RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		43.8	■■■■■ 4.6
PPP4C-208	ENST00000564966	CUL7	Q14999	1698 aa		43.78	■■■■■ 4.6
PPP4C-208	ENST00000564966	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		43.62	■■■■■ 4.57
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.61	■■■■■ 4.57
PPP4C-208	ENST00000564966	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	43.44	■■■■■ 4.54
PPP4C-208	ENST00000564966	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	43.38	■■■■■ 4.53
PPP4C-208	ENST00000564966	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.28	■■■■■ 4.52
PPP4C-208	ENST00000564966	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		43.26	■■■■■ 4.52
PPP4C-208	ENST00000564966	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		43.26	■■■■■ 4.52
PPP4C-208	ENST00000564966	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.25	■■■■■ 4.51
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPRG	P23470	1445 aa		43.22	■■■■■ 4.51
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		43.2	■■■■■ 4.51
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		43.16	■■■■■ 4.5
PPP4C-208	ENST00000564966	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		43.16	■■■■■ 4.5
PPP4C-208	ENST00000564966	MAPKBP1	O60336	1514 aa		43.12	■■■■■ 4.49
PPP4C-208	ENST00000564966	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		43.08	■■■■■ 4.49
PPP4C-208	ENST00000564966	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PPP4C-208	ENST00000564966	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PPP4C-208	ENST00000564966	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.94	■■■■■ 4.46
PPP4C-208	ENST00000564966	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.91	■■■■■ 4.46
PPP4C-208	ENST00000564966	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.88	■■■■■ 4.45
PPP4C-208	ENST00000564966	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.88	■■■■■ 4.45
PPP4C-208	ENST00000564966	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.86	■■■■■ 4.45
PPP4C-208	ENST00000564966	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.81	■■■■■ 4.44
PPP4C-208	ENST00000564966	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PPP4C-208	ENST00000564966	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PPP4C-208	ENST00000564966	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.76	■■■■■ 4.44
PPP4C-208	ENST00000564966	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.73	■■■■■ 4.43
PPP4C-208	ENST00000564966	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.71	■■■■■ 4.43
PPP4C-208	ENST00000564966	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.64	■■■■■ 4.42
PPP4C-208	ENST00000564966	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.62	■■■■■ 4.41
PPP4C-208	ENST00000564966	KDM6B	O15054	1643 aa		42.62	■■■■■ 4.41
PPP4C-208	ENST00000564966	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
PPP4C-208	ENST00000564966	GLI2	P10070	1586 aa		42.52	■■■■■ 4.4
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
PPP4C-208	ENST00000564966	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.49	■■■■■ 4.39
PPP4C-208	ENST00000564966	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
PPP4C-208	ENST00000564966	EEA1	Q15075	1411 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PPP4C-208	ENST00000564966	ABCA8	O94911	1581 aa		42.41	■■■■■ 4.38
PPP4C-208	ENST00000564966	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.38	■■■■■ 4.38
PPP4C-208	ENST00000564966	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
PPP4C-208	ENST00000564966	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.37	■■■■■ 4.37
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.32	■■■■■ 4.37
PPP4C-208	ENST00000564966	ARID3C	A6NKF2	412 aa		42.32	■■■■■ 4.37
PPP4C-208	ENST00000564966	KCNH8	Q96L42	1107 aa		42.32	■■■■■ 4.37
PPP4C-208	ENST00000564966	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		42.28	■■■■■ 4.36
PPP4C-208	ENST00000564966	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PPP4C-208	ENST00000564966	CD109	Q6YHK3	1445 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PPP4C-208	ENST00000564966	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.12	■■■■■ 4.33
PPP4C-208	ENST00000564966	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.11	■■■■■ 4.33
PPP4C-208	ENST00000564966	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	42.11	■■■■■ 4.33
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF21B	O75037	1637 aa		42.09	■■■■■ 4.33
PPP4C-208	ENST00000564966	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		42.09	■■■■■ 4.33
PPP4C-208	ENST00000564966	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.08	■■■■■ 4.33
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP10B	O94823	1461 aa		42.08	■■■■■ 4.33
PPP4C-208	ENST00000564966	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
PPP4C-208	ENST00000564966	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		42.07	■■■■■ 4.33
PPP4C-208	ENST00000564966	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		42.06	■■■■■ 4.32
PPP4C-208	ENST00000564966	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.01	■■■■■ 4.32
PPP4C-208	ENST00000564966	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		42	■■■■■ 4.31
PPP4C-208	ENST00000564966	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
PPP4C-208	ENST00000564966	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.9	■■■■■ 4.3
PPP4C-208	ENST00000564966	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.88	■■■■■ 4.29
PPP4C-208	ENST00000564966	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.8	■■■■■ 4.28
PPP4C-208	ENST00000564966	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.79	■■■■■ 4.28
PPP4C-208	ENST00000564966	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.75	■■■■■ 4.27
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.7	■■■■■ 4.27
PPP4C-208	ENST00000564966	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.65	■■■■■ 4.26
PPP4C-208	ENST00000564966	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.63	■■■■■ 4.25
PPP4C-208	ENST00000564966	NEO1	Q92859	1461 aa		41.58	■■■■■ 4.25
PPP4C-208	ENST00000564966	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.57	■■■■■ 4.25
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.56	■■■■■ 4.24
PPP4C-208	ENST00000564966	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.56	■■■■■ 4.24
PPP4C-208	ENST00000564966	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.54	■■■■■ 4.24
PPP4C-208	ENST00000564966	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.48	■■■■■ 4.23
PPP4C-208	ENST00000564966	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.46	■■■■■ 4.23	1e-10	■■□□□ 13.3
PPP4C-208	ENST00000564966	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.42	■■■■■ 4.22
PPP4C-208	ENST00000564966	FANCA	O15360	1455 aa		41.4	■■■■■ 4.22
PPP4C-208	ENST00000564966	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.38	■■■■■ 4.21
PPP4C-208	ENST00000564966	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.37	■■■■■ 4.21
PPP4C-208	ENST00000564966	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.36	■■■■■ 4.21
PPP4C-208	ENST00000564966	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	41.34	■■■■■ 4.21
PPP4C-208	ENST00000564966	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.33	■■■■■ 4.21
PPP4C-208	ENST00000564966	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.3	■■■■■ 4.2
PPP4C-208	ENST00000564966	RICTOR	Q6R327	1708 aa		41.21	■■■■■ 4.19
PPP4C-208	ENST00000564966	PLCH2	O75038	1416 aa		41.2	■■■■■ 4.19
PPP4C-208	ENST00000564966	CLIP1	P30622	1438 aa		41.18	■■■■■ 4.18
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF14	Q15058	1648 aa		41.18	■■■■■ 4.18
PPP4C-208	ENST00000564966	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	41.16	■■■■■ 4.18
PPP4C-208	ENST00000564966	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		41.15	■■■■■ 4.18
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.14	■■■■■ 4.18
PPP4C-208	ENST00000564966	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	41.14	■■■■■ 4.18
PPP4C-208	ENST00000564966	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		41.14	■■■■■ 4.18
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.14	■■■■■ 4.18
PPP4C-208	ENST00000564966	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.12	■■■■■ 4.17
PPP4C-208	ENST00000564966	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		41.12	■■■■■ 4.17
PPP4C-208	ENST00000564966	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.1	■■■■■ 4.17
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		41.07	■■■■■ 4.16
PPP4C-208	ENST00000564966	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.06	■■■■■ 4.16

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