RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562312.1

NOMO2-204, Transcript of NODAL modulator 2, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO2, Length 682 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO2-204ENST00000562312 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.98■■■■■ 4.15
NOMO2-204ENST00000562312 CUL7Q14999 1698 aa40.94■■■■■ 4.14
NOMO2-204ENST00000562312 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.88■■■■■ 4.14
NOMO2-204ENST00000562312 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.85■■■■■ 4.13
NOMO2-204ENST00000562312 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.66■■■■■ 4.1
NOMO2-204ENST00000562312 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.52■■■■■ 4.08
NOMO2-204ENST00000562312 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.5■■■■■ 4.07
NOMO2-204ENST00000562312 PTPRGP23470 1445 aa40.5■■■■■ 4.07
NOMO2-204ENST00000562312 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.47■■■■■ 4.07
NOMO2-204ENST00000562312 IQGAP2Q13576 1575 aa40.47■■■■■ 4.07
NOMO2-204ENST00000562312 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.46■■■■■ 4.07
NOMO2-204ENST00000562312 MAPKBP1O60336 1514 aa40.46■■■■■ 4.07
NOMO2-204ENST00000562312 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.44■■■■■ 4.06
NOMO2-204ENST00000562312 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.44■■■■■ 4.06
NOMO2-204ENST00000562312 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.43■■■■■ 4.06
NOMO2-204ENST00000562312 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
NOMO2-204ENST00000562312 DIP2BQ9P265 1576 aa40.28■■■■■ 4.04
NOMO2-204ENST00000562312 DISP1Q96F81 1524 aa40.28■■■■■ 4.04
NOMO2-204ENST00000562312 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.24■■■■■ 4.03
NOMO2-204ENST00000562312 ABCC2Q92887 1545 aa40.21■■■■■ 4.03
NOMO2-204ENST00000562312 UACAQ9BZF9 1416 aa40.18■■■■■ 4.02
NOMO2-204ENST00000562312 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.17■■■■■ 4.02
NOMO2-204ENST00000562312 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
NOMO2-204ENST00000562312 KIAA0556O60303 1618 aa40.09■■■■■ 4.01
NOMO2-204ENST00000562312 PRXQ9BXM0 1461 aa40.09■■■■■ 4.01
NOMO2-204ENST00000562312 ASXL2Q76L83 1435 aa40.07■■■■■ 4
NOMO2-204ENST00000562312 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.06■■■■■ 4
NOMO2-204ENST00000562312 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.02■■■■■ 4
NOMO2-204ENST00000562312 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.97■■■■□ 3.99
NOMO2-204ENST00000562312 GOLGA3Q08378 1498 aa39.97■■■■□ 3.99
NOMO2-204ENST00000562312 TSPOAP1O95153 1857 aa39.96■■■■□ 3.99
NOMO2-204ENST00000562312 GLI2P10070 1586 aa39.9■■■■□ 3.98
NOMO2-204ENST00000562312 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.9■■■■□ 3.98
NOMO2-204ENST00000562312 KDM6BO15054 1643 aa39.89■■■■□ 3.98
NOMO2-204ENST00000562312 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
NOMO2-204ENST00000562312 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
NOMO2-204ENST00000562312 EEA1Q15075 1411 aa39.78■■■■□ 3.96
NOMO2-204ENST00000562312 ABCA8O94911 1581 aa39.72■■■■□ 3.95
NOMO2-204ENST00000562312 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
NOMO2-204ENST00000562312 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
NOMO2-204ENST00000562312 WDR7Q9Y4E6 1490 aa39.7■■■■□ 3.95
NOMO2-204ENST00000562312 P3H3Q8IVL6 736 aa39.67■■■■□ 3.94
NOMO2-204ENST00000562312 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.65■■■■□ 3.94
NOMO2-204ENST00000562312 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.62■■■■□ 3.93
NOMO2-204ENST00000562312 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.61■■■■□ 3.93
NOMO2-204ENST00000562312 KCNH8Q96L42 1107 aa39.56■■■■□ 3.92
NOMO2-204ENST00000562312 SAMD9Q5K651 1589 aa39.5■■■■□ 3.91
NOMO2-204ENST00000562312 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
NOMO2-204ENST00000562312 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.48■■■■□ 3.91
NOMO2-204ENST00000562312 ARID3CA6NKF2 412 aa39.47■■■■□ 3.91
NOMO2-204ENST00000562312 CD109Q6YHK3 1445 aa39.47■■■■□ 3.91
NOMO2-204ENST00000562312 ATP10BO94823 1461 aa39.43■■■■□ 3.9
NOMO2-204ENST00000562312 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
NOMO2-204ENST00000562312 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.4■■■■□ 3.9
NOMO2-204ENST00000562312 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.39■■■■□ 3.9
NOMO2-204ENST00000562312 KIF21BO75037 1637 aa39.33■■■■□ 3.89
NOMO2-204ENST00000562312 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.32■■■■□ 3.89
NOMO2-204ENST00000562312 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.3■■■■□ 3.88
NOMO2-204ENST00000562312 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
NOMO2-204ENST00000562312 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
NOMO2-204ENST00000562312 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
NOMO2-204ENST00000562312 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.19■■■■□ 3.86
NOMO2-204ENST00000562312 ADGRL1O94910 1474 aa39.17■■■■□ 3.86
NOMO2-204ENST00000562312 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
NOMO2-204ENST00000562312 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.14■■■■□ 3.86
NOMO2-204ENST00000562312 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.13■■■■□ 3.85
NOMO2-204ENST00000562312 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.09■■■■□ 3.85
NOMO2-204ENST00000562312 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.08■■■■□ 3.85
NOMO2-204ENST00000562312 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.08■■■■□ 3.85
NOMO2-204ENST00000562312 NEO1Q92859 1461 aa38.98■■■■□ 3.83
NOMO2-204ENST00000562312 RAPGEF3O95398 923 aa38.9■■■■□ 3.82
NOMO2-204ENST00000562312 FMN1Q68DA7 1419 aa38.89■■■■□ 3.82
NOMO2-204ENST00000562312 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.87■■■■□ 3.81
NOMO2-204ENST00000562312 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
NOMO2-204ENST00000562312 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
NOMO2-204ENST00000562312 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.81■■■■□ 3.8
NOMO2-204ENST00000562312 AKNAQ7Z591 1439 aa38.75■■■■□ 3.79
NOMO2-204ENST00000562312 HECW1Q76N89 1606 aa38.74■■■■□ 3.79
NOMO2-204ENST00000562312 FANCAO15360 1455 aa38.74■■■■□ 3.79
NOMO2-204ENST00000562312 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
NOMO2-204ENST00000562312 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.72■■■■□ 3.79
NOMO2-204ENST00000562312 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
NOMO2-204ENST00000562312 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa38.7■■■■□ 3.79
NOMO2-204ENST00000562312 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.69■■■■□ 3.78
NOMO2-204ENST00000562312 PLCH2O75038 1416 aa38.62■■■■□ 3.77
NOMO2-204ENST00000562312 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
NOMO2-204ENST00000562312 RICTORQ6R327 1708 aa38.58■■■■□ 3.77
NOMO2-204ENST00000562312 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
NOMO2-204ENST00000562312 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.53■■■■□ 3.76
NOMO2-204ENST00000562312 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.52■■■■□ 3.76
NOMO2-204ENST00000562312 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.52■■■■□ 3.76
NOMO2-204ENST00000562312 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.51■■■■□ 3.76
NOMO2-204ENST00000562312 CLIP1P30622 1438 aa38.5■■■■□ 3.75
NOMO2-204ENST00000562312 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.5■■■■□ 3.75
NOMO2-204ENST00000562312 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.48■■■■□ 3.75
NOMO2-204ENST00000562312 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa38.46■■■■□ 3.75
NOMO2-204ENST00000562312 KIF14Q15058 1648 aa38.46■■■■□ 3.75
NOMO2-204ENST00000562312 PTPRMP28827 1452 aa38.45■■■■□ 3.75
NOMO2-204ENST00000562312 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.44■■■■□ 3.74
NOMO2-204ENST00000562312 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.44■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms