RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EEA1Q15075 1411 aa37.25■■■■□ 3.55
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.25■■■■□ 3.55
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRXQ9BXM0 1461 aa37.18■■■■□ 3.54
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.14■■■■□ 3.54
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 JPH4Q96JJ6 628 aa37.14■■■■□ 3.54
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.13■■■■□ 3.53
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.09■■■■□ 3.53
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IQGAP2Q13576 1575 aa37.07■■■■□ 3.52
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.98■■■■□ 3.51
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.87■■■■□ 3.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF21BO75037 1637 aa36.85■■■■□ 3.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.85■■■■□ 3.49
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DISP1Q96F81 1524 aa36.76■■■■□ 3.48
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA0556O60303 1618 aa36.72■■■■□ 3.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.7■■■■□ 3.47
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GOLGA3Q08378 1498 aa36.67■■■■□ 3.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTPRGP23470 1445 aa36.66■■■■□ 3.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.56■■■■□ 3.44
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SAMD9Q5K651 1589 aa36.49■■■■□ 3.43
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.43■■■■□ 3.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UACAQ9BZF9 1416 aa36.43■■■■□ 3.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCC2Q92887 1545 aa36.4■■■■□ 3.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.4■■■■□ 3.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.42
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.37■■■■□ 3.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAPKBP1O60336 1514 aa36.35■■■■□ 3.41
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCA8O94911 1581 aa36.31■■■■□ 3.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 P3H3Q8IVL6 736 aa36.3■■■■□ 3.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.3■■■■□ 3.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.25■■■■□ 3.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.22■■■■□ 3.39
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.14■■■■□ 3.38
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.13■■■■□ 3.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.13■■■■□ 3.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.12■■■■□ 3.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DIP2BQ9P265 1576 aa36.11■■■■□ 3.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASXL2Q76L83 1435 aa36.1■■■■□ 3.37
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FMN1Q68DA7 1419 aa36■■■■□ 3.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.99■■■■□ 3.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP10BO94823 1461 aa35.96■■■■□ 3.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.96■■■■□ 3.35
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLIP1P30622 1438 aa35.93■■■■□ 3.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GLI2P10070 1586 aa35.93■■■■□ 3.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARID3CA6NKF2 412 aa35.87■■■■□ 3.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HECW1Q76N89 1606 aa35.85■■■■□ 3.33
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP162Q5TB80 1403 aa35.79■■■■□ 3.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.77■■■■□ 3.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.75■■■■□ 3.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSPOAP1O95153 1857 aa35.74■■■■□ 3.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.71■■■■□ 3.31
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.69■■■■□ 3.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNH8Q96L42 1107 aa35.68■■■■□ 3.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.66■■■■□ 3.3
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.63■■■■□ 3.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.61■■■■□ 3.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.61■■■■□ 3.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.6■■■■□ 3.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.6■■■■□ 3.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD109Q6YHK3 1445 aa35.58■■■■□ 3.29
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.56■■■■□ 3.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDM6BO15054 1643 aa35.52■■■■□ 3.28
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.44■■■■□ 3.265e-7■■■■□ 21.7
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.41■■■■□ 3.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF14Q15058 1648 aa35.4■■■■□ 3.26
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.37■■■■□ 3.25
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEO1Q92859 1461 aa35.31■■■■□ 3.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.29■■■■□ 3.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.27■■■■□ 3.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.26■■■■□ 3.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.24■■■■□ 3.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLCH2O75038 1416 aa35.23■■■■□ 3.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FANCAO15360 1455 aa35.22■■■■□ 3.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.19■■■■□ 3.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.18■■■■□ 3.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIAM1Q13009 1591 aa35.16■■■■□ 3.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AKNAQ7Z591 1439 aa35.13■■■■□ 3.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PREX2Q70Z35 1606 aa35.12■■■■□ 3.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAP3K1Q13233 1512 aa35.1■■■■□ 3.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.09■■■■□ 3.21
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.06■■■■□ 3.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.06■■■■□ 3.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.06■■■■□ 3.2
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