RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563367.1

NME3-203, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 3

Gene NME3, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-203ENST00000563367 JPH4Q96JJ6 628 aa48.02■■■■■ 5.28
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NME3-203ENST00000563367 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.87■■■■■ 5.25
NME3-203ENST00000563367 IQGAP2Q13576 1575 aa47.69■■■■■ 5.22
NME3-203ENST00000563367 PRXQ9BXM0 1461 aa47.66■■■■■ 5.22
NME3-203ENST00000563367 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.63■■■■■ 5.22
NME3-203ENST00000563367 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.54■■■■■ 5.2
NME3-203ENST00000563367 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.51■■■■■ 5.2
NME3-203ENST00000563367 EEA1Q15075 1411 aa47.48■■■■■ 5.19
NME3-203ENST00000563367 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.47■■■■■ 5.19
NME3-203ENST00000563367 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.43■■■■■ 5.18
NME3-203ENST00000563367 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.42■■■■■ 5.18
NME3-203ENST00000563367 DISP1Q96F81 1524 aa47.4■■■■■ 5.18
NME3-203ENST00000563367 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.38■■■■■ 5.18
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NME3-203ENST00000563367 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.32■■■■■ 5.17
NME3-203ENST00000563367 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.28■■■■■ 5.16
NME3-203ENST00000563367 KIAA0556O60303 1618 aa47.26■■■■■ 5.16
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NME3-203ENST00000563367 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.09■■■■■ 5.13
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NME3-203ENST00000563367 MAPKBP1O60336 1514 aa47■■■■■ 5.12
NME3-203ENST00000563367 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.99■■■■■ 5.11
NME3-203ENST00000563367 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.98■■■■■ 5.11
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NME3-203ENST00000563367 ADGRL1O94910 1474 aa45.15■■■■■ 4.82
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