RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566121.1

CMTM3-212, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-212ENST00000566121 CUL7Q14999 1698 aa26.32■■□□□ 1.8
CMTM3-212ENST00000566121 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.31■■□□□ 1.8
CMTM3-212ENST00000566121 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.29■■□□□ 1.8
CMTM3-212ENST00000566121 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.26■■□□□ 1.79
CMTM3-212ENST00000566121 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
CMTM3-212ENST00000566121 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.03■■□□□ 1.76
CMTM3-212ENST00000566121 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.02■■□□□ 1.76
CMTM3-212ENST00000566121 MAPKBP1O60336 1514 aa26.01■■□□□ 1.75
CMTM3-212ENST00000566121 PTPRGP23470 1445 aa25.99■■□□□ 1.75
CMTM3-212ENST00000566121 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.98■■□□□ 1.75
CMTM3-212ENST00000566121 IQGAP2Q13576 1575 aa25.98■■□□□ 1.75
CMTM3-212ENST00000566121 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.96■■□□□ 1.75
CMTM3-212ENST00000566121 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.95■■□□□ 1.74
CMTM3-212ENST00000566121 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.91■■□□□ 1.74
CMTM3-212ENST00000566121 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.89■■□□□ 1.74
CMTM3-212ENST00000566121 DISP1Q96F81 1524 aa25.88■■□□□ 1.73
CMTM3-212ENST00000566121 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.88■■□□□ 1.73
CMTM3-212ENST00000566121 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.86■■□□□ 1.73
CMTM3-212ENST00000566121 PRXQ9BXM0 1461 aa25.85■■□□□ 1.73
CMTM3-212ENST00000566121 ABCC2Q92887 1545 aa25.83■■□□□ 1.73
CMTM3-212ENST00000566121 UACAQ9BZF9 1416 aa25.8■■□□□ 1.72
CMTM3-212ENST00000566121 DIP2BQ9P265 1576 aa25.8■■□□□ 1.72
CMTM3-212ENST00000566121 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.75■■□□□ 1.71
CMTM3-212ENST00000566121 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.73■■□□□ 1.71
CMTM3-212ENST00000566121 GOLGA3Q08378 1498 aa25.72■■□□□ 1.71
CMTM3-212ENST00000566121 KIAA0556O60303 1618 aa25.72■■□□□ 1.71
CMTM3-212ENST00000566121 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.68■■□□□ 1.7
CMTM3-212ENST00000566121 EEA1Q15075 1411 aa25.68■■□□□ 1.7
CMTM3-212ENST00000566121 ASXL2Q76L83 1435 aa25.68■■□□□ 1.7
CMTM3-212ENST00000566121 GLI2P10070 1586 aa25.68■■□□□ 1.7
CMTM3-212ENST00000566121 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.66■■□□□ 1.7
CMTM3-212ENST00000566121 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CMTM3-212ENST00000566121 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CMTM3-212ENST00000566121 ABCA8O94911 1581 aa25.53■■□□□ 1.68
CMTM3-212ENST00000566121 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CMTM3-212ENST00000566121 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CMTM3-212ENST00000566121 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CMTM3-212ENST00000566121 KDM6BO15054 1643 aa25.48■■□□□ 1.67
CMTM3-212ENST00000566121 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.47■■□□□ 1.67
CMTM3-212ENST00000566121 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CMTM3-212ENST00000566121 TSPOAP1O95153 1857 aa25.44■■□□□ 1.66
CMTM3-212ENST00000566121 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.44■■□□□ 1.66
CMTM3-212ENST00000566121 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.43■■□□□ 1.66
CMTM3-212ENST00000566121 SAMD9Q5K651 1589 aa25.42■■□□□ 1.66
CMTM3-212ENST00000566121 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.36■■□□□ 1.65
CMTM3-212ENST00000566121 ATP10BO94823 1461 aa25.34■■□□□ 1.65
CMTM3-212ENST00000566121 KIF21BO75037 1637 aa25.33■■□□□ 1.65
CMTM3-212ENST00000566121 CD109Q6YHK3 1445 aa25.31■■□□□ 1.64
CMTM3-212ENST00000566121 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.31■■□□□ 1.64
CMTM3-212ENST00000566121 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CMTM3-212ENST00000566121 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.29■■□□□ 1.64
CMTM3-212ENST00000566121 P3H3Q8IVL6 736 aa25.29■■□□□ 1.64
CMTM3-212ENST00000566121 KCNH8Q96L42 1107 aa25.25■■□□□ 1.63
CMTM3-212ENST00000566121 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.25■■□□□ 1.63
CMTM3-212ENST00000566121 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.24■■□□□ 1.63
CMTM3-212ENST00000566121 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.24■■□□□ 1.63
CMTM3-212ENST00000566121 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.23■■□□□ 1.63
CMTM3-212ENST00000566121 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CMTM3-212ENST00000566121 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.17■■□□□ 1.62
CMTM3-212ENST00000566121 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.16■■□□□ 1.62
CMTM3-212ENST00000566121 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.15■■□□□ 1.62
CMTM3-212ENST00000566121 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.1■■□□□ 1.61
CMTM3-212ENST00000566121 NEO1Q92859 1461 aa25.09■■□□□ 1.61
CMTM3-212ENST00000566121 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CMTM3-212ENST00000566121 ARID3CA6NKF2 412 aa25.06■■□□□ 1.6
CMTM3-212ENST00000566121 FMN1Q68DA7 1419 aa25.04■■□□□ 1.6
CMTM3-212ENST00000566121 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CMTM3-212ENST00000566121 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CMTM3-212ENST00000566121 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CMTM3-212ENST00000566121 ADGRL1O94910 1474 aa25.01■■□□□ 1.59
CMTM3-212ENST00000566121 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.99■■□□□ 1.59
CMTM3-212ENST00000566121 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CMTM3-212ENST00000566121 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
CMTM3-212ENST00000566121 RAPGEF3O95398 923 aa24.88■■□□□ 1.57
CMTM3-212ENST00000566121 AKNAQ7Z591 1439 aa24.87■■□□□ 1.57
CMTM3-212ENST00000566121 HECW1Q76N89 1606 aa24.86■■□□□ 1.57
CMTM3-212ENST00000566121 PLCH2O75038 1416 aa24.85■■□□□ 1.57
CMTM3-212ENST00000566121 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.84■■□□□ 1.57
CMTM3-212ENST00000566121 FANCAO15360 1455 aa24.84■■□□□ 1.57
CMTM3-212ENST00000566121 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CMTM3-212ENST00000566121 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CMTM3-212ENST00000566121 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.8■■□□□ 1.56
CMTM3-212ENST00000566121 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.79■■□□□ 1.56
CMTM3-212ENST00000566121 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CMTM3-212ENST00000566121 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.78■■□□□ 1.56
CMTM3-212ENST00000566121 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.78■■□□□ 1.56
CMTM3-212ENST00000566121 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.77■■□□□ 1.56
CMTM3-212ENST00000566121 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.76■■□□□ 1.55
CMTM3-212ENST00000566121 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.75■■□□□ 1.55
CMTM3-212ENST00000566121 RICTORQ6R327 1708 aa24.74■■□□□ 1.55
CMTM3-212ENST00000566121 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CMTM3-212ENST00000566121 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-212ENST00000566121 CLIP1P30622 1438 aa24.72■■□□□ 1.55
CMTM3-212ENST00000566121 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.69■■□□□ 1.54
CMTM3-212ENST00000566121 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.69■■□□□ 1.54
CMTM3-212ENST00000566121 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.69■■□□□ 1.54
CMTM3-212ENST00000566121 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.67■■□□□ 1.54
CMTM3-212ENST00000566121 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.66■■□□□ 1.54
CMTM3-212ENST00000566121 KIF14Q15058 1648 aa24.66■■□□□ 1.54
CMTM3-212ENST00000566121 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.63■■□□□ 1.53
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