RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567639.1

RAB27A-210, Transcript of RAB27A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 4

Gene RAB27A, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27A-210ENST00000567639 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.35■■■■□ 3.89
RAB27A-210ENST00000567639 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.32■■■■□ 3.88
RAB27A-210ENST00000567639 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.31■■■■□ 3.88
RAB27A-210ENST00000567639 JPH4Q96JJ6 628 aa39.28■■■■□ 3.88
RAB27A-210ENST00000567639 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
RAB27A-210ENST00000567639 EEA1Q15075 1411 aa39.23■■■■□ 3.87
RAB27A-210ENST00000567639 PRXQ9BXM0 1461 aa39.21■■■■□ 3.87
RAB27A-210ENST00000567639 IQGAP2Q13576 1575 aa39.15■■■■□ 3.86
RAB27A-210ENST00000567639 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.12■■■■□ 3.85
RAB27A-210ENST00000567639 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.03■■■■□ 3.84
RAB27A-210ENST00000567639 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
RAB27A-210ENST00000567639 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.94■■■■□ 3.82
RAB27A-210ENST00000567639 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.93■■■■□ 3.82
RAB27A-210ENST00000567639 DISP1Q96F81 1524 aa38.85■■■■□ 3.81
RAB27A-210ENST00000567639 KIF21BO75037 1637 aa38.83■■■■□ 3.81
RAB27A-210ENST00000567639 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.8■■■■□ 3.8
RAB27A-210ENST00000567639 KIAA0556O60303 1618 aa38.79■■■■□ 3.8
RAB27A-210ENST00000567639 PTPRGP23470 1445 aa38.76■■■■□ 3.8
RAB27A-210ENST00000567639 GOLGA3Q08378 1498 aa38.72■■■■□ 3.79
RAB27A-210ENST00000567639 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.68■■■■□ 3.78
RAB27A-210ENST00000567639 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
RAB27A-210ENST00000567639 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
RAB27A-210ENST00000567639 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.53■■■■□ 3.76
RAB27A-210ENST00000567639 UACAQ9BZF9 1416 aa38.53■■■■□ 3.76
RAB27A-210ENST00000567639 SAMD9Q5K651 1589 aa38.52■■■■□ 3.76
RAB27A-210ENST00000567639 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.5■■■■□ 3.75
RAB27A-210ENST00000567639 ABCC2Q92887 1545 aa38.48■■■■□ 3.75
RAB27A-210ENST00000567639 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.46■■■■□ 3.75
RAB27A-210ENST00000567639 MAPKBP1O60336 1514 aa38.45■■■■□ 3.75
RAB27A-210ENST00000567639 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
RAB27A-210ENST00000567639 P3H3Q8IVL6 736 aa38.38■■■■□ 3.73
RAB27A-210ENST00000567639 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.37■■■■□ 3.73
RAB27A-210ENST00000567639 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
RAB27A-210ENST00000567639 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.35■■■■□ 3.73
RAB27A-210ENST00000567639 ABCA8O94911 1581 aa38.35■■■■□ 3.73
RAB27A-210ENST00000567639 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.32■■■■□ 3.72
RAB27A-210ENST00000567639 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.27■■■■□ 3.72
RAB27A-210ENST00000567639 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.26■■■■□ 3.72
RAB27A-210ENST00000567639 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.26■■■■□ 3.72
RAB27A-210ENST00000567639 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.71
RAB27A-210ENST00000567639 DIP2BQ9P265 1576 aa38.23■■■■□ 3.71
RAB27A-210ENST00000567639 ASXL2Q76L83 1435 aa38.21■■■■□ 3.71
RAB27A-210ENST00000567639 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.15■■■■□ 3.7
RAB27A-210ENST00000567639 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.14■■■■□ 3.7
RAB27A-210ENST00000567639 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.11■■■■□ 3.69
RAB27A-210ENST00000567639 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.03■■■■□ 3.68
RAB27A-210ENST00000567639 GLI2P10070 1586 aa38■■■■□ 3.67
RAB27A-210ENST00000567639 ATP10BO94823 1461 aa37.99■■■■□ 3.67
RAB27A-210ENST00000567639 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
RAB27A-210ENST00000567639 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
RAB27A-210ENST00000567639 ARID3CA6NKF2 412 aa37.97■■■■□ 3.67
RAB27A-210ENST00000567639 FMN1Q68DA7 1419 aa37.96■■■■□ 3.67
RAB27A-210ENST00000567639 TSPOAP1O95153 1857 aa37.88■■■■□ 3.65
RAB27A-210ENST00000567639 CLIP1P30622 1438 aa37.87■■■■□ 3.65
RAB27A-210ENST00000567639 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.83■■■■□ 3.65
RAB27A-210ENST00000567639 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
RAB27A-210ENST00000567639 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
RAB27A-210ENST00000567639 HECW1Q76N89 1606 aa37.83■■■■□ 3.65
RAB27A-210ENST00000567639 KCNH8Q96L42 1107 aa37.77■■■■□ 3.64
RAB27A-210ENST00000567639 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
RAB27A-210ENST00000567639 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.73■■■■□ 3.63
RAB27A-210ENST00000567639 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
RAB27A-210ENST00000567639 CEP162Q5TB80 1403 aa37.7■■■■□ 3.63
RAB27A-210ENST00000567639 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
RAB27A-210ENST00000567639 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
RAB27A-210ENST00000567639 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.67■■■■□ 3.62
RAB27A-210ENST00000567639 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.66■■■■□ 3.62
RAB27A-210ENST00000567639 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.66■■■■□ 3.62
RAB27A-210ENST00000567639 CD109Q6YHK3 1445 aa37.65■■■■□ 3.62
RAB27A-210ENST00000567639 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.65■■■■□ 3.62
RAB27A-210ENST00000567639 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.63■■■■□ 3.61
RAB27A-210ENST00000567639 KDM6BO15054 1643 aa37.62■■■■□ 3.61
RAB27A-210ENST00000567639 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.6■■■■□ 3.61
RAB27A-210ENST00000567639 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.59■■■■□ 3.61
RAB27A-210ENST00000567639 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.59■■■■□ 3.61
RAB27A-210ENST00000567639 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.54■■■■□ 3.6
RAB27A-210ENST00000567639 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
RAB27A-210ENST00000567639 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.45■■■■□ 3.593e-6■□□□□ 8.9
RAB27A-210ENST00000567639 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
RAB27A-210ENST00000567639 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.42■■■■□ 3.58
RAB27A-210ENST00000567639 KIF14Q15058 1648 aa37.38■■■■□ 3.57
RAB27A-210ENST00000567639 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
RAB27A-210ENST00000567639 NEO1Q92859 1461 aa37.32■■■■□ 3.56
RAB27A-210ENST00000567639 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.3■■■■□ 3.56
RAB27A-210ENST00000567639 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.26■■■■□ 3.56
RAB27A-210ENST00000567639 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.26■■■■□ 3.56
RAB27A-210ENST00000567639 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.26■■■■□ 3.55
RAB27A-210ENST00000567639 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.24■■■■□ 3.55
RAB27A-210ENST00000567639 FANCAO15360 1455 aa37.23■■■■□ 3.55
RAB27A-210ENST00000567639 PLCH2O75038 1416 aa37.21■■■■□ 3.55
RAB27A-210ENST00000567639 AKNAQ7Z591 1439 aa37.15■■■■□ 3.54
RAB27A-210ENST00000567639 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.13■■■■□ 3.53
RAB27A-210ENST00000567639 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.09■■■■□ 3.53
RAB27A-210ENST00000567639 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.08■■■■□ 3.53
RAB27A-210ENST00000567639 PREX2Q70Z35 1606 aa37.07■■■■□ 3.53
RAB27A-210ENST00000567639 TIAM1Q13009 1591 aa37.06■■■■□ 3.52
RAB27A-210ENST00000567639 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.05■■■■□ 3.52
RAB27A-210ENST00000567639 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.05■■■■□ 3.52
RAB27A-210ENST00000567639 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
RAB27A-210ENST00000567639 ADGRL1O94910 1474 aa37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms