RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564160.1

ERVK13-1-202, Transcript of endogenous retrovirus group K13 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene ERVK13-1, Length 983 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1-202ENST00000564160 IGF1RP08069 1367 aa46.08■■■■■ 4.97
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIF27Q86VH2 1401 aa46.02■■■■■ 4.96
ERVK13-1-202ENST00000564160 CUL7Q14999 1698 aa46■■■■■ 4.95
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.98■■■■■ 4.95
ERVK13-1-202ENST00000564160 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.88■■■■■ 4.94
ERVK13-1-202ENST00000564160 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.87■■■■■ 4.93
ERVK13-1-202ENST00000564160 MAPKBP1O60336 1514 aa45.84■■■■■ 4.93
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.81■■■■■ 4.92
ERVK13-1-202ENST00000564160 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.74■■■■■ 4.91
ERVK13-1-202ENST00000564160 DIP2BQ9P265 1576 aa45.73■■■■■ 4.91
ERVK13-1-202ENST00000564160 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.72■■■■■ 4.91
ERVK13-1-202ENST00000564160 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.71■■■■■ 4.91
ERVK13-1-202ENST00000564160 PTPRGP23470 1445 aa45.55■■■■■ 4.88
ERVK13-1-202ENST00000564160 IQGAP2Q13576 1575 aa45.51■■■■■ 4.88
ERVK13-1-202ENST00000564160 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.46■■■■■ 4.87
ERVK13-1-202ENST00000564160 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.46■■■■■ 4.87
ERVK13-1-202ENST00000564160 TSPOAP1O95153 1857 aa45.4■■■■■ 4.86
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCC2Q92887 1545 aa45.38■■■■■ 4.86
ERVK13-1-202ENST00000564160 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.86
ERVK13-1-202ENST00000564160 DISP1Q96F81 1524 aa45.35■■■■■ 4.85
ERVK13-1-202ENST00000564160 KDM6BO15054 1643 aa45.34■■■■■ 4.85
ERVK13-1-202ENST00000564160 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.29■■■■■ 4.84
ERVK13-1-202ENST00000564160 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.29■■■■■ 4.84
ERVK13-1-202ENST00000564160 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.25■■■■■ 4.83
ERVK13-1-202ENST00000564160 ASXL2Q76L83 1435 aa45.24■■■■■ 4.83
ERVK13-1-202ENST00000564160 UACAQ9BZF9 1416 aa45.22■■■■■ 4.83
ERVK13-1-202ENST00000564160 PLB1Q6P1J6 1458 aa45.19■■■■■ 4.82
ERVK13-1-202ENST00000564160 GLI2P10070 1586 aa45.17■■■■■ 4.82
ERVK13-1-202ENST00000564160 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIAA0556O60303 1618 aa45.12■■■■■ 4.81
ERVK13-1-202ENST00000564160 KDM5BQ9UGL1 1544 aa45.11■■■■■ 4.81
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
ERVK13-1-202ENST00000564160 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45■■■■■ 4.79
ERVK13-1-202ENST00000564160 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.99■■■■■ 4.79
ERVK13-1-202ENST00000564160 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
ERVK13-1-202ENST00000564160 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.93■■■■■ 4.78
ERVK13-1-202ENST00000564160 PRXQ9BXM0 1461 aa44.83■■■■■ 4.77
ERVK13-1-202ENST00000564160 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
ERVK13-1-202ENST00000564160 GOLGA3Q08378 1498 aa44.78■■■■■ 4.76
ERVK13-1-202ENST00000564160 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.76■■■■■ 4.76
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCA8O94911 1581 aa44.75■■■■■ 4.75
ERVK13-1-202ENST00000564160 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.73■■■■■ 4.75
ERVK13-1-202ENST00000564160 ADGRL1O94910 1474 aa44.58■■■■■ 4.73
ERVK13-1-202ENST00000564160 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.55■■■■■ 4.72
ERVK13-1-202ENST00000564160 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.5■■■■■ 4.71
ERVK13-1-202ENST00000564160 CD109Q6YHK3 1445 aa44.49■■■■■ 4.71
ERVK13-1-202ENST00000564160 KCNH8Q96L42 1107 aa44.45■■■■■ 4.71
ERVK13-1-202ENST00000564160 SAMD9Q5K651 1589 aa44.36■■■■■ 4.69
ERVK13-1-202ENST00000564160 P3H3Q8IVL6 736 aa44.36■■■■■ 4.69
ERVK13-1-202ENST00000564160 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.35■■■■■ 4.69
ERVK13-1-202ENST00000564160 ATP10BO94823 1461 aa44.34■■■■■ 4.69
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARID3CA6NKF2 412 aa44.27■■■■■ 4.68
ERVK13-1-202ENST00000564160 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.2■■■■■ 4.67
ERVK13-1-202ENST00000564160 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.2■■■■■ 4.67
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44.18■■■■■ 4.66
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.18■■■■■ 4.66
ERVK13-1-202ENST00000564160 EEA1Q15075 1411 aa44.13■■■■■ 4.65
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIF21BO75037 1637 aa44.08■■■■■ 4.65
ERVK13-1-202ENST00000564160 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
ERVK13-1-202ENST00000564160 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.05■■■■■ 4.64
ERVK13-1-202ENST00000564160 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.99■■■■■ 4.63
ERVK13-1-202ENST00000564160 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.99■■■■■ 4.63
ERVK13-1-202ENST00000564160 NEO1Q92859 1461 aa43.93■■■■■ 4.62
ERVK13-1-202ENST00000564160 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
ERVK13-1-202ENST00000564160 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
ERVK13-1-202ENST00000564160 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
ERVK13-1-202ENST00000564160 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.85■■■■■ 4.61
ERVK13-1-202ENST00000564160 RAPGEF3O95398 923 aa43.85■■■■■ 4.61
ERVK13-1-202ENST00000564160 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.82■■■■■ 4.61
ERVK13-1-202ENST00000564160 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.78■■■■■ 4.6
ERVK13-1-202ENST00000564160 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.77■■■■■ 4.6
ERVK13-1-202ENST00000564160 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.72■■■■■ 4.59
ERVK13-1-202ENST00000564160 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.68■■■■■ 4.58
ERVK13-1-202ENST00000564160 RICTORQ6R327 1708 aa43.65■■■■■ 4.58
ERVK13-1-202ENST00000564160 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.64■■■■■ 4.58
ERVK13-1-202ENST00000564160 PTPRMP28827 1452 aa43.64■■■■■ 4.58
ERVK13-1-202ENST00000564160 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.63■■■■■ 4.58
ERVK13-1-202ENST00000564160 AKNAQ7Z591 1439 aa43.61■■■■■ 4.57
ERVK13-1-202ENST00000564160 FANCAO15360 1455 aa43.6■■■■■ 4.57
ERVK13-1-202ENST00000564160 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.59■■■■■ 4.57
ERVK13-1-202ENST00000564160 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.59■■■■■ 4.57
ERVK13-1-202ENST00000564160 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
ERVK13-1-202ENST00000564160 MADDQ8WXG6 1647 aa43.53■■■■■ 4.56
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.48■■■■■ 4.55
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.44■■■■■ 4.54
ERVK13-1-202ENST00000564160 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.42■■■■■ 4.54
ERVK13-1-202ENST00000564160 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
ERVK13-1-202ENST00000564160 FMN1Q68DA7 1419 aa43.39■■■■■ 4.54
ERVK13-1-202ENST00000564160 HECW1Q76N89 1606 aa43.39■■■■■ 4.54
ERVK13-1-202ENST00000564160 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.39■■■■■ 4.54
ERVK13-1-202ENST00000564160 PLCH2O75038 1416 aa43.38■■■■■ 4.53
ERVK13-1-202ENST00000564160 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.37■■■■■ 4.53
ERVK13-1-202ENST00000564160 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.36■■■■■ 4.53
ERVK13-1-202ENST00000564160 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.35■■■■■ 4.53
ERVK13-1-202ENST00000564160 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.32■■■■■ 4.52
ERVK13-1-202ENST00000564160 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
ERVK13-1-202ENST00000564160 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.29■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms