RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563597.5

PPP4C-206, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 815 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-206ENST00000563597 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
PPP4C-206ENST00000563597 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
PPP4C-206ENST00000563597 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.6■■■■■ 4.41
PPP4C-206ENST00000563597 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.56■■■■■ 4.4
PPP4C-206ENST00000563597 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.29■■■■■ 4.36
PPP4C-206ENST00000563597 IQGAP2Q13576 1575 aa42.23■■■■■ 4.35
PPP4C-206ENST00000563597 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.14■■■■■ 4.34
PPP4C-206ENST00000563597 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.06■■■■■ 4.32
PPP4C-206ENST00000563597 PTPRGP23470 1445 aa42.04■■■■■ 4.32
PPP4C-206ENST00000563597 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.04■■■■■ 4.32
PPP4C-206ENST00000563597 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.03■■■■■ 4.32
PPP4C-206ENST00000563597 PRXQ9BXM0 1461 aa41.99■■■■■ 4.31
PPP4C-206ENST00000563597 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.99■■■■■ 4.31
PPP4C-206ENST00000563597 DISP1Q96F81 1524 aa41.97■■■■■ 4.31
PPP4C-206ENST00000563597 MAPKBP1O60336 1514 aa41.95■■■■■ 4.31
PPP4C-206ENST00000563597 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.91■■■■■ 4.3
PPP4C-206ENST00000563597 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.88■■■■■ 4.3
PPP4C-206ENST00000563597 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
PPP4C-206ENST00000563597 KIAA0556O60303 1618 aa41.83■■■■■ 4.29
PPP4C-206ENST00000563597 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.82■■■■■ 4.29
PPP4C-206ENST00000563597 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.79■■■■■ 4.28
PPP4C-206ENST00000563597 EEA1Q15075 1411 aa41.78■■■■■ 4.28
PPP4C-206ENST00000563597 ABCC2Q92887 1545 aa41.77■■■■■ 4.28
PPP4C-206ENST00000563597 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.77■■■■■ 4.28
PPP4C-206ENST00000563597 UACAQ9BZF9 1416 aa41.75■■■■■ 4.27
PPP4C-206ENST00000563597 DIP2BQ9P265 1576 aa41.73■■■■■ 4.27
PPP4C-206ENST00000563597 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.73■■■■■ 4.27
PPP4C-206ENST00000563597 GOLGA3Q08378 1498 aa41.72■■■■■ 4.27
PPP4C-206ENST00000563597 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.56■■■■■ 4.24
PPP4C-206ENST00000563597 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.55■■■■■ 4.24
PPP4C-206ENST00000563597 ASXL2Q76L83 1435 aa41.55■■■■■ 4.24
PPP4C-206ENST00000563597 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.47■■■■■ 4.23
PPP4C-206ENST00000563597 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
PPP4C-206ENST00000563597 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
PPP4C-206ENST00000563597 ABCA8O94911 1581 aa41.41■■■■■ 4.22
PPP4C-206ENST00000563597 GLI2P10070 1586 aa41.39■■■■■ 4.22
PPP4C-206ENST00000563597 KIF21BO75037 1637 aa41.36■■■■■ 4.21
PPP4C-206ENST00000563597 SAMD9Q5K651 1589 aa41.36■■■■■ 4.21
PPP4C-206ENST00000563597 TSPOAP1O95153 1857 aa41.36■■■■■ 4.21
PPP4C-206ENST00000563597 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
PPP4C-206ENST00000563597 P3H3Q8IVL6 736 aa41.29■■■■■ 4.2
PPP4C-206ENST00000563597 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.26■■■■■ 4.2
PPP4C-206ENST00000563597 KDM6BO15054 1643 aa41.22■■■■■ 4.19
PPP4C-206ENST00000563597 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.18■■■■■ 4.18
PPP4C-206ENST00000563597 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
PPP4C-206ENST00000563597 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
PPP4C-206ENST00000563597 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.08■■■■■ 4.17
PPP4C-206ENST00000563597 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.07■■■■■ 4.17
PPP4C-206ENST00000563597 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.06■■■■■ 4.16
PPP4C-206ENST00000563597 ATP10BO94823 1461 aa41.06■■■■■ 4.16
PPP4C-206ENST00000563597 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.05■■■■■ 4.16
PPP4C-206ENST00000563597 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
PPP4C-206ENST00000563597 ARID3CA6NKF2 412 aa40.99■■■■■ 4.15
PPP4C-206ENST00000563597 KCNH8Q96L42 1107 aa40.99■■■■■ 4.15
PPP4C-206ENST00000563597 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.98■■■■■ 4.15
PPP4C-206ENST00000563597 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
PPP4C-206ENST00000563597 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.94■■■■■ 4.14
PPP4C-206ENST00000563597 CD109Q6YHK3 1445 aa40.93■■■■■ 4.14
PPP4C-206ENST00000563597 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
PPP4C-206ENST00000563597 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4C-206ENST00000563597 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
PPP4C-206ENST00000563597 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
PPP4C-206ENST00000563597 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
PPP4C-206ENST00000563597 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.75■■■■■ 4.11
PPP4C-206ENST00000563597 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.75■■■■■ 4.11
PPP4C-206ENST00000563597 FMN1Q68DA7 1419 aa40.71■■■■■ 4.11
PPP4C-206ENST00000563597 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.66■■■■■ 4.1
PPP4C-206ENST00000563597 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.58■■■■■ 4.09
PPP4C-206ENST00000563597 HECW1Q76N89 1606 aa40.57■■■■■ 4.09
PPP4C-206ENST00000563597 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.57■■■■■ 4.08
PPP4C-206ENST00000563597 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
PPP4C-206ENST00000563597 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.53■■■■■ 4.08
PPP4C-206ENST00000563597 NEO1Q92859 1461 aa40.51■■■■■ 4.08
PPP4C-206ENST00000563597 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
PPP4C-206ENST00000563597 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.061e-10■■□□□ 13.3
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PPP4C-206ENST00000563597 ADGRL1O94910 1474 aa40.37■■■■■ 4.05
PPP4C-206ENST00000563597 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.32■■■■■ 4.05
PPP4C-206ENST00000563597 CLIP1P30622 1438 aa40.31■■■■■ 4.04
PPP4C-206ENST00000563597 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.31■■■■■ 4.04
PPP4C-206ENST00000563597 FANCAO15360 1455 aa40.31■■■■■ 4.04
PPP4C-206ENST00000563597 RAPGEF3O95398 923 aa40.28■■■■■ 4.04
PPP4C-206ENST00000563597 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
PPP4C-206ENST00000563597 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.27■■■■■ 4.04
PPP4C-206ENST00000563597 AKNAQ7Z591 1439 aa40.25■■■■■ 4.03
PPP4C-206ENST00000563597 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
PPP4C-206ENST00000563597 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.23■■■■■ 4.03
PPP4C-206ENST00000563597 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.23■■■■■ 4.03
PPP4C-206ENST00000563597 PLCH2O75038 1416 aa40.22■■■■■ 4.03
PPP4C-206ENST00000563597 KIF14Q15058 1648 aa40.2■■■■■ 4.03
PPP4C-206ENST00000563597 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
PPP4C-206ENST00000563597 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.19■■■■■ 4.02
PPP4C-206ENST00000563597 RICTORQ6R327 1708 aa40.14■■■■■ 4.02
PPP4C-206ENST00000563597 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.14■■■■■ 4.02
PPP4C-206ENST00000563597 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.06■■■■■ 4
PPP4C-206ENST00000563597 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.03■■■■■ 4
PPP4C-206ENST00000563597 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.01■■■■■ 4
PPP4C-206ENST00000563597 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.01■■■■■ 4
PPP4C-206ENST00000563597 CEP162Q5TB80 1403 aa39.98■■■■□ 3.99
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