RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 JPH4Q96JJ6 628 aa52.27■■■■■ 5.96
CMTM4-204ENST00000563952 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP52.24■■■■■ 5.95
CMTM4-204ENST00000563952 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa52.19■■■■■ 5.94
CMTM4-204ENST00000563952 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa52.04■■■■■ 5.92
CMTM4-204ENST00000563952 TRHP20396 242 aaPredicted RBP51.95■■■■■ 5.91
CMTM4-204ENST00000563952 IQGAP2Q13576 1575 aa51.87■■■■■ 5.89
CMTM4-204ENST00000563952 PRXQ9BXM0 1461 aa51.72■■■■■ 5.87
CMTM4-204ENST00000563952 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa51.67■■■■■ 5.86
CMTM4-204ENST00000563952 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa51.61■■■■■ 5.85
CMTM4-204ENST00000563952 CSRNP3Q8WYN3 585 aa51.6■■■■■ 5.85
CMTM4-204ENST00000563952 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP51.58■■■■■ 5.85
CMTM4-204ENST00000563952 PTPRGP23470 1445 aa51.55■■■■■ 5.84
CMTM4-204ENST00000563952 UGGT2Q9NYU1 1516 aa51.54■■■■■ 5.84
CMTM4-204ENST00000563952 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.54■■■■■ 5.84
CMTM4-204ENST00000563952 EEA1Q15075 1411 aa51.54■■■■■ 5.84
CMTM4-204ENST00000563952 TNIKQ9UKE5 1360 aa51.53■■■■■ 5.84
CMTM4-204ENST00000563952 DISP1Q96F81 1524 aa51.52■■■■■ 5.84
CMTM4-204ENST00000563952 ADCY10Q96PN6 1610 aa51.51■■■■■ 5.84
CMTM4-204ENST00000563952 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP51.45■■■■■ 5.83
CMTM4-204ENST00000563952 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP51.43■■■■■ 5.82
CMTM4-204ENST00000563952 KIAA0556O60303 1618 aa51.39■■■■■ 5.82
CMTM4-204ENST00000563952 GOLGA3Q08378 1498 aa51.23■■■■■ 5.79
CMTM4-204ENST00000563952 MAPKBP1O60336 1514 aa51.22■■■■■ 5.79
CMTM4-204ENST00000563952 UACAQ9BZF9 1416 aa51.18■■■■■ 5.78
CMTM4-204ENST00000563952 KIF13AQ9H1H9 1805 aa51.15■■■■■ 5.78
CMTM4-204ENST00000563952 ABCC2Q92887 1545 aa51.13■■■■■ 5.77
CMTM4-204ENST00000563952 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa51.12■■■■■ 5.77
CMTM4-204ENST00000563952 KIF21BO75037 1637 aa51.09■■■■■ 5.77
CMTM4-204ENST00000563952 ABCC10Q5T3U5 1492 aa51.05■■■■■ 5.76
CMTM4-204ENST00000563952 FAM69CQ0P6D2 419 aa51.01■■■■■ 5.76
CMTM4-204ENST00000563952 DIP2BQ9P265 1576 aa50.98■■■■■ 5.75
CMTM4-204ENST00000563952 P3H3Q8IVL6 736 aa50.96■■■■■ 5.75
CMTM4-204ENST00000563952 PLB1Q6P1J6 1458 aa50.94■■■■■ 5.75
CMTM4-204ENST00000563952 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP50.9■■■■■ 5.74
CMTM4-204ENST00000563952 KDM5BQ9UGL1 1544 aa50.89■■■■■ 5.74
CMTM4-204ENST00000563952 EHMT2Q96KQ7 1210 aa50.89■■■■■ 5.74
CMTM4-204ENST00000563952 SAMD9Q5K651 1589 aa50.88■■■■■ 5.74
CMTM4-204ENST00000563952 ASXL2Q76L83 1435 aa50.87■■■■■ 5.73
CMTM4-204ENST00000563952 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP50.85■■■■■ 5.73
CMTM4-204ENST00000563952 ABCA8O94911 1581 aa50.84■■■■■ 5.73
CMTM4-204ENST00000563952 UBTFP17480 764 aaKnown RBP50.73■■■■■ 5.71
CMTM4-204ENST00000563952 TSPOAP1O95153 1857 aa50.65■■■■■ 5.7
CMTM4-204ENST00000563952 FHOD3Q2V2M9 1422 aa50.62■■■■■ 5.69
CMTM4-204ENST00000563952 GLI2P10070 1586 aa50.58■■■■■ 5.69
CMTM4-204ENST00000563952 EFCAB5A4FU69 1503 aa50.57■■■■■ 5.69
CMTM4-204ENST00000563952 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP50.56■■■■■ 5.68
CMTM4-204ENST00000563952 ARID3CA6NKF2 412 aa50.54■■■■■ 5.68
CMTM4-204ENST00000563952 WDR7Q9Y4E6 1490 aa50.53■■■■■ 5.68
CMTM4-204ENST00000563952 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa50.52■■■■■ 5.68
CMTM4-204ENST00000563952 ATP10BO94823 1461 aa50.41■■■■■ 5.66
CMTM4-204ENST00000563952 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa50.37■■■■■ 5.65
CMTM4-204ENST00000563952 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP50.36■■■■■ 5.65
CMTM4-204ENST00000563952 KCNH8Q96L42 1107 aa50.35■■■■■ 5.65
CMTM4-204ENST00000563952 KDM6BO15054 1643 aa50.31■■■■■ 5.64
CMTM4-204ENST00000563952 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP50.31■■■■■ 5.64
CMTM4-204ENST00000563952 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP50.27■■■■■ 5.64
CMTM4-204ENST00000563952 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
CMTM4-204ENST00000563952 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa50.27■■■■■ 5.64
CMTM4-204ENST00000563952 CFAP43Q8NDM7 1665 aa50.16■■■■■ 5.62
CMTM4-204ENST00000563952 TEX14Q8IWB6 1497 aa50.16■■■■■ 5.62
CMTM4-204ENST00000563952 CD109Q6YHK3 1445 aa50.12■■■■■ 5.61
CMTM4-204ENST00000563952 FMN1Q68DA7 1419 aa50.11■■■■■ 5.61
CMTM4-204ENST00000563952 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP50.01■■■■■ 5.6
CMTM4-204ENST00000563952 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa50.01■■■■■ 5.6
CMTM4-204ENST00000563952 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP49.96■■■■■ 5.59
CMTM4-204ENST00000563952 PLEKHD1A6NEE1 506 aa49.96■■■■■ 5.59
CMTM4-204ENST00000563952 HECW1Q76N89 1606 aa49.96■■■■■ 5.59
CMTM4-204ENST00000563952 ABCA9Q8IUA7 1624 aa49.96■■■■■ 5.59
CMTM4-204ENST00000563952 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP49.92■■■■■ 5.58
CMTM4-204ENST00000563952 CLIP1P30622 1438 aa49.85■■■■■ 5.57
CMTM4-204ENST00000563952 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP49.72■■■■■ 5.55
CMTM4-204ENST00000563952 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP49.7■■■■■ 5.55
CMTM4-204ENST00000563952 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa49.7■■■■■ 5.55
CMTM4-204ENST00000563952 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP49.67■■■■■ 5.54
CMTM4-204ENST00000563952 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa49.67■■■■■ 5.54
CMTM4-204ENST00000563952 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP49.64■■■■■ 5.54
CMTM4-204ENST00000563952 TTC37Q6PGP7 1564 aa49.62■■■■■ 5.53
CMTM4-204ENST00000563952 ARAP3Q8WWN8 1544 aa49.59■■■■■ 5.53
CMTM4-204ENST00000563952 NEO1Q92859 1461 aa49.57■■■■■ 5.53
CMTM4-204ENST00000563952 PHLDB1Q86UU1 1377 aa49.56■■■■■ 5.52
CMTM4-204ENST00000563952 FYCO1Q9BQS8 1478 aa49.54■■■■■ 5.52
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC18Q5T9S5 1454 aa49.53■■■■■ 5.52
CMTM4-204ENST00000563952 CEP162Q5TB80 1403 aa49.52■■■■■ 5.52
CMTM4-204ENST00000563952 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP49.5■■■■■ 5.51
CMTM4-204ENST00000563952 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa49.49■■■■■ 5.51
CMTM4-204ENST00000563952 KIF14Q15058 1648 aa49.45■■■■■ 5.51
CMTM4-204ENST00000563952 FANCAO15360 1455 aa49.44■■■■■ 5.51
CMTM4-204ENST00000563952 CFAP74Q9C0B2 1584 aa49.42■■■■■ 5.5
CMTM4-204ENST00000563952 RAPGEF3O95398 923 aa49.39■■■■■ 5.5
CMTM4-204ENST00000563952 AKNAQ7Z591 1439 aa49.37■■■■■ 5.49
CMTM4-204ENST00000563952 PLCH2O75038 1416 aa49.34■■■■■ 5.49
CMTM4-204ENST00000563952 MYO5CQ9NQX4 1742 aa49.34■■■■■ 5.49
CMTM4-204ENST00000563952 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa49.33■■■■■ 5.49
CMTM4-204ENST00000563952 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa49.28■■■■■ 5.48
CMTM4-204ENST00000563952 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP49.26■■■■■ 5.48
CMTM4-204ENST00000563952 ADGRL1O94910 1474 aa49.22■■■■■ 5.47
CMTM4-204ENST00000563952 RICTORQ6R327 1708 aa49.19■■■■■ 5.46
CMTM4-204ENST00000563952 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa49.18■■■■■ 5.46
CMTM4-204ENST00000563952 ARHGAP5Q13017 1502 aa49.16■■■■■ 5.46
CMTM4-204ENST00000563952 SCAPERQ9BY12 1400 aa49.1■■■■■ 5.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms