RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.31■■■■□ 3.4
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.29■■■■□ 3.4
RNPS1-218ENST00000566180 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
RNPS1-218ENST00000566180 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.15■■■■□ 3.38
RNPS1-218ENST00000566180 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
RNPS1-218ENST00000566180 PRXQ9BXM0 1461 aa35.97■■■■□ 3.35
RNPS1-218ENST00000566180 IQGAP2Q13576 1575 aa35.95■■■■□ 3.35
RNPS1-218ENST00000566180 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.91■■■■□ 3.34
RNPS1-218ENST00000566180 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.9■■■■□ 3.34
RNPS1-218ENST00000566180 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.85■■■■□ 3.33
RNPS1-218ENST00000566180 EEA1Q15075 1411 aa35.84■■■■□ 3.33
RNPS1-218ENST00000566180 PTPRGP23470 1445 aa35.83■■■■□ 3.33
RNPS1-218ENST00000566180 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.82■■■■□ 3.32
RNPS1-218ENST00000566180 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.8■■■■□ 3.32
RNPS1-218ENST00000566180 DISP1Q96F81 1524 aa35.78■■■■□ 3.32
RNPS1-218ENST00000566180 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.73■■■■□ 3.31
RNPS1-218ENST00000566180 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
RNPS1-218ENST00000566180 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.68■■■■□ 3.3
RNPS1-218ENST00000566180 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
RNPS1-218ENST00000566180 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.63■■■■□ 3.29
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA0556O60303 1618 aa35.61■■■■□ 3.29
RNPS1-218ENST00000566180 GOLGA3Q08378 1498 aa35.58■■■■□ 3.29
RNPS1-218ENST00000566180 MAPKBP1O60336 1514 aa35.57■■■■□ 3.28
RNPS1-218ENST00000566180 UACAQ9BZF9 1416 aa35.57■■■■□ 3.28
RNPS1-218ENST00000566180 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.54■■■■□ 3.28
RNPS1-218ENST00000566180 ABCC2Q92887 1545 aa35.52■■■■□ 3.28
RNPS1-218ENST00000566180 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.48■■■■□ 3.27
RNPS1-218ENST00000566180 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.44■■■■□ 3.26
RNPS1-218ENST00000566180 KIF21BO75037 1637 aa35.41■■■■□ 3.26
RNPS1-218ENST00000566180 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.37■■■■□ 3.25
RNPS1-218ENST00000566180 P3H3Q8IVL6 736 aa35.36■■■■□ 3.25
RNPS1-218ENST00000566180 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.35■■■■□ 3.25
RNPS1-218ENST00000566180 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.33■■■■□ 3.25
RNPS1-218ENST00000566180 DIP2BQ9P265 1576 aa35.33■■■■□ 3.25
RNPS1-218ENST00000566180 ASXL2Q76L83 1435 aa35.32■■■■□ 3.25
RNPS1-218ENST00000566180 ABCA8O94911 1581 aa35.27■■■■□ 3.24
RNPS1-218ENST00000566180 SAMD9Q5K651 1589 aa35.27■■■■□ 3.24
RNPS1-218ENST00000566180 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
RNPS1-218ENST00000566180 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
RNPS1-218ENST00000566180 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.22■■■■□ 3.23
RNPS1-218ENST00000566180 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
RNPS1-218ENST00000566180 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.12■■■■□ 3.21
RNPS1-218ENST00000566180 GLI2P10070 1586 aa35.12■■■■□ 3.21
RNPS1-218ENST00000566180 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
RNPS1-218ENST00000566180 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.09■■■■□ 3.21
RNPS1-218ENST00000566180 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.08■■■■□ 3.21
RNPS1-218ENST00000566180 ATP10BO94823 1461 aa35.03■■■■□ 3.2
RNPS1-218ENST00000566180 ARID3CA6NKF2 412 aa35.03■■■■□ 3.2
RNPS1-218ENST00000566180 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.98■■■■□ 3.19
RNPS1-218ENST00000566180 KCNH8Q96L42 1107 aa34.96■■■■□ 3.19
RNPS1-218ENST00000566180 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
RNPS1-218ENST00000566180 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.91■■■■□ 3.18
RNPS1-218ENST00000566180 TSPOAP1O95153 1857 aa34.9■■■■□ 3.18
RNPS1-218ENST00000566180 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.89■■■■□ 3.18
RNPS1-218ENST00000566180 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
RNPS1-218ENST00000566180 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
RNPS1-218ENST00000566180 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
RNPS1-218ENST00000566180 KDM6BO15054 1643 aa34.83■■■■□ 3.17
RNPS1-218ENST00000566180 CD109Q6YHK3 1445 aa34.82■■■■□ 3.17
RNPS1-218ENST00000566180 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.82■■■■□ 3.16
RNPS1-218ENST00000566180 FMN1Q68DA7 1419 aa34.81■■■■□ 3.16
RNPS1-218ENST00000566180 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.76■■■■□ 3.15
RNPS1-218ENST00000566180 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.75■■■■□ 3.15
RNPS1-218ENST00000566180 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.72■■■■□ 3.15
RNPS1-218ENST00000566180 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
RNPS1-218ENST00000566180 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
RNPS1-218ENST00000566180 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.63■■■■□ 3.13
RNPS1-218ENST00000566180 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
RNPS1-218ENST00000566180 CLIP1P30622 1438 aa34.62■■■■□ 3.13
RNPS1-218ENST00000566180 HECW1Q76N89 1606 aa34.6■■■■□ 3.13
RNPS1-218ENST00000566180 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
RNPS1-218ENST00000566180 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.52■■■■□ 3.12
RNPS1-218ENST00000566180 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.51■■■■□ 3.12
RNPS1-218ENST00000566180 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.46■■■■□ 3.11
RNPS1-218ENST00000566180 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.45■■■■□ 3.11
RNPS1-218ENST00000566180 NEO1Q92859 1461 aa34.45■■■■□ 3.1
RNPS1-218ENST00000566180 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
RNPS1-218ENST00000566180 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
RNPS1-218ENST00000566180 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
RNPS1-218ENST00000566180 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.38■■■■□ 3.09
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.38■■■■□ 3.09
RNPS1-218ENST00000566180 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.38■■■■□ 3.09
RNPS1-218ENST00000566180 CEP162Q5TB80 1403 aa34.38■■■■□ 3.09
RNPS1-218ENST00000566180 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.36■■■■□ 3.09
RNPS1-218ENST00000566180 FANCAO15360 1455 aa34.32■■■■□ 3.08
RNPS1-218ENST00000566180 PLCH2O75038 1416 aa34.31■■■■□ 3.08
RNPS1-218ENST00000566180 RAPGEF3O95398 923 aa34.31■■■■□ 3.08
RNPS1-218ENST00000566180 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.3■■■■□ 3.08
RNPS1-218ENST00000566180 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.3■■■■□ 3.08
RNPS1-218ENST00000566180 AKNAQ7Z591 1439 aa34.3■■■■□ 3.08
RNPS1-218ENST00000566180 KIF14Q15058 1648 aa34.24■■■■□ 3.07
RNPS1-218ENST00000566180 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
RNPS1-218ENST00000566180 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.21■■■■□ 3.07
RNPS1-218ENST00000566180 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.2■■■■□ 3.07
RNPS1-218ENST00000566180 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.15■■■■□ 3.06
RNPS1-218ENST00000566180 ADGRL1O94910 1474 aa34.13■■■■□ 3.05
RNPS1-218ENST00000566180 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.12■■■■□ 3.05
RNPS1-218ENST00000566180 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.09■■■■□ 3.05
RNPS1-218ENST00000566180 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.07■■■■□ 3.04
RNPS1-218ENST00000566180 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms