RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561637.5

NME3-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-202ENST00000561637 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.18■■■■■ 4.66
NME3-202ENST00000561637 ABCC10Q5T3U5 1492 aa44.1■■■■■ 4.65
NME3-202ENST00000561637 FAM69CQ0P6D2 419 aa44.09■■■■■ 4.65
NME3-202ENST00000561637 MAPKBP1O60336 1514 aa44.03■■■■■ 4.64
NME3-202ENST00000561637 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.02■■■■■ 4.64
NME3-202ENST00000561637 DIP2BQ9P265 1576 aa44.01■■■■■ 4.64
NME3-202ENST00000561637 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.99■■■■■ 4.63
NME3-202ENST00000561637 KIF27Q86VH2 1401 aa43.88■■■■■ 4.61
NME3-202ENST00000561637 IGF1RP08069 1367 aa43.87■■■■■ 4.61
NME3-202ENST00000561637 TSPOAP1O95153 1857 aa43.85■■■■■ 4.61
NME3-202ENST00000561637 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.82■■■■■ 4.61
NME3-202ENST00000561637 KDM6BO15054 1643 aa43.8■■■■■ 4.6
NME3-202ENST00000561637 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.73■■■■■ 4.59
NME3-202ENST00000561637 CUL7Q14999 1698 aa43.68■■■■■ 4.58
NME3-202ENST00000561637 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.56■■■■■ 4.56
NME3-202ENST00000561637 PTPRGP23470 1445 aa43.56■■■■■ 4.56
NME3-202ENST00000561637 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
NME3-202ENST00000561637 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
NME3-202ENST00000561637 ABCC2Q92887 1545 aa43.43■■■■■ 4.54
NME3-202ENST00000561637 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.41■■■■■ 4.54
NME3-202ENST00000561637 ASXL2Q76L83 1435 aa43.38■■■■■ 4.53
NME3-202ENST00000561637 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.37■■■■■ 4.53
NME3-202ENST00000561637 GLI2P10070 1586 aa43.33■■■■■ 4.53
NME3-202ENST00000561637 IQGAP2Q13576 1575 aa43.33■■■■■ 4.53
NME3-202ENST00000561637 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.31■■■■■ 4.52
NME3-202ENST00000561637 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.25■■■■■ 4.51
NME3-202ENST00000561637 DISP1Q96F81 1524 aa43.21■■■■■ 4.51
NME3-202ENST00000561637 UACAQ9BZF9 1416 aa43.21■■■■■ 4.51
NME3-202ENST00000561637 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.19■■■■■ 4.51
NME3-202ENST00000561637 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.18■■■■■ 4.5
NME3-202ENST00000561637 ADGRL1O94910 1474 aa43.17■■■■■ 4.5
NME3-202ENST00000561637 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.12■■■■■ 4.49
NME3-202ENST00000561637 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
NME3-202ENST00000561637 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
NME3-202ENST00000561637 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.1■■■■■ 4.49
NME3-202ENST00000561637 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.48
NME3-202ENST00000561637 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.02■■■■■ 4.48
NME3-202ENST00000561637 KIAA0556O60303 1618 aa42.97■■■■■ 4.47
NME3-202ENST00000561637 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.94■■■■■ 4.46
NME3-202ENST00000561637 PRXQ9BXM0 1461 aa42.92■■■■■ 4.46
NME3-202ENST00000561637 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.83■■■■■ 4.45
NME3-202ENST00000561637 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.82■■■■■ 4.45
NME3-202ENST00000561637 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.81■■■■■ 4.44
NME3-202ENST00000561637 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.67■■■■■ 4.42
NME3-202ENST00000561637 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.66■■■■■ 4.42
NME3-202ENST00000561637 CD109Q6YHK3 1445 aa42.63■■■■■ 4.42
NME3-202ENST00000561637 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.62■■■■■ 4.41
NME3-202ENST00000561637 ABCA8O94911 1581 aa42.62■■■■■ 4.41
NME3-202ENST00000561637 KCNH8Q96L42 1107 aa42.62■■■■■ 4.41
NME3-202ENST00000561637 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
NME3-202ENST00000561637 GOLGA3Q08378 1498 aa42.54■■■■■ 4.4
NME3-202ENST00000561637 KIF21BO75037 1637 aa42.49■■■■■ 4.39
NME3-202ENST00000561637 EEA1Q15075 1411 aa42.48■■■■■ 4.39
NME3-202ENST00000561637 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.41■■■■■ 4.38
NME3-202ENST00000561637 P3H3Q8IVL6 736 aa42.41■■■■■ 4.38
NME3-202ENST00000561637 ARID3CA6NKF2 412 aa42.33■■■■■ 4.37
NME3-202ENST00000561637 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.33■■■■■ 4.37
NME3-202ENST00000561637 SAMD9Q5K651 1589 aa42.28■■■■■ 4.36
NME3-202ENST00000561637 ATP10BO94823 1461 aa42.27■■■■■ 4.36
NME3-202ENST00000561637 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
NME3-202ENST00000561637 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.2■■■■■ 4.35
NME3-202ENST00000561637 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.17■■■■■ 4.34
NME3-202ENST00000561637 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.16■■■■■ 4.34
NME3-202ENST00000561637 PTPRMP28827 1452 aa42.11■■■■■ 4.33
NME3-202ENST00000561637 RAPGEF3O95398 923 aa42.1■■■■■ 4.33
NME3-202ENST00000561637 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.09■■■■■ 4.33
NME3-202ENST00000561637 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.07■■■■■ 4.33
NME3-202ENST00000561637 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.02■■■■■ 4.32
NME3-202ENST00000561637 FBXO41Q8TF61 875 aa42.02■■■■■ 4.32
NME3-202ENST00000561637 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.01■■■■■ 4.32
NME3-202ENST00000561637 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42■■■■■ 4.31
NME3-202ENST00000561637 NEO1Q92859 1461 aa42■■■■■ 4.31
NME3-202ENST00000561637 MADDQ8WXG6 1647 aa41.95■■■■■ 4.31
NME3-202ENST00000561637 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
NME3-202ENST00000561637 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
NME3-202ENST00000561637 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
NME3-202ENST00000561637 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
NME3-202ENST00000561637 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.87■■■■■ 4.29
NME3-202ENST00000561637 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
NME3-202ENST00000561637 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
NME3-202ENST00000561637 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.81■■■■■ 4.28
NME3-202ENST00000561637 RICTORQ6R327 1708 aa41.8■■■■■ 4.28
NME3-202ENST00000561637 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
NME3-202ENST00000561637 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.77■■■■■ 4.28
NME3-202ENST00000561637 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
NME3-202ENST00000561637 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.7■■■■■ 4.27
NME3-202ENST00000561637 AKNAQ7Z591 1439 aa41.68■■■■■ 4.26
NME3-202ENST00000561637 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.66■■■■■ 4.26
NME3-202ENST00000561637 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.64■■■■■ 4.26
NME3-202ENST00000561637 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.263e-22■□□□□ 10.7
NME3-202ENST00000561637 FANCAO15360 1455 aa41.63■■■■■ 4.25
NME3-202ENST00000561637 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
NME3-202ENST00000561637 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.6■■■■■ 4.25
NME3-202ENST00000561637 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.6■■■■■ 4.25
NME3-202ENST00000561637 HSPA2P54652 639 aa41.59■■■■■ 4.25
NME3-202ENST00000561637 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.58■■■■■ 4.25
NME3-202ENST00000561637 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.56■■■■■ 4.24
NME3-202ENST00000561637 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.55■■■■■ 4.24
NME3-202ENST00000561637 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.51■■■■■ 4.24
NME3-202ENST00000561637 FMN1Q68DA7 1419 aa41.47■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms