RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 EEA1Q15075 1411 aa29.09■■■□□ 2.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRXQ9BXM0 1461 aa29.08■■■□□ 2.25
CCNDBP1-204ENST00000563065 JPH4Q96JJ6 628 aa29.03■■■□□ 2.24
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.01■■■□□ 2.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.97■■■□□ 2.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 SHROOM2Q13796 1616 aa28.95■■■□□ 2.23
CCNDBP1-204ENST00000563065 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.94■■■□□ 2.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARAP1Q96P48 1450 aa28.92■■■□□ 2.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.91■■■□□ 2.22
CCNDBP1-204ENST00000563065 IQGAP2Q13576 1575 aa28.86■■■□□ 2.21
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF21BO75037 1637 aa28.8■■■□□ 2.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.78■■■□□ 2.2
CCNDBP1-204ENST00000563065 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.71■■■□□ 2.19
CCNDBP1-204ENST00000563065 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 DISP1Q96F81 1524 aa28.69■■■□□ 2.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.67■■■□□ 2.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 GOLGA3Q08378 1498 aa28.67■■■□□ 2.18
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.6■■■□□ 2.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 P3H3Q8IVL6 736 aa28.59■■■□□ 2.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTPRGP23470 1445 aa28.59■■■□□ 2.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIAA0556O60303 1618 aa28.59■■■□□ 2.17
CCNDBP1-204ENST00000563065 SAMD9Q5K651 1589 aa28.45■■■□□ 2.15
CCNDBP1-204ENST00000563065 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.45■■■□□ 2.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.43■■■□□ 2.14
CCNDBP1-204ENST00000563065 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.38■■■□□ 2.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 UACAQ9BZF9 1416 aa28.38■■■□□ 2.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.36■■■□□ 2.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
CCNDBP1-204ENST00000563065 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.32■■■□□ 2.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.31■■■□□ 2.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.3■■■□□ 2.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCC2Q92887 1545 aa28.3■■■□□ 2.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCA8O94911 1581 aa28.27■■■□□ 2.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARID3CA6NKF2 412 aa28.24■■■□□ 2.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 CLIP1P30622 1438 aa28.2■■■□□ 2.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.19■■■□□ 2.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.15■■■□□ 2.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAPKBP1O60336 1514 aa28.15■■■□□ 2.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 CEP162Q5TB80 1403 aa28.13■■■□□ 2.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ASXL2Q76L83 1435 aa28.11■■■□□ 2.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP10BO94823 1461 aa28.09■■■□□ 2.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 FMN1Q68DA7 1419 aa28.09■■■□□ 2.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.07■■■□□ 2.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.04■■■□□ 2.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28■■■□□ 2.07
CCNDBP1-204ENST00000563065 DIP2BQ9P265 1576 aa27.99■■■□□ 2.07
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNH8Q96L42 1107 aa27.98■■■□□ 2.07
CCNDBP1-204ENST00000563065 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.96■■■□□ 2.07
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.93■■■□□ 2.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 HECW1Q76N89 1606 aa27.92■■■□□ 2.06
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.87■■■□□ 2.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.87■■■□□ 2.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 GLI2P10070 1586 aa27.84■■■□□ 2.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.83■■■□□ 2.05
CCNDBP1-204ENST00000563065 TSPOAP1O95153 1857 aa27.81■■■□□ 2.04
CCNDBP1-204ENST00000563065 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.75■■■□□ 2.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.74■■■□□ 2.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.74■■■□□ 2.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 CD109Q6YHK3 1445 aa27.73■■■□□ 2.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.69■■■□□ 2.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.66■■■□□ 2.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.66■■■□□ 2.02
CCNDBP1-204ENST00000563065 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.021e-13■□□□□ 8.8
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CCNDBP1-204ENST00000563065 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.61■■■□□ 2.01
CCNDBP1-204ENST00000563065 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.56■■■□□ 2
CCNDBP1-204ENST00000563065 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.55■■■□□ 2
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CCNDBP1-204ENST00000563065 TIAM1Q13009 1591 aa27.51■■■□□ 2
CCNDBP1-204ENST00000563065 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CCNDBP1-204ENST00000563065 KDM6BO15054 1643 aa27.48■■□□□ 1.99
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLCH2O75038 1416 aa27.48■■□□□ 1.99
CCNDBP1-204ENST00000563065 APLP2Q06481 763 aa27.44■■□□□ 1.98
CCNDBP1-204ENST00000563065 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.44■■□□□ 1.98
CCNDBP1-204ENST00000563065 FANCAO15360 1455 aa27.44■■□□□ 1.98
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.43■■□□□ 1.98
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAP3K1Q13233 1512 aa27.42■■□□□ 1.98
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.42■■□□□ 1.98
CCNDBP1-204ENST00000563065 NEO1Q92859 1461 aa27.41■■□□□ 1.98
CCNDBP1-204ENST00000563065 AKNAQ7Z591 1439 aa27.4■■□□□ 1.98
CCNDBP1-204ENST00000563065 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.39■■□□□ 1.98
CCNDBP1-204ENST00000563065 RAPGEF3O95398 923 aa27.38■■□□□ 1.97
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.37■■□□□ 1.97
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.36■■□□□ 1.97
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