISP1Q96F81 1524 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP4C-211ENST00000567642 DIP2BQ9P265 1576 aa35.57■■■■□ 3.28
PPP4C-211ENST00000567642 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.57■■■■□ 3.28
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA0556O60303 1618 aa35.5■■■■□ 3.27
PPP4C-211ENST00000567642 ABCC2Q92887 1545 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP4C-211ENST00000567642 TSPOAP1O95153 1857 aa35.47■■■■□ 3.27
PPP4C-211ENST00000567642 UACAQ9BZF9 1416 aa35.45■■■■□ 3.27
PPP4C-211ENST00000567642 PRXQ9BXM0 1461 aa35.45■■■■□ 3.27
PPP4C-211ENST00000567642 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.42■■■■□ 3.26
PPP4C-211ENST00000567642 ASXL2Q76L83 1435 aa35.35■■■■□ 3.25
PPP4C-211ENST00000567642 GOLGA3Q08378 1498 aa35.33■■■■□ 3.25
PPP4C-211ENST00000567642 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.32■■■■□ 3.24
PPP4C-211ENST00000567642 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.3■■■■□ 3.24
PPP4C-211ENST00000567642 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
PPP4C-211ENST00000567642 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
PPP4C-211ENST00000567642 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.27■■■■□ 3.24
PPP4C-211ENST00000567642 KDM6BO15054 1643 aa35.23■■■■□ 3.23
PPP4C-211ENST00000567642 GLI2P10070 1586 aa35.21■■■■□ 3.23
PPP4C-211ENST00000567642 EEA1Q15075 1411 aa35.17■■■■□ 3.22
PPP4C-211ENST00000567642 ABCA8O94911 1581 aa35.13■■■■□ 3.21
PPP4C-211ENST00000567642 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
PPP4C-211ENST00000567642 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
PPP4C-211ENST00000567642 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
PPP4C-211ENST00000567642 P3H3Q8IVL6 736 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP4C-211ENST00000567642 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.06■■■■□ 3.2
PPP4C-211ENST00000567642 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.04■■■■□ 3.2
PPP4C-211ENST00000567642 SAMD9Q5K651 1589 aa35■■■■□ 3.19
PPP4C-211ENST00000567642 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
PPP4C-211ENST00000567642 KCNH8Q96L42 1107 aa34.94■■■■□ 3.18
PPP4C-211ENST00000567642 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.93■■■■□ 3.18
PPP4C-211ENST00000567642 ARID3CA6NKF2 412 aa34.93■■■■□ 3.18
PPP4C-211ENST00000567642 KIF21BO75037 1637 aa34.92■■■■□ 3.18
PPP4C-211ENST00000567642 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.89■■■■□ 3.18
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.88■■■■□ 3.17
PPP4C-211ENST00000567642 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.86■■■■□ 3.17
PPP4C-211ENST00000567642 ATP10BO94823 1461 aa34.84■■■■□ 3.17
PPP4C-211ENST00000567642 CD109Q6YHK3 1445 aa34.81■■■■□ 3.16
PPP4C-211ENST00000567642 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
PPP4C-211ENST00000567642 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.8■■■■□ 3.16
PPP4C-211ENST00000567642 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.79■■■■□ 3.16
PPP4C-211ENST00000567642 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
PPP4C-211ENST00000567642 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
PPP4C-211ENST00000567642 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.74■■■■□ 3.15
PPP4C-211ENST00000567642 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.71■■■■□ 3.15
PPP4C-211ENST00000567642 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
PPP4C-211ENST00000567642 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.69■■■■□ 3.14
PPP4C-211ENST00000567642 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
PPP4C-211ENST00000567642 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.63■■■■□ 3.13
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRL1O94910 1474 aa34.52■■■■□ 3.12
PPP4C-211ENST00000567642 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.51■■■■□ 3.12
PPP4C-211ENST00000567642 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.46■■■■□ 3.11
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.43■■■■□ 3.1
PPP4C-211ENST00000567642 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
PPP4C-211ENST00000567642 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.41■■■■□ 3.1
PPP4C-211ENST00000567642 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
PPP4C-211ENST00000567642 FMN1Q68DA7 1419 aa34.39■■■■□ 3.1
PPP4C-211ENST00000567642 NEO1Q92859 1461 aa34.39■■■■□ 3.1
PPP4C-211ENST00000567642 HECW1Q76N89 1606 aa34.36■■■■□ 3.09
PPP4C-211ENST00000567642 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.33■■■■□ 3.091e-10■■□□□ 13.3
PPP4C-211ENST00000567642 RAPGEF3O95398 923 aa34.31■■■■□ 3.08
PPP4C-211ENST00000567642 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.29■■■■□ 3.08
PPP4C-211ENST00000567642 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.26■■■■□ 3.07
PPP4C-211ENST00000567642 FANCAO15360 1455 aa34.23■■■■□ 3.07
PPP4C-211ENST00000567642 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.23■■■■□ 3.07
PPP4C-211ENST00000567642 AKNAQ7Z591 1439 aa34.21■■■■□ 3.07
PPP4C-211ENST00000567642 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.2■■■■□ 3.07
PPP4C-211ENST00000567642 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
PPP4C-211ENST00000567642 RICTORQ6R327 1708 aa34.17■■■■□ 3.06
PPP4C-211ENST00000567642 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
PPP4C-211ENST00000567642 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.13■■■■□ 3.05
PPP4C-211ENST00000567642 KIF14Q15058 1648 aa34.11■■■■□ 3.05
PPP4C-211ENST00000567642 PLCH2O75038 1416 aa34.09■■■■□ 3.05
PPP4C-211ENST00000567642 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
PPP4C-211ENST00000567642 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
PPP4C-211ENST00000567642 CLIP1P30622 1438 aa34.05■■■■□ 3.04
PPP4C-211ENST00000567642 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-211ENST00000567642 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-211ENST00000567642 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.01■■■■□ 3.04
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34■■■■□ 3.03
PPP4C-211ENST00000567642 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.99■■■■□ 3.03
PPP4C-211ENST00000567642 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.99■■■■□ 3.03
PPP4C-211ENST00000567642 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.99■■■■□ 3.03
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